Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI

La resonancia magnética funcional en estado de reposo (rs-fMRI) es una de las técnicas más relevantes en exploración cerebral. No obstante, la misma es susceptible a muchos factores externos que pueden ocluir la señal de interés. En este orden de ideas, las imágenes rs-fMRI han sido estudiadas desde...

Full description

Autores:
Mera-Jiménez, Leonel
Ochoa-Gómez, John F.
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Instituto Tecnológico Metropolitano
Repositorio:
Repositorio ITM
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.itm.edu.co:20.500.12622/4645
Acceso en línea:
https://revistas.itm.edu.co/index.php/tecnologicas/article/view/1626
http://hdl.handle.net/20.500.12622/4645
Palabra clave:
Análisis de Componentes Independientes
Análisis de Componentes Principales
Redes Neuronales Convolucionales
reducción de ruido en fMRI
estado de reposo
Independent Component Analysis
Principal Component Analysis
Convolutional Neural Network
denoising in fMRI
resting-state
Rights
License
Copyright (c) 2020 TecnoLógicas
id RepoITM2_2f7a17dde9e56e901eb6e44a83fb1396
oai_identifier_str oai:repositorio.itm.edu.co:20.500.12622/4645
network_acronym_str RepoITM2
network_name_str Repositorio ITM
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Redes neuronales convolucionales para la clasificación de componentes independientes de rs-fMRI
title Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
spellingShingle Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
Análisis de Componentes Independientes
Análisis de Componentes Principales
Redes Neuronales Convolucionales
reducción de ruido en fMRI
estado de reposo
Independent Component Analysis
Principal Component Analysis
Convolutional Neural Network
denoising in fMRI
resting-state
title_short Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
title_full Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
title_fullStr Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
title_full_unstemmed Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
title_sort Convolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRI
dc.creator.fl_str_mv Mera-Jiménez, Leonel
Ochoa-Gómez, John F.
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Mera-Jiménez, Leonel
Ochoa-Gómez, John F.
dc.subject.spa.fl_str_mv Análisis de Componentes Independientes
Análisis de Componentes Principales
Redes Neuronales Convolucionales
reducción de ruido en fMRI
estado de reposo
topic Análisis de Componentes Independientes
Análisis de Componentes Principales
Redes Neuronales Convolucionales
reducción de ruido en fMRI
estado de reposo
Independent Component Analysis
Principal Component Analysis
Convolutional Neural Network
denoising in fMRI
resting-state
dc.subject.keywords.eng.fl_str_mv Independent Component Analysis
Principal Component Analysis
Convolutional Neural Network
denoising in fMRI
resting-state
description La resonancia magnética funcional en estado de reposo (rs-fMRI) es una de las técnicas más relevantes en exploración cerebral. No obstante, la misma es susceptible a muchos factores externos que pueden ocluir la señal de interés. En este orden de ideas, las imágenes rs-fMRI han sido estudiadas desde diferentes enfoques, existiendo un especial interés en las técnicas de eliminación de artefactos a través del Análisis de Componentes Independientes (ICA por sus siglas en inglés). El enfoque es una herramienta poderosa para la separación ciega de fuentes donde es posible eliminar los elementos asociados a ruido. Sin embargo, dicha eliminación está sujeta a la identificación o clasificación de las componentes entregadas por ICA. En ese sentido, esta investigación se centró en encontrar una estrategia alternativa para la clasificación de las componentes independientes. El problema se abordó en dos etapas. En la primera de ellas, se redujeron las componentes (volúmenes 3D) a imágenes mediante el Análisis de Componentes Principales (PCA por sus siglas en inglés) y con la obtención de los planos medios. Los métodos lograron una reducción de hasta dos órdenes de magnitud en peso de los datos y, además, demostraron conservar las características espaciales de las componentes independientes. En la segunda etapa, se usaron las reducciones para entrenar seis modelos de redes neuronales convolucionales. Las redes analizadas alcanzaron precisiones alrededor de 98 % en la clasificación e incluso se encontró una red con una precisión del 98.82 %, lo cual refleja la alta capacidad de discriminación de las redes neuronales convolucionales.
publishDate 2021
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-04-21T16:55:20Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-04-21T16:55:20Z
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2021-01-30
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.eng.fl_str_mv Articles
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.spa.spa.fl_str_mv Artículos
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.identifier.none.fl_str_mv https://revistas.itm.edu.co/index.php/tecnologicas/article/view/1626
10.22430/22565337.1626
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12622/4645
url https://revistas.itm.edu.co/index.php/tecnologicas/article/view/1626
http://hdl.handle.net/20.500.12622/4645
identifier_str_mv 10.22430/22565337.1626
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.none.fl_str_mv https://revistas.itm.edu.co/index.php/tecnologicas/article/view/1626
10.22430/22565337.1626
dc.relation.ispartofjournal.none.fl_str_mv TecnoLógicas
dc.rights.spa.fl_str_mv Copyright (c) 2020 TecnoLógicas
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv Copyright (c) 2020 TecnoLógicas
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Instituto Tecnológico Metropolitano - ITM
dc.source.none.fl_str_mv 2256-5337
0123-7799
dc.source.eng.fl_str_mv TecnoLógicas; Vol. 24 No. 50 (2021); e1626
dc.source.spa.fl_str_mv TecnoLógicas; Vol. 24 Núm. 50 (2021); e1626
institution Instituto Tecnológico Metropolitano
repository.name.fl_str_mv Repositorio Instituto Tecnológico Metropolitano de Medellín
repository.mail.fl_str_mv bdigital@metabiblioteca.com
_version_ 1837096913259724800
spelling Mera-Jiménez, LeonelOchoa-Gómez, John F.2021-04-21T16:55:20Z2021-04-21T16:55:20Z2021-01-30https://revistas.itm.edu.co/index.php/tecnologicas/article/view/162610.22430/22565337.1626http://hdl.handle.net/20.500.12622/4645La resonancia magnética funcional en estado de reposo (rs-fMRI) es una de las técnicas más relevantes en exploración cerebral. No obstante, la misma es susceptible a muchos factores externos que pueden ocluir la señal de interés. En este orden de ideas, las imágenes rs-fMRI han sido estudiadas desde diferentes enfoques, existiendo un especial interés en las técnicas de eliminación de artefactos a través del Análisis de Componentes Independientes (ICA por sus siglas en inglés). El enfoque es una herramienta poderosa para la separación ciega de fuentes donde es posible eliminar los elementos asociados a ruido. Sin embargo, dicha eliminación está sujeta a la identificación o clasificación de las componentes entregadas por ICA. En ese sentido, esta investigación se centró en encontrar una estrategia alternativa para la clasificación de las componentes independientes. El problema se abordó en dos etapas. En la primera de ellas, se redujeron las componentes (volúmenes 3D) a imágenes mediante el Análisis de Componentes Principales (PCA por sus siglas en inglés) y con la obtención de los planos medios. Los métodos lograron una reducción de hasta dos órdenes de magnitud en peso de los datos y, además, demostraron conservar las características espaciales de las componentes independientes. En la segunda etapa, se usaron las reducciones para entrenar seis modelos de redes neuronales convolucionales. Las redes analizadas alcanzaron precisiones alrededor de 98 % en la clasificación e incluso se encontró una red con una precisión del 98.82 %, lo cual refleja la alta capacidad de discriminación de las redes neuronales convolucionales.Resting state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) is one of the most relevant techniques in brain exploration. However, it is susceptible to many external factors that can occlude the signal of interest. In this order of ideas, rs-fMRI images have been studied adopting different approaches, with a particular interest in artifact removal techniques through Independent Component Analysis (ICA). Such an approach is a powerful tool for blind source separation, where elements associated with noise can be eliminated. Nevertheless, such removal is subject to the identification or classification of the components provided by the ICA. In that sense, this study focuses on finding an alternative strategy to classify the independent components. The problem was addressed in two stages. In the first one, the components (3D volumes) were reduced to images by Principal Component Analysis (PCA) and by obtaining the median planes. The methods achieved a reduction of up to two orders of magnitude in the weight of the data size, and they were shown to preserve the spatial characteristics of the independent components. In the second stage, the reductions were used to train six models of convolutional neural networks. The networks analyzed in this study reached accuracies around 98 % in classification, one of them even up to 98.82 %, which reflects the high discrimination capacity of convolutional neural networks.application/pdfspaInstituto Tecnológico Metropolitano - ITMhttps://revistas.itm.edu.co/index.php/tecnologicas/article/view/162610.22430/22565337.1626TecnoLógicasCopyright (c) 2020 TecnoLógicashttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0http://purl.org/coar/access_right/c_abf22256-53370123-7799TecnoLógicas; Vol. 24 No. 50 (2021); e1626TecnoLógicas; Vol. 24 Núm. 50 (2021); e1626Análisis de Componentes IndependientesAnálisis de Componentes PrincipalesRedes Neuronales Convolucionalesreducción de ruido en fMRIestado de reposoIndependent Component AnalysisPrincipal Component AnalysisConvolutional Neural Networkdenoising in fMRIresting-stateConvolutional Neural Network for the Classification of Independent Components of rs-fMRIRedes neuronales convolucionales para la clasificación de componentes independientes de rs-fMRIArtículosinfo:eu-repo/semantics/articleArticleshttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Publication20.500.12622/4645oai:dspace-itm.metabuscador.org:20.500.12622/46452025-06-20 16:16:44.058metadata.onlyhttps://dspace-itm.metabuscador.orgRepositorio Instituto Tecnológico Metropolitano de Medellínbdigital@metabiblioteca.com