Caracterización genética de la anemia de Fanconi en población colombiana, relación con el fenotipo clínico y citogenético
Anemia de Fanconi (AF) es causada por defectos en genes que participan en una ruta de reparación del genoma y en la regulación de procesos en el ciclo celular, de esta manera, diferentes aspectos del desarrollo y la sobrevida del individuo resultan afectados. AF es altamente heterogénea con fenotipo...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- doctoralThesis
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Pontificia Universidad Javeriana
- Repositorio:
- Repositorio Universidad Javeriana
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.javeriana.edu.co:10554/56614
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/10554/56614
- Palabra clave:
- Anemia de Fanconi
Enfermedad huérfana
Inestabilidad cromosómica
Genes FANC
Malformaciones congénitas
Fanconi anemia
Orphan disease
Chromosomal instability
FANC genes
Congenital malformations
Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas
Enfermedades raras - Colombia
Anemia - Colombia
Anormalidades humanas - Colombia
Hospital Universitario San Ignacio (Bogotá, Colombia)
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- embargoedAccess
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- Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
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Caracterización genética de la anemia de Fanconi en población colombiana, relación con el fenotipo clínico y citogenético Genetic characterization of Fanconi anemia in a colombian population, relationship with the clinical and cytogenetic phenotype |
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Caracterización genética de la anemia de Fanconi en población colombiana, relación con el fenotipo clínico y citogenético Moreno Niño, Olga María Anemia de Fanconi Enfermedad huérfana Inestabilidad cromosómica Genes FANC Malformaciones congénitas Fanconi anemia Orphan disease Chromosomal instability FANC genes Congenital malformations Doctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicas Enfermedades raras - Colombia Anemia - Colombia Anormalidades humanas - Colombia Hospital Universitario San Ignacio (Bogotá, Colombia) |
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Benítez Ortiz, Francisco Javier Surrallés Callonge, Jordi Vélez Varela, Patricia Zarante Montoya, Ignacio Manuel Briceño Balcazar, Ignacio Trujillo Quintero, Juan Pablo Urioste, Miguel Instituto de Genética Humana -Pontificia Universidad Javeriana |
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Anemia de Fanconi (AF) es causada por defectos en genes que participan en una ruta de reparación del genoma y en la regulación de procesos en el ciclo celular, de esta manera, diferentes aspectos del desarrollo y la sobrevida del individuo resultan afectados. AF es altamente heterogénea con fenotipos severos hasta fenotipos leves o ausentes que dificultan su diagnóstico. Característicamente los afectados presentan malformaciones congénitas, aplasia medular, predisposición a cáncer, e inestabilidad cromosómica. Debido al desconocimiento de la etiología de AF en Colombia, se propuso caracterizar individuos afectados por AF, identificados de pacientes con diagnóstico o sospecha clínica de la enfermedad. Se reclutaron 157 individuos con diagnóstico o sospecha clínica de AF, 19 con asociación VACTERL, 15 hermanos de casos AF y 34 individuos sanos. Se registraron las características clínicas y se aplicaron las pruebas citogenéticas de hipersensibilidad a diepoxibutano. La caracterización molecular de los casos hipersensibles (AF) fue realizada por MLPA para FANCA, NGS para panel de genes FANC y secuenciación Sanger. 43 casos fueron clasificados AF por prueba citogenética y en 24 se determinó el genotipo. 22(91.6%) tuvieron alteraciones en FANCA, 1(4.2%) en FANCB y 1(4.2%) en FANCD2. Las variantes identificadas fueron deleciones grandes, y mutaciones tipo INDEL y de cambio de base. 10(47.6%) variantes fueron nuevas. Las alteraciones clínicas más comunes fueron hematológicas, esqueléticas, cutáneas, faciales, y de talla. Este estudio informa por primera vez en Colombia sobre las características genéticas de la enfermedad confirmándose una prevalencia elevada de alteraciones en FANCA (91.6%), mayor al promedio informado para otras poblaciones. La mayoría de variantes fueron únicas, aunque se destaca una variante FANCA identificada en varios casos con procedencia regional común. |
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Colombia 2012-2018 Antioquia (Colombia) Atlántico (Colombia) Bolívar (Colombia) Cundinamarca (Colombia) Huila (Colombia) Norte de Santander (Colombia) Santander (Colombia) Valle del Cauca (Colombia) Cúcuta (Norte de Santander, Colombia) Barranquilla (Colombia) Bogotá (Colombia) Bucaramanga (Colombia) Cali (Colombia) Cartagena (Colombia) Cúcuta (Colombia) Ibagué (Colombia) Medellín (Colombia) |
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Caracterización genética de la anemia de Fanconi en población colombiana, relación con el fenotipo clínico y citogenéticoGenetic characterization of Fanconi anemia in a colombian population, relationship with the clinical and cytogenetic phenotypeMoreno Niño, Olga MaríaAnemia de FanconiEnfermedad huérfanaInestabilidad cromosómicaGenes FANCMalformaciones congénitasFanconi anemiaOrphan diseaseChromosomal instabilityFANC genesCongenital malformationsDoctorado en ciencias biológicas - Tesis y disertaciones académicasEnfermedades raras - ColombiaAnemia - ColombiaAnormalidades humanas - ColombiaHospital Universitario San Ignacio (Bogotá, Colombia)Anemia de Fanconi (AF) es causada por defectos en genes que participan en una ruta de reparación del genoma y en la regulación de procesos en el ciclo celular, de esta manera, diferentes aspectos del desarrollo y la sobrevida del individuo resultan afectados. AF es altamente heterogénea con fenotipos severos hasta fenotipos leves o ausentes que dificultan su diagnóstico. Característicamente los afectados presentan malformaciones congénitas, aplasia medular, predisposición a cáncer, e inestabilidad cromosómica. Debido al desconocimiento de la etiología de AF en Colombia, se propuso caracterizar individuos afectados por AF, identificados de pacientes con diagnóstico o sospecha clínica de la enfermedad. Se reclutaron 157 individuos con diagnóstico o sospecha clínica de AF, 19 con asociación VACTERL, 15 hermanos de casos AF y 34 individuos sanos. Se registraron las características clínicas y se aplicaron las pruebas citogenéticas de hipersensibilidad a diepoxibutano. La caracterización molecular de los casos hipersensibles (AF) fue realizada por MLPA para FANCA, NGS para panel de genes FANC y secuenciación Sanger. 43 casos fueron clasificados AF por prueba citogenética y en 24 se determinó el genotipo. 22(91.6%) tuvieron alteraciones en FANCA, 1(4.2%) en FANCB y 1(4.2%) en FANCD2. Las variantes identificadas fueron deleciones grandes, y mutaciones tipo INDEL y de cambio de base. 10(47.6%) variantes fueron nuevas. Las alteraciones clínicas más comunes fueron hematológicas, esqueléticas, cutáneas, faciales, y de talla. Este estudio informa por primera vez en Colombia sobre las características genéticas de la enfermedad confirmándose una prevalencia elevada de alteraciones en FANCA (91.6%), mayor al promedio informado para otras poblaciones. La mayoría de variantes fueron únicas, aunque se destaca una variante FANCA identificada en varios casos con procedencia regional común.Pontificia Universidad JaverianaHospital Universitario San IgnacioUniversidad Autónoma de BarcelonaGeneralFanconi Anemia (FA) is caused by defects in genes that participate in DNA repair pathways and in the regulation of cell cycle processes. Thus, different aspects of the development and survival of an individual are affected. Fanconi anemia is highly heterogeneous ranging from severe to mild phenotypes, which makes diagnosis difficult. Characteristically, those affected present congenital malformations, bone marrow aplasia, predisposition to cancer, and chromosome instability. Due to the unknown etiology in Colombia, it was proposed to characterize affected FA individuals, identified from patients with a diagnosis or from individuals with FA clinical suspicion. 157 individuals with diagnosis or clinical suspicion were recruited, 19 with VACTERL association, 15 siblings of FA cases, and 34 healthy individuals. Clinical manifestations were recorded and hypersensitivity to diepoxybutane cytogenetic tests was performed. Molecular characterization of hypersensitive FA cases was carried out by MLPA for FANCA, NGS for FANC gene panel, and Sanger sequencing. 43 cases were classified as FA by cytogenetic test, where the genotype was established for 24. 22(91.6%) with alterations in FANCA, 1(4.2%) in FANCB and 1 (4.2%) in FANCD2. Identified variants were large deletions and INDEL mutations and base substitution mutations. 10(47.6%) were new variants. The most prevalent clinical signs included hematological, skeletal, skin-related, face and height alterations. This study reports for the first time in Colombia on the genetic characteristics of the disease, confirming a high prevalence of FANCA (91.6%) alterations, greater than the average reported for other populations. Most variants were unique, although an identified FANCA variant in several cases with common regional origin was noteworthy.Doctor en Ciencias BiológicasDoctorado0000 0002 0826 6191https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/EnRecursoHumano/inicio.doPontificia Universidad JaverianaDoctorado en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasBenítez Ortiz, Francisco JavierSurrallés Callonge, JordiVélez Varela, PatriciaZarante Montoya, Ignacio ManuelBriceño Balcazar, IgnacioTrujillo Quintero, Juan PabloUrioste, MiguelInstituto de Genética Humana -Pontificia Universidad Javeriana2021-08-25T12:18:00Z2021-08-25T12:18:00Z2020-07-31http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionPDFapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10554/56614instname:Pontificia Universidad Javerianareponame:Repositorio Institucional - Pontificia Universidad Javerianarepourl:https://repository.javeriana.edu.cospaColombia2012-2018Antioquia (Colombia)Atlántico (Colombia)Bolívar (Colombia)Cundinamarca (Colombia)Huila (Colombia)Norte de Santander (Colombia)Santander (Colombia)Valle del Cauca (Colombia)Cúcuta (Norte de Santander, Colombia)Barranquilla (Colombia)Bogotá (Colombia)Bucaramanga (Colombia)Cali (Colombia)Cartagena (Colombia)Cúcuta (Colombia)Ibagué (Colombia)Medellín (Colombia)Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/embargoedAccessDe acuerdo con la naturaleza del uso concedido, la presente licencia parcial se otorga a título gratuito por el máximo tiempo legal colombiano, con el propósito de que en dicho lapso mi (nuestra) obra sea explotada en las condiciones aquí estipuladas y para los fines indicados, respetando siempre la titularidad de los derechos patrimoniales y morales correspondientes, de acuerdo con los usos honrados, de manera proporcional y justificada a la finalidad perseguida, sin ánimo de lucro ni de comercialización. De manera complementaria, garantizo (garantizamos) en mi (nuestra) calidad de estudiante (s) y por ende autor (es) exclusivo (s), que la Tesis o Trabajo de Grado en cuestión, es producto de mi (nuestra) plena autoría, de mi (nuestro) esfuerzo personal intelectual, como consecuencia de mi (nuestra) creación original particular y, por tanto, soy (somos) el (los) único (s) titular (es) de la misma. Además, aseguro (aseguramos) que no contiene citas, ni transcripciones de otras obras protegidas, por fuera de los límites autorizados por la ley, según los usos honrados, y en proporción a los fines previstos; ni tampoco contempla declaraciones difamatorias contra terceros; respetando el derecho a la imagen, intimidad, buen nombre y demás derechos constitucionales. Adicionalmente, manifiesto (manifestamos) que no se incluyeron expresiones contrarias al orden público ni a las buenas costumbres. En consecuencia, la responsabilidad directa en la elaboración, presentación, investigación y, en general, contenidos de la Tesis o Trabajo de Grado es de mí (nuestro) competencia exclusiva, eximiendo de toda responsabilidad a la Pontifica Universidad Javeriana por tales aspectos. Sin perjuicio de los usos y atribuciones otorgadas en virtud de este documento, continuaré (continuaremos) conservando los correspondientes derechos patrimoniales sin modificación o restricción alguna, puesto que, de acuerdo con la legislación colombiana aplicable, el presente es un acuerdo jurídico que en ningún caso conlleva la enajenación de los derechos patrimoniales derivados del régimen del Derecho de Autor. De conformidad con lo establecido en el artículo 30 de la Ley 23 de 1982 y el artículo 11 de la Decisión Andina 351 de 1993, "Los derechos morales sobre el trabajo son propiedad de los autores", los cuales son irrenunciables, imprescriptibles, inembargables e inalienables. En consecuencia, la Pontificia Universidad Javeriana está en la obligación de RESPETARLOS Y HACERLOS RESPETAR, para lo cual tomará las medidas correspondientes para garantizar su observancia.http://purl.org/coar/access_right/c_f1cfreponame:Repositorio Universidad Javerianainstname:Pontificia Universidad Javerianainstacron:Pontificia Universidad Javeriana2023-07-19T08:03:26Z |