Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis

El Potencial de Ionización (PI) de especies químicas es de vital importancia en técnicas de química analítica como Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization (MALDI). Específicamente, el cálculo de PI es usado rutinariamente en MALDI con matrices de Transferencia Electrónica (TE) para la selección...

Full description

Autores:
Padilla Jaramillo, Carlos A.
Díaz Sánchez, Luis M.
Combariza Montañez, Marianny Y.
Blanco Tirado, Cristian
Combariza Montañez, Aldo F.
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Universidad de los Llanos
Repositorio:
Repositorio Digital Universidad de los LLanos
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/2771
Acceso en línea:
https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/2771
https://doi.org/10.22579/20112629.676
Palabra clave:
Rights
openAccess
License
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
id Unillanos2_f425e218edc89dc2c1ed8908f32b4208
oai_identifier_str oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/2771
network_acronym_str Unillanos2
network_name_str Repositorio Digital Universidad de los LLanos
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
dc.title.translated.eng.fl_str_mv Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
title Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
spellingShingle Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
title_short Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
title_full Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
title_fullStr Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
title_full_unstemmed Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
title_sort Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS Analysis
dc.creator.fl_str_mv Padilla Jaramillo, Carlos A.
Díaz Sánchez, Luis M.
Combariza Montañez, Marianny Y.
Blanco Tirado, Cristian
Combariza Montañez, Aldo F.
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Padilla Jaramillo, Carlos A.
Díaz Sánchez, Luis M.
Combariza Montañez, Marianny Y.
Blanco Tirado, Cristian
Combariza Montañez, Aldo F.
description El Potencial de Ionización (PI) de especies químicas es de vital importancia en técnicas de química analítica como Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization (MALDI). Específicamente, el cálculo de PI es usado rutinariamente en MALDI con matrices de Transferencia Electrónica (TE) para la selección de la matriz adecuada para una familia de especies químicas. En este estudio se usaron metodologías computacionales basadas en la mecánica cuántica para determinar teóricamente los PIs de un grupo de pigmentos fotosensibles provenientes del fitoplancton y así poder realizar de forma más acertadael proceso de selección de matrices MALDI. Los PIs fueron determinados usando el teorema de Koopmans a través de Optimizaciones Geométricas y cálculos de Single Point Energy (SPE) con nivel de teoría Hartree-Fock de capa cerrada (RHF). Las estructuras de 24 pigmentos fueron optimizadas y sus PIs fueron determinados. Los valores de PIs calculados están muy cercanos a los reportes experimentales de la literatura, con un porcentaje de error absoluto aproximado de 3,7% y con cambios estructurales relacionados con las propiedades químicas de los pigmentos y IPs. A partir de nuestros resultados se sugiere que algunas matrices MALDI ET tales como la DCTB (PI = 8,5 eV) y CNPV-OCH3 (PI = 8,3 eV), podrían ser las más adecuadas para ser usadas con esta familia de compuestos.  
publishDate 2021
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-06-16 00:00:00
2022-06-13T17:42:47Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-06-16 00:00:00
2022-06-13T17:42:47Z
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2021-06-16
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de revista
dc.type.eng.fl_str_mv Journal Article
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.driver.eng.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.local.spa.fl_str_mv Sección Artículos
dc.type.local.eng.fl_str_mv Sección Articles
dc.type.version.eng.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coar.eng.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.content.eng.fl_str_mv Text
dc.type.coarversion.eng.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
status_str publishedVersion
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 0121-3709
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/2771
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.22579/20112629.676
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 2011-2629
dc.identifier.url.none.fl_str_mv https://doi.org/10.22579/20112629.676
identifier_str_mv 0121-3709
10.22579/20112629.676
2011-2629
url https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/2771
https://doi.org/10.22579/20112629.676
dc.language.iso.eng.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.bitstream.none.fl_str_mv https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/676/1217
dc.relation.citationedition.spa.fl_str_mv Núm. 1 , Año 2021 : Suplemento
dc.relation.citationendpage.none.fl_str_mv 23
dc.relation.citationissue.spa.fl_str_mv 1
dc.relation.citationstartpage.none.fl_str_mv 13
dc.relation.citationvolume.spa.fl_str_mv 25
dc.relation.ispartofjournal.spa.fl_str_mv Orinoquia
dc.rights.uri.eng.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.rights.accessrights.eng.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommons.eng.fl_str_mv Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial 4.0.
dc.rights.coar.eng.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial 4.0.
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.eng.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad de los Llanos
dc.source.eng.fl_str_mv https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/view/676
institution Universidad de los Llanos
bitstream.url.fl_str_mv https://dspace7-unillanos.metacatalogo.org/bitstreams/ca213ad3-b0b0-4c5e-984f-20185c48d0b2/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 4dbd48c0bc076599b87d87e849c3f668
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Universidad de Los Llanos
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unillanos.edu.co
_version_ 1812104661380890624
spelling Padilla Jaramillo, Carlos A.0402ef466fee8d64357f1dd35909b2a4300Díaz Sánchez, Luis M.3b51b2ad25f586ed2ccace8d5df1a9f4300Combariza Montañez, Marianny Y.64e1ff193968f9d3b03834f9e829b9e0300Blanco Tirado, Cristian3531bfcf56e755817e6d990be76a7109300Combariza Montañez, Aldo F.b2be7ed4529e9e150bac2a3f8c48d0cc3002021-06-16 00:00:002022-06-13T17:42:47Z2021-06-16 00:00:002022-06-13T17:42:47Z2021-06-160121-3709https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/277110.22579/20112629.6762011-2629https://doi.org/10.22579/20112629.676El Potencial de Ionización (PI) de especies químicas es de vital importancia en técnicas de química analítica como Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization (MALDI). Específicamente, el cálculo de PI es usado rutinariamente en MALDI con matrices de Transferencia Electrónica (TE) para la selección de la matriz adecuada para una familia de especies químicas. En este estudio se usaron metodologías computacionales basadas en la mecánica cuántica para determinar teóricamente los PIs de un grupo de pigmentos fotosensibles provenientes del fitoplancton y así poder realizar de forma más acertadael proceso de selección de matrices MALDI. Los PIs fueron determinados usando el teorema de Koopmans a través de Optimizaciones Geométricas y cálculos de Single Point Energy (SPE) con nivel de teoría Hartree-Fock de capa cerrada (RHF). Las estructuras de 24 pigmentos fueron optimizadas y sus PIs fueron determinados. Los valores de PIs calculados están muy cercanos a los reportes experimentales de la literatura, con un porcentaje de error absoluto aproximado de 3,7% y con cambios estructurales relacionados con las propiedades químicas de los pigmentos y IPs. A partir de nuestros resultados se sugiere que algunas matrices MALDI ET tales como la DCTB (PI = 8,5 eV) y CNPV-OCH3 (PI = 8,3 eV), podrían ser las más adecuadas para ser usadas con esta familia de compuestos.  The Ionization Potential (IP) of chemical species is of paramount importance for the Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization (MALDI) analyticaltechnique. Specifically, IPs are used in MALDI MS Electron Transfer (ET) as a parameter to select the matrix for a given family of chemical species. We useda quantum chemical methodology to computationally determine IPs for a set of photosensible phytoplanktonic pigments. These calculations could be used as a guide for MALDI matrix selection. IPs were determined using Koopman’s Theorem, via Geometry Optimization and Single Point Energy within the Restricted Closed-Shell Hartree-Fock (RHF) technique. Structures of a twenty-four set of pigments were geometrically optimized, and their IPsdetermined. Calculated IP’s are in close agreement to reported experimental IPs within an average 3.7% absolute error. Structural features of the chemical species studied have a closed relationship with their chemical properties and IP’s. Our results suggest that ET-MALDI matrices such as DCTB (IP = 8.5 eV) and CNPV-OCH3 (IP = 8.3 eV) could be more suitable to analyze these types of chemical species.application/pdfengUniversidad de los Llanoshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessEsta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial 4.0.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/view/676Photon Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS AnalysisPhoton Harvesting Molecules: Ionization Potential from Quantum Chemical Calculations of Phytoplanktonic Pigments for MALDI-MS AnalysisArtículo de revistaJournal Articleinfo:eu-repo/semantics/articleSección ArtículosSección Articlesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Texthttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/676/1217Núm. 1 , Año 2021 : Suplemento2311325OrinoquiaPublicationOREORE.xmltext/xml2657https://dspace7-unillanos.metacatalogo.org/bitstreams/ca213ad3-b0b0-4c5e-984f-20185c48d0b2/download4dbd48c0bc076599b87d87e849c3f668MD51001/2771oai:dspace7-unillanos.metacatalogo.org:001/27712024-04-17 16:40:49.177http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0metadata.onlyhttps://dspace7-unillanos.metacatalogo.orgRepositorio Universidad de Los Llanosrepositorio@unillanos.edu.co