Evaluación de la variabilidad fenotípica en Simarouba amara Aubl., mediante descriptores cualitativos y cuantitativos
Dentro de las estrategias de evaluación de especies forestales nativas por parte de la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA, se encuentra la caracterización fenotípica. Con el propósito de validar el uso de descriptores morfológicos y determinar la variabilidad fenotípica...
- Autores:
-
Castañeda-Garzón, Sandra Liliana
Argüelles-Cárdenas, Jorge H.
Zuluaga-Peláez, Jhon J.
Moreno-Barragán, Jessica
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad de los Llanos
- Repositorio:
- Repositorio Digital Universidad de los LLanos
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/3999
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/3999
https://doi.org/10.22579/20112629.656
- Palabra clave:
- cluster analysis
genetic resources
mountain damson/stavewood/bitterwood/paradise tree (machaco)
morphological characterisation
multiple correspondence analysis
principal component analysis
Análisis de componentes principales
análisis de conglomerados
análisis de correspondencias múltiples
caracterización morfológica
machaco
recursos genéticos
Análise de agrupamento
análise de componentes principais
análise de correspondência múltipla
caracterização morfológica
machaco
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cluster analysis genetic resources mountain damson/stavewood/bitterwood/paradise tree (machaco) morphological characterisation multiple correspondence analysis principal component analysis Análisis de componentes principales análisis de conglomerados análisis de correspondencias múltiples caracterización morfológica machaco recursos genéticos Análise de agrupamento análise de componentes principais análise de correspondência múltipla caracterização morfológica machaco recursos genéticos |
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Dentro de las estrategias de evaluación de especies forestales nativas por parte de la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA, se encuentra la caracterización fenotípica. Con el propósito de validar el uso de descriptores morfológicos y determinar la variabilidad fenotípica de la colección de trabajo del Centro de Investigación La Libertad ubicado en el piedemonte llanero (Villavicencio, Meta); se evaluaron 121 individuos de machaco (Simarouba amara Aubl.) de 6.2 años de edad, por medio de 34 descriptores de planta, hoja y fruto. Los datos cualitativos y cuantitativos se analizaron mediante análisis de correspondencias múltiples y análisis de componentes principales respectivamente, con el fin de reducir la dimensionalidad de los datos, seguido de análisis de conglomerados, utilizando el algoritmo de WARD para el agrupamiento de los individuos. Los resultados obtenidos permitieron identificar que el volumen de tronco presentó la mayor variabilidad (31.13%) y las variables cuantitativas asociadas al tamaño y diámetro de la copa, diámetro de fuste, volumen del tronco, longitud y ancho de la hoja, altura total y de copa presentaron las mayores correlaciones con los tres primeros componentes principales (57.82%). Se obtuvieron nueve conglomerados que reúnen el 95.73% de la variabilidad original y en los cuales se encontraron individuos potencialmente útiles con fines maderables, arboricultura y sistemas agroforestales. La forma del fuste, la altura de ramificación y de bifurcación, el tipo de corteza y el hábito de fructificación presentaron mínima variación en los individuos, contrario a la rectitud del fuste y la forma de la copa. |
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Los datos cualitativos y cuantitativos se analizaron mediante análisis de correspondencias múltiples y análisis de componentes principales respectivamente, con el fin de reducir la dimensionalidad de los datos, seguido de análisis de conglomerados, utilizando el algoritmo de WARD para el agrupamiento de los individuos. Los resultados obtenidos permitieron identificar que el volumen de tronco presentó la mayor variabilidad (31.13%) y las variables cuantitativas asociadas al tamaño y diámetro de la copa, diámetro de fuste, volumen del tronco, longitud y ancho de la hoja, altura total y de copa presentaron las mayores correlaciones con los tres primeros componentes principales (57.82%). Se obtuvieron nueve conglomerados que reúnen el 95.73% de la variabilidad original y en los cuales se encontraron individuos potencialmente útiles con fines maderables, arboricultura y sistemas agroforestales. La forma del fuste, la altura de ramificación y de bifurcación, el tipo de corteza y el hábito de fructificación presentaron mínima variación en los individuos, contrario a la rectitud del fuste y la forma de la copa. Phenotyping is one of the strategies used by Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) for evaluating native forest species. One hundred and twenty-one 6.2 year-old mountain damson/stavewood/bitterwood/paradise trees (Simarouba amara Aubl. commonly known as machaco in Colombia) were evaluated using 34 plant, leaf and fruit descriptors to validate the use of morphological descriptors and determine the phenotype variability of AGROSAVIA’s La Libertad Research Centre’s working collection. The centre is located in the foothills of Colombia’s eastern plains(Villavicencio, Meta). Multiple correspondence analysis (MCA) was used for analysing qualitative data and principal component analysis (PCA) for +data to reduce dataset dimensionality; this was followed by cluster analysis, using Ward's method (minimum variance method or Ward’s minimum - agglomerative algorithm) for hierarchical caraccluster analysis for grouping the trees. The results led to identifying that the wood volume descriptor had the greatest variability (31.13%) and thequantitative variables associated with crown size and diameter, stem diameter, trunk volume, leaf length and width, total and crown height had the greatest correlation with the first three components (57.82%). Nine clusters were obtained (accounting for 95.73% of original variability) and in which trees were found for timber, arboriculture and agroforestry system purposes. The trees’ stem shape, branch height and bifurcation, the type of bark and fruiting habits had minimum variation, contrary to the that found regarding stem straightness and crown shape. application/pdfspaUniversidad de los Llanoshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessEsta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial 4.0.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/view/656cluster analysisgenetic resourcesmountain damson/stavewood/bitterwood/paradise tree (machaco)morphological characterisationmultiple correspondence analysisprincipal component analysisAnálisis de componentes principalesanálisis de conglomeradosanálisis de correspondencias múltiplescaracterización morfológicamachacorecursos genéticosAnálise de agrupamentoanálise de componentes principaisanálise de correspondência múltiplacaracterização morfológicamachacorecursos genéticosEvaluación de la variabilidad fenotípica en Simarouba amara Aubl., mediante descriptores cualitativos y cuantitativosAssessment of phenotypic variability in Simarouba amara Aubl., through qualitative and quantitative descriptorsArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleJournal articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Texthttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/656/11877716725OrinoquiaPublicationOREORE.xmltext/xml2789https://repositorio.unillanos.edu.co/bitstreams/4f0cdfbb-33cb-45a9-b06a-aa8c3369df92/downloade408feccd26105ec37285bb84711c149MD51001/3999oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/39992024-07-25 13:15:07.498http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0metadata.onlyhttps://repositorio.unillanos.edu.coRepositorio Universidad de Los Llanosrepositorio@unillanos.edu.co |