Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?

Titulo en ingles: Pulmonary hypertension syndrome ¿does it have a genetic origin in broiler chickens?RESUMEN:  La identificación de por lo menos el 83 % de polimorfismos de nucleótido simple de tipo no sinónimo en líneas comerciales de alto rendimiento como el pollo para asadero, ponedoras y gallina...

Full description

Autores:
Moncaleano-Vega, Juana
Ariza, Fernando
Hernández, Aureliano
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2010
Institución:
Universidad de los Llanos
Repositorio:
Repositorio Digital Universidad de los LLanos
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/3576
Acceso en línea:
https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/3576
https://doi.org/10.22579/20112629.45
Palabra clave:
marcadores genéticos
SNPs
whole-genome shotgun
Gallus gallus
epidemiología genética
regresión logística
genetic markers
genetic epidemiology
logistic regression
Rights
openAccess
License
Orinoquia - 2014
id Unillanos2_ac0272676fb000b3e2a9050299f4b6a7
oai_identifier_str oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/3576
network_acronym_str Unillanos2
network_name_str Repositorio Digital Universidad de los LLanos
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
dc.title.translated.eng.fl_str_mv Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
title Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
spellingShingle Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
marcadores genéticos
SNPs
whole-genome shotgun
Gallus gallus
epidemiología genética
regresión logística
genetic markers
genetic epidemiology
logistic regression
title_short Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
title_full Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
title_fullStr Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
title_full_unstemmed Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
title_sort Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?
dc.creator.fl_str_mv Moncaleano-Vega, Juana
Ariza, Fernando
Hernández, Aureliano
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Moncaleano-Vega, Juana
Ariza, Fernando
Hernández, Aureliano
dc.subject.spa.fl_str_mv marcadores genéticos
SNPs
whole-genome shotgun
Gallus gallus
epidemiología genética
regresión logística
genetic markers
genetic epidemiology
logistic regression
topic marcadores genéticos
SNPs
whole-genome shotgun
Gallus gallus
epidemiología genética
regresión logística
genetic markers
genetic epidemiology
logistic regression
description Titulo en ingles: Pulmonary hypertension syndrome ¿does it have a genetic origin in broiler chickens?RESUMEN:  La identificación de por lo menos el 83 % de polimorfismos de nucleótido simple de tipo no sinónimo en líneas comerciales de alto rendimiento como el pollo para asadero, ponedoras y gallinas de plumaje sedoso, proporcionan información acerca de la tasa de variación en la secuencia de nucleótidos del genoma del pollo, la cual ocurre cada 5 x 10-3 nucleótidos. Es importante encontrar asociaciones entre dichas variantes con características fenotípicas de interés como la susceptibilidad o la resistencia a enfermedades y tal es el caso de la hipertensión arterial pulmonar, síndrome ampliamente reconocido en pollos de engorde, que ocasiona hasta un 30 % de la mortalidad en líneas comerciales de rápido crecimiento. Un paso hacia la identificación de estas asociaciones es el empleo tanto de herramientas moleculares como de modelos estadísticos que permitan obtener en corto tiempo los resultados necesarios para iniciar un plan adecuado de selección y mejoramientoEl presente documento describe la metodología de secuenciación del genoma del pollo doméstico, el uso de técnicas de identificación de polimorfismos de genes candidatos en pollos comerciales susceptibles al Síndrome de Hipertensión Pulmonar y las implicaciones actuales generadas por la implementación de técnicas de genética molecular en busca de un mayor conocimiento del genoma de las especies domésticas nativasPalabras clave: marcadores genéticos, SNPs, whole-genome shotgun, Gallus gallus, epidemiología genética, regresión logísticaABSTRACT:  At least 83 % of non-synonimous polymorphisms which are of the simple nucleotide type have been identified in high performance commercial birds, such as Broiler, Layer and Silkie. This has allowed the collection of information about the variation rate in the nucleotide sequence in the chicken genome. The abovementioned variation occurs at 5 x 10-3 intervals in the nucleotide chain. It is important to look for associations among those variations, related to key phenotype characters, such as disease resistance or susceptibility. An example is the pulmonary arterial hypertension in meat-type broilers, a syndrome which accounts for nearly 30 % of mortalityA step toward the identification of these associations has been implemented by using both molecular technolo- gies and statistical models that allow the generation of quick results useful in the implementation of breeding and selection programsThe present document describes both, the methodology for sequencing the domestic chicken genome and the polymorphism identification within candidate genes of susceptible broiler chickens prone to develop hypoxic pulmonary hypertension. Current implications to increase the knowledge about native species genome related to the use of molecular genetics are also discussedKey Words: genetic markers, SNPs, whole-genome shotgun, Gallus gallus, genetic epidemiology, logistic regression
publishDate 2010
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2010-01-01
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2011-01-01T00:00:00Z
2024-07-25T18:12:56Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2011-01-01T00:00:00Z
2024-07-25T18:12:56Z
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de revista
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.local.eng.fl_str_mv Journal article
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
status_str publishedVersion
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 0121-3709
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/3576
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.22579/20112629.45
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 2011-2629
dc.identifier.url.none.fl_str_mv https://doi.org/10.22579/20112629.45
identifier_str_mv 0121-3709
10.22579/20112629.45
2011-2629
url https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/3576
https://doi.org/10.22579/20112629.45
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.bitstream.none.fl_str_mv https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/45/74
https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/45/75
https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/45/473
dc.relation.citationendpage.none.fl_str_mv 89
dc.relation.citationissue.spa.fl_str_mv 1
dc.relation.citationstartpage.none.fl_str_mv 79
dc.relation.citationvolume.spa.fl_str_mv 15
dc.relation.ispartofjournal.spa.fl_str_mv Orinoquia
dc.rights.spa.fl_str_mv Orinoquia - 2014
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv Orinoquia - 2014
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/msword
application/pdf
text/html
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad de los Llanos
dc.source.spa.fl_str_mv https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/view/45
institution Universidad de los Llanos
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unillanos.edu.co/bitstreams/5cb687f7-a137-4331-b5cc-610a7d058acd/download
bitstream.checksum.fl_str_mv d7c9bf6db79feacc0eac39968e9fad2d
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Universidad de Los Llanos
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unillanos.edu.co
_version_ 1818111645233184768
spelling Moncaleano-Vega, JuanaAriza, FernandoHernández, Aureliano2011-01-01T00:00:00Z2024-07-25T18:12:56Z2011-01-01T00:00:00Z2024-07-25T18:12:56Z2010-01-010121-3709https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/357610.22579/20112629.452011-2629https://doi.org/10.22579/20112629.45Titulo en ingles: Pulmonary hypertension syndrome ¿does it have a genetic origin in broiler chickens?RESUMEN:  La identificación de por lo menos el 83 % de polimorfismos de nucleótido simple de tipo no sinónimo en líneas comerciales de alto rendimiento como el pollo para asadero, ponedoras y gallinas de plumaje sedoso, proporcionan información acerca de la tasa de variación en la secuencia de nucleótidos del genoma del pollo, la cual ocurre cada 5 x 10-3 nucleótidos. Es importante encontrar asociaciones entre dichas variantes con características fenotípicas de interés como la susceptibilidad o la resistencia a enfermedades y tal es el caso de la hipertensión arterial pulmonar, síndrome ampliamente reconocido en pollos de engorde, que ocasiona hasta un 30 % de la mortalidad en líneas comerciales de rápido crecimiento. Un paso hacia la identificación de estas asociaciones es el empleo tanto de herramientas moleculares como de modelos estadísticos que permitan obtener en corto tiempo los resultados necesarios para iniciar un plan adecuado de selección y mejoramientoEl presente documento describe la metodología de secuenciación del genoma del pollo doméstico, el uso de técnicas de identificación de polimorfismos de genes candidatos en pollos comerciales susceptibles al Síndrome de Hipertensión Pulmonar y las implicaciones actuales generadas por la implementación de técnicas de genética molecular en busca de un mayor conocimiento del genoma de las especies domésticas nativasPalabras clave: marcadores genéticos, SNPs, whole-genome shotgun, Gallus gallus, epidemiología genética, regresión logísticaABSTRACT:  At least 83 % of non-synonimous polymorphisms which are of the simple nucleotide type have been identified in high performance commercial birds, such as Broiler, Layer and Silkie. This has allowed the collection of information about the variation rate in the nucleotide sequence in the chicken genome. The abovementioned variation occurs at 5 x 10-3 intervals in the nucleotide chain. It is important to look for associations among those variations, related to key phenotype characters, such as disease resistance or susceptibility. An example is the pulmonary arterial hypertension in meat-type broilers, a syndrome which accounts for nearly 30 % of mortalityA step toward the identification of these associations has been implemented by using both molecular technolo- gies and statistical models that allow the generation of quick results useful in the implementation of breeding and selection programsThe present document describes both, the methodology for sequencing the domestic chicken genome and the polymorphism identification within candidate genes of susceptible broiler chickens prone to develop hypoxic pulmonary hypertension. Current implications to increase the knowledge about native species genome related to the use of molecular genetics are also discussedKey Words: genetic markers, SNPs, whole-genome shotgun, Gallus gallus, genetic epidemiology, logistic regressionapplication/mswordapplication/pdftext/htmlspaUniversidad de los LlanosOrinoquia - 2014https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/view/45marcadores genéticosSNPswhole-genome shotgunGallus gallusepidemiología genéticaregresión logísticagenetic markersgenetic epidemiologylogistic regressionSíndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?Síndrome de hipertensión pulmonar ¿un origen genético en pollos de engorde?Artículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleJournal articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Texthttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/45/74https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/45/75https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/download/45/4738917915OrinoquiaPublicationOREORE.xmltext/xml2630https://repositorio.unillanos.edu.co/bitstreams/5cb687f7-a137-4331-b5cc-610a7d058acd/downloadd7c9bf6db79feacc0eac39968e9fad2dMD51001/3576oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/35762024-07-25 13:12:56.257https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Orinoquia - 2014metadata.onlyhttps://repositorio.unillanos.edu.coRepositorio Universidad de Los Llanosrepositorio@unillanos.edu.co