Caracterización genética del genoma completo de una cepa del virus Chikungunya circulante en Brasil

El virus Chikungunya (CHIKV) es un virus de ARN monocatenario de sentido positivo que pertenece al género Alphavirus de la familia Togaviridae. Se transmite principalmente por mosquitos Aedes aegypti y albopictus. Su genoma codifica cuatro proteínas no estructurales (NSP 1-4) y tres proteínas estruc...

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Autores:
Villarreal Julio, Rafael Guillermo
Yepes-Blandón, Jonny Andrés
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2023
Institución:
Universidad de los Llanos
Repositorio:
Repositorio Digital Universidad de los LLanos
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.unillanos.edu.co:001/4050
Acceso en línea:
https://repositorio.unillanos.edu.co/handle/001/4050
https://doi.org/10.22579/20112629.789
Palabra clave:
Emerging alphaviruses
Chikungunya fever
Genome
genoma sequencing
Vírus alfa emergentes
febre de Chikungunya
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Four lineages of this virus have been identified, namely the West African, East African, Central and South African (ECSA), Asian (AL), and Indian Ocean Lineages (IOL). CHIKV is an endemic arbovirus circulating in 51 countries in the Americas. Clinical manifestations attributed to it include high fever, rash, myalgia, and episodes of arthralgia, which subsequently lead to chronic pain and disability, especially in the joints. Sequencing the complete genome of the Chikungunya virus is essential to understand its biology, evolution, and spread and to develop effective strategies for prevention, diagnosis, and treatment. This information is crucial for combating the disease and minimizing its impact on public health. For these reasons, the complete genome of the Chikungunya virus strain br33, identified in the northeastern city of Recife, in the state of Pernambuco, Brazil, was sequenced. The genome has a size of 11,601 nucleotides and contains coding regions for two polyproteins. A phylogenetic analysis indicates that the recent Brazilian strain of CHIKV belongs to the East, Central, and South African lineage (ECSA). This phylogenetic identification is important because this particular genotype has been associated with greater damage and clinical severity. Until 2016, the CHIKV virus was directly associated with travel, and its transmission was limited. Subsequently, the largest outbreak occurred in the state associated with the introduction of a new ECSA lineage, as identified in this study. It is highly likely that new CHIKV outbreaks will occur in the near future due to the abundance of competent vectors in Brazil and a susceptible population, exposing more than 11 million inhabitants to an increasing risk of infection.application/pdfengUniversidad de los LlanosOrinoquia - 2023https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessEsta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0.http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://orinoquia.unillanos.edu.co/index.php/orinoquia/article/view/789Emerging alphavirusesChikungunya feverGenomegenoma sequencingVírus alfa emergentesfebre de ChikungunyagenomasequenciamentoAlfavirus emergentesFiebre ChikungunyaGenomaSecuenciaciónCaracterización genética del genoma completo de una cepa del virus Chikungunya circulante en BrasilGenetic characterization of the complete genome of a strain of Chikungunya virus circulating in BrazilArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleJournal articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Texthttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Alguridi HI, Alzahrani F, Altayb HN, Almalki S, Zaki E, Algarni S, Assiri A, Memish ZA. 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