Plataforma web de telepatología para la navegación eficiente de láminas virtuales de histopatología como apoyo a la enseñanza, investigación y trabajo colaborativo en cáncer
Incluye figuras y tablas
- Autores:
-
Diaz Mejia, Darwin Sebastian
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Universidad de los Llanos
- Repositorio:
- Repositorio Digital Universidad de los LLanos
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
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- Acceso en línea:
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- Palabra clave:
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Este trabajo tiene como base la primera versión del microscopio virtual Web desarrollado por el grupo CIM@LAB 1 de la Universidad Nacional de Colombia. A partir de esa versión, se realizó un análisis de los diferentes módulos del proyecto entregado, se estudiaron las tecnologías utilizadas y se identificó la arquitectura general del sistema. La plataforma Web de telepatología, presenta un conjunto de herramientas adicionales para el manejo de las anotaciones sobre las láminas virtuales de histopatología cuyo objetivo es el apoyo a la enseñanza, investigación y trabajo colaborativo en el área del cáncer. Entre el conjunto de herramientas podemos hallar la gestión de anotaciones desde una base de datos, implementación de perfiles y roles para el control de los usuarios. Además presenta mejoras en el módulo del decodificador de imágenes del formato JPEG2000 (JasPer), esta mejora permite dar un mayor soporte para el acceso a la navegación de las láminas virtuales de histopatología por múltiples usuarios. Asimismo se implementaron y se ejecutaron dos pruebas para medir el desempeño de la plataforma, la primera constó de navegaciones concurrentes simuladas y la segunda constó del manejo por parte de usuarios reales.This document presents the development of a telepathology Web platform for the efficient navigation of whole-slide histopathology images as support for teaching, research and collaborative work in cancer. This work is based on the first version of the Web virtual microscope developed by CIM@LAB research group from the Universidad Nacional de Colombia. Starting from that version, an analysis of the different modules of the project delivered was made, the technologies used were studied and the general architecture of the system was identified. The Telepathology Web platform presents a set of additional tools for the management of annotations on whole-slide histopathology images to support teaching, research and collaborative work in the area of cancer. Among the toolset we can find the management of annotations from a database, implementation of profiles and roles for the control of the users. In addition, it presents improvements in the module of the image decoder of JPEG2000 format (JasPer), this improvement allows to give a greater support for he access to the navigation of the whole-slide histopathology images by multiple users. Also, two tests were implemented and executed to measure the performance of the platform, the first consisted of concurrent simulated navigations and the second consisted of usability by real users.Introducción. -- Objetivos. -- Objetivo general. -- Objetivos específicos. -- Marco referencial. -- Contextual. -- Cáncer. -- Histopatología. -- Marco teórico. -- Láminas virtuales de histopatología (Whole Slide Images, WSI). -- Códecs JPEG2000. -- Patología digital. -- Telepatología. -- Marco legal. -- Bioética y anonimización. -- Telemedicina. -- Datos personales. -- Metodología. -- Desarrollo del modelo general. -- Construcción de la lista de funcionalidades. -- Planeación por funcionalidad. -- Diseño y construcción por funcionalidad. -- Implementación de la librería JasPer en su versión actual estable para el módulo decodificador. -- Diseño de experimentos de concurrencia. -- Diseño de experimentos de usabilidad. -- Diseño e implementación de base de datos. -- Módulo de autenticación y registro de usuarios. -- Módulo de perfil de usuarios. -- Gestión de anotaciones desde una base de datos. -- Resultados. -- Fase de experimentación de concurrencia. -- Fase de experimentación de usabilidad. -- Plataforma web de telepatología. -- Conclusiones. -- Referencias y bibliografía.PregradoIngeniero(a) de SistemasIngeniería de Sistemas48 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los LlanosFacultad de Ciencias Básicas e IngenieríaVillavicencioDerechos Reservados - Universidad de los Llanos, 2018https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Plataforma web de telepatología para la navegación eficiente de láminas virtuales de histopatología como apoyo a la enseñanza, investigación y trabajo colaborativo en cáncerTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85C. Pardo and R. Cendales, Incidencia, mortalidad y prevalencia de Cáncer en Colombia 2007-2011, vol. 1. 2015.C. Pardo, E. de Vries, J. M. Duarte, and M. Piñeros, “Cáncer en la Unidad de Cáncer del Hospital Departamental de Villavicencio, Colombia, 2006-2008,” Rev. Colomb. Cancerol., vol. 19, no. 3, pp. 125–132, Jul. 2015.L. Velásquez, G. Carrasquilla, and S. Roca-Garavito, “Equidad en el acceso al tratamiento para el cáncer de mama en Colombia,” Salud Publica Mex., vol. 51, no. 7, pp. S246–S253, 2009.J. Amaya et al., “ESTUDIO DE DISPONIBILIDAD Y DISTRIBUCIÓN DE LA OFERTA DE MÉDICOS ESPECIALISTAS, EN SERVICIOS DE ALTA Y MEDIANA COMPLEJIDAD EN COLOMBIA,” Recur. humanos salud en Colomb. Balanc. competencias y Prospect., pp. 1–135, 2013.J. Arevalo and A. 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