Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania

78 Páginas. Recurso Electrónico

Autores:
Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2013
Institución:
Universidad del Tolima
Repositorio:
RIUT: Repositorio U. Tolima
Idioma:
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OAI Identifier:
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Acceso en línea:
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Palabra clave:
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spelling Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana707a0952-080d-4001-a41d-8717112364c7-12014-08-20T19:30:31Z2014-08-20T19:30:31Z2013-0878 Páginas. Recurso ElectrónicoEl alineamiento múltiple del interactoma de las tres especies de Leishmania (L. major, L. braziliensis y L. infantum) permitió identificar proteínas ortólogas presentes en los proteomas de estas tres especies y 256 interacciones conservadas tanto en el alineamiento múltiple como en la red original de cada una de estas tres especies, donde la mayoría de las proteínas que integran estas interacciones conservadas son dineínas de cadena pesada, las cuales participan en procesos como en el movimiento basado en microtúbulos, motilidad ciliar o flagelar y ATP catabólico. Otras proteínas encontradas fueron las metalopeptidasas de zinc dependientes de ATP, las cuales no tienen homología con las del ser humano y son importantes para la supervivencia del amastigote, estadio en el cual se produce la leishmaniasis en el ser humano; razón por la cual se podrían proponer como posibles blancos terapéuticos. Y las proteínas de mantenimiento de minicromosomas (MCM), las cuales hacen parte del proceso biológico de replicación del ADN; sugiriendo a estas tres proteínas como el grupo principal para caracterizar y explorar como dianas terapéuticas.ABSTRACT. Interactome Multiple alignment of the three species of Leishmania (L. major, L. braziliensis and L. infantum) identified orthologous proteins present in the proteome of these three species and 256 conserved interactions both multiple alignment as in the original network of each these three species, where most of the proteins that make these conserved interactions are dyneins heavy chain, which are involved in processes such as the microtubule-based movement, ciliary or flagellar motility and ATP catabolic. Other proteins were found ATP-dependent zinc metallopeptidase, which have no similarity to those of humans and are important for the survival of the amastigote, stage where leishmaniasis occurs in humans; reason could proposed as potential therapeutic targets. And minichromosome maintenance proteins (MCM), which are part of the biological process of DNA replication; suggesting these three proteins as the primary group to characterize and explore as therapeutic targets.INTRODUCCIÓN 16 1. DEFINICIÓN DEL PROBLEMA 19 2. JUSTIFICACIÓN 21 3. OBJETIVOS 23 3.1 OBJETIVO GENERAL 23 3.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS 23 4. DISEÑO METODOLÓGICO 24 4.1 INTERACTOMAS DE TRES ESPECIES DE Leishmania (L.major, L.infantum y L.braziliensis) 24 4.2 COMPARACIÓN DEL PROTEOMA DE LAS TRES ESPECIES DE Leishmania 24 4.3 ALINEAMIENTO DE LOS INTERACTOMAS DE LAS TRES ESPECIES DE Leishmania 25 4.3.1 Pinalog 25 4.3.2 Isorank 25 4.4 DETECCIÓN DE INTERACCIONES CONSERVADAS ENTRE LOS TRES INTERACTOMAS 26 4.5 ANÁLISIS FUNCIONAL DE REDES COMPARTIDAS 26 5. MARCO REFERENCIAL 28 5.1 LEISHMANIA.28 5.1.1 Ciclo de vida de Leishmania sp 29 5.1.2 Agente etiológico de la leishmaniasis 31 5.1.3 Vectores 33 5.1.4 Reservorios 34 5.1.5 Distribución geográfica 36 5.1.6 Manifestaciones clínicas 37 5.1.6.1 Leishmaniasis cutánea (LC) 38 5.1.6.2 Leishmaniasis mucosa (LM) 41 5.1.6.3 Leishmaniasis Visceral (LV) 42 5.2 REDES DE INTERACCIÓN DE PROTEÍNAS 44 5.2.1 Predicción computacional de interacciones proteína-proteína 46 5.2.2 Comparación de Redes de Interacción de proteínas 47 5.2.2.1 Modos de métodos comparativos de redes 49 5.3 ALGORITMOS UTILIZADOS EN LA COMPARACIÓN DE REDES DE INTERACCIÓN DE PROTEÍNAS DE TRES ESPECIES DE Leishmania 50 5.3.1 Pinalog 50 5.3.2 Isorank 53 5.4 CYTOSCAPE 54 6. RESULTADOS 55 6.1 DETECCIÓN DE INTERACCIONES CONSERVADAS EN LAS TRES ESPECIES DE Leishmania 55 6.2 ANÁLISIS FUNCIONAL DE REDES COMPARTIDA 58 7. DISCUSIÓN 62 8. CONCLUSIONES 66 9. RECOMENDACIONES 68 REFERENCIAS 69application/pdfBenavides Cerquera, Jennyfer Dahiana. Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmanía. 78 h. 2013. Ibagué : Universidad del Tolima, 2013. <http://repository.ut.edu.co/handle/001/1083>T 0701 234 CD3221CD3221https://repository.ut.edu.co/handle/001/1083spaIbague : Universidad del Tolima, 2013.Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia (CCBY-NC-SA 2.5 CO)http://www.creativecommons.org/licenses by-nc/2.5/co/http://purl.org/coar/access_right/c_abf2AlineamientoInteractomaLeishmaniaDineinaMCMMetalopeptidasaAlignmentInteractomeLeishmaniaDyneinMetallopeptidaseFacultad de Ciencias, Programa de BiologíaMuskus, Carlos Enrique (Director)PregradoBiólogoAnálisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de LeishmaniaTrabajo de grado - PregradoTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fPublicationORIGINALRIUT-AAA-spa-2013-Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania.pdfRIUT-AAA-spa-2013-Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania.pdfapplication/pdf1998158https://repository.ut.edu.co/bitstreams/90b8b94b-271a-4055-859e-094961108e11/download86af466f6351a84f3be69eb74db33bc7MD51RIUT-AAA-spa-2013-Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana.pdfRIUT-AAA-spa-2013-Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana.pdfapplication/pdf247563https://repository.ut.edu.co/bitstreams/ebd8844a-fbaa-4a55-8fa5-d25bc71c47db/download57d860616fa109d3727d154e1157042dMD56CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849https://repository.ut.edu.co/bitstreams/91a32430-9837-44de-b014-2f198bf2c718/download4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52license_textlicense_texttext/html; charset=utf-821936https://repository.ut.edu.co/bitstreams/be529c12-42e8-4568-93f8-81bb5d7a6897/download9833653f73f7853880c94a6fead477b1MD53license_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-823148https://repository.ut.edu.co/bitstreams/0fa448a4-0d72-43a0-a098-e82fa1c99b71/download9da0b6dfac957114c6a7714714b86306MD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8227https://repository.ut.edu.co/bitstreams/d87c1b79-9937-405b-be76-3635c43b57ae/download127f1942dfbe07f43e8227b660620c70MD55TEXTRIUT-AAA-spa-2013-Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania.pdf.txtRIUT-AAA-spa-2013-Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania.pdf.txtExtracted texttext/plain112302https://repository.ut.edu.co/bitstreams/b321f6e2-acd0-4816-a2b3-b35e4d3cc4d7/downloadbb52873c82b38b5eb170398c7e893b71MD57RIUT-AAA-spa-2013-Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana.pdf.txtRIUT-AAA-spa-2013-Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana.pdf.txtExtracted texttext/plain3229https://repository.ut.edu.co/bitstreams/43b04c97-3dcd-4185-b87f-9722d2d27781/downloada227cbd134b3a6a289c6dbc6c2a56bc2MD58THUMBNAILRIUT-AAA-spa-2013-Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania.pdf.jpgRIUT-AAA-spa-2013-Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6306https://repository.ut.edu.co/bitstreams/502c2ea5-2476-4bcf-a57d-fb8a7dff5204/download8e5201079ca2f02a87fa32a212087dddMD59RIUT-AAA-spa-2013-Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana.pdf.jpgRIUT-AAA-spa-2013-Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg15768https://repository.ut.edu.co/bitstreams/cb1050df-dc84-462d-9bb8-dff7c3152e65/download98ee428de596f6ab60ec48a1e3babb1aMD510001/1083oai:repository.ut.edu.co:001/10832023-03-24 17:47:57.271http://www.creativecommons.org/licenses by-nc/2.5/co/Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia (CCBY-NC-SA 2.5 CO)https://repository.ut.edu.coRepositorio Institucional - Universidad del Tolimasoporte@metabiblioteca.comQ3JlYXRpdmUgQ29tbW9ucyAtIExpY2VuY2lhIGRlIFJlY29ub2NpbWllbnRvIC0gTm9Db21lcmNpYWwgKGJ5LW5jKSA6IFNlIHBlcm1pdGUgbGEgZ2VuZXJhY2nDs24gZGUgb2JyYXMgZGVyaXZhZGFzIHNpZW1wcmUgcXVlIG5vIHNlIGhhZ2EgdW4gdXNvIGNvbWVyY2lhbC4gVGFtcG9jbyBzZSBwdWVkZSB1dGlsaXphciBsYSBvYnJhIG9yaWdpbmFsIGNvbiBmaW5hbGlkYWRlcyBjb21lcmNpYWxlcy4=

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