Estudio comparativo del genoma mitocondrial en anfibios y reptiles: relación entre las reorganizaciones genómicas y la selección
80 p.
- Autores:
-
Montaña Lozano, María Paula
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad del Tolima
- Repositorio:
- RIUT: Repositorio U. Tolima
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repository.ut.edu.co:001/3451
- Acceso en línea:
- https://repository.ut.edu.co/handle/001/3451
- Palabra clave:
- anfibios
reptiles
adaptación (biología)
- Rights
- License
- Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
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Montaña Lozano, María Paulad74f9ee7-ec39-4734-b4be-ddcc15640f52-1Ibagué, Tolima, Colombia2021-11-22T16:09:28Z2021-11-22T16:09:28Z201980 p.Introducción: Se han encontrado rearreglos en el orden de los genes mitocondriales en anfibios y reptiles que presuntamente serían responsables del desarrollo de estrategias metabólicas. Por esta razón, se buscó identificar el nivel de variabilidad de los mitogenomas en anfibios y reptiles, relacionándolos con procesos adaptativos. Materiales y métodos: Fueron analizados 555 mitogenomas completos de anfibios y reptiles, procedentes de NCBI. Se confirmó la correcta anotación de sus genes, se determinaron las reorganizaciones, se realizó una filogenia de inversiones-translocaciones, se analizaron regiones control, en donde se determinó su tamaño y porcentaje de identidad mediante alineamientos. Se relacionaron las adaptaciones reportadas para los grupos taxonómicos con caracteres obtenidos de variabilidad estructural. Resultados y discusión: Se encontró un bajo porcentaje de genomas con errores de anotación. Se confirmaron reorganizaciones en el 44% de los mitogenomas, siendo las inversiones-translocaciones las más comunes. La filogenia de inversiones evidenció que las reorganizaciones se agrupan según criterios taxonómicos. Se evidencia genomas excepcionalmente grandes con extensas duplicaciones y regiones control largas. Se determinó que existen grupos taxonómicos con una alta tasa de reorganización, y no existen convergencias del orden de los genes entre los grupos analizados; sin embargo, las reorganizaciones se agrupan taxonómicamente, esto sugiere que en anfibios como en reptiles el orden de los genes mitocondriales no es tan conservado como lo reportan diferentes autores. Se presentan las primeras evidencias de reorganizaciones genómicas relacionadas a procesos adaptativos, además se propone a la región control una zona clave para entender la evolución del mitogenoma.Introduction: Rearrangements have been found in the order of mitochondrial genes in amphibians and reptiles that are allegedly responsible for the development of metabolic strategies. For this reason, we sought to identify the level of variability of mitogenomas in amphibians and reptiles, relating them to adaptive processes. Materials and methods: 555 complete mitogenomas of amphibians and reptiles, of the NCBI database. The correct annotation of their genes was confirmed, the reorganizations were determined, an inversion-translocation phylogeny was elaborated, the control regions were analyzed, where their size and percentage of identity was determined by alignments. The adaptations reported for taxonomic groups were related to specific characters of structural variability. Results and discussion: A low percentage of genomes with annotation errors was found. Reorganizations were confirmed in 44% of the mitogenomes, with inversions-translocations being the most common. The phylogeny of inversions shows that reorganizations are grouped according to taxonomic criteria. Exceptionally large genomes with extensive duplications and long control regions are evident. It was determined that there are taxonomic groups with a high rate of reorganization, and there are no convergences of the order of genes between the groups analyzed; however, reorganizations are taxonomically grouped, this classifies that in amphibians as in reptiles the order of mitochondrial genes is not as conserved as reported by different authors. The first evidence of genomic reorganizations related to adaptive processes is presented, in addition the control region of a key area is proposed to understand the evolution of the mitogenome.application/pdfhttps://repository.ut.edu.co/handle/001/3451spaUniversidad del Tolima(CO COL 170)Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalhttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es#http://purl.org/coar/access_right/c_abf2anfibiosreptilesadaptación (biología)Facultad de Ciencias - BiologíaPrada Quiroga, Carlos Fernando - DirectorPregradoBiólogoEstudio comparativo del genoma mitocondrial en anfibios y reptiles: relación entre las reorganizaciones genómicas y la selecciónTrabajo de grado - PregradoTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fPublicationORIGINALCD2018pdf.pdfCD2018pdf.pdfapplication/pdf2671280https://repository.ut.edu.co/bitstreams/c44ab4d3-4a80-4f3d-b9d0-da2b7bc6bc21/download19fe24b1af8abe5e81d190c4c529bbd2MD51CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849https://repository.ut.edu.co/bitstreams/a2ce70ac-ba7d-4835-99d9-a0215c37ad4b/download4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52license_textlicense_texttext/html; charset=utf-80https://repository.ut.edu.co/bitstreams/778e0254-4a35-4da8-bf83-0c576a2f75a0/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53license_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80https://repository.ut.edu.co/bitstreams/85271d1e-0905-4a1f-9959-95b3ac24b00f/downloadd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8227https://repository.ut.edu.co/bitstreams/1c4e580a-b761-469d-afc2-126afe0daeff/download127f1942dfbe07f43e8227b660620c70MD55TEXTCD2018pdf.pdf.txtCD2018pdf.pdf.txtExtracted texttext/plain101323https://repository.ut.edu.co/bitstreams/fb13da23-e45e-4612-8758-1d42610f0048/downloadc3952663bb69dbe99b9e855a7eddd73bMD56THUMBNAILCD2018pdf.pdf.jpgCD2018pdf.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7344https://repository.ut.edu.co/bitstreams/51344f30-17ae-422a-a37f-2b5e0c92d59e/download59f990cff54cfa423030123414a6fb1dMD57001/3451oai:repository.ut.edu.co:001/34512023-03-24 17:46:07.867https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es#Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalhttps://repository.ut.edu.coRepositorio Institucional - Universidad del Tolimasoporte@metabiblioteca.comQ3JlYXRpdmUgQ29tbW9ucyAtIExpY2VuY2lhIGRlIFJlY29ub2NpbWllbnRvIC0gTm9Db21lcmNpYWwgKGJ5LW5jKSA6IFNlIHBlcm1pdGUgbGEgZ2VuZXJhY2nDs24gZGUgb2JyYXMgZGVyaXZhZGFzIHNpZW1wcmUgcXVlIG5vIHNlIGhhZ2EgdW4gdXNvIGNvbWVyY2lhbC4gVGFtcG9jbyBzZSBwdWVkZSB1dGlsaXphciBsYSBvYnJhIG9yaWdpbmFsIGNvbiBmaW5hbGlkYWRlcyBjb21lcmNpYWxlcy4= |