Uso de la reacción en cadena de la polimerasa para caracterizar aislamientos nativos de Bacillus Thuringiensis
En este estudio se estandarizó una metodología para la caracterización molecular de cepas nativas de Bacillus thuringiensis, la cual se basó en la amplificación de los genes cry mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Se utilizaron cuatro mezclas de oligonucleótidos: dos Generales (I...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 1997
- Institución:
- Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano
- Repositorio:
- Expeditio: repositorio UTadeo
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:expeditiorepositorio.utadeo.edu.co:20.500.12010/34171
- Acceso en línea:
- https://revistacta.agrosavia.co/index.php/revista/article/view/156
http://hdl.handle.net/20.500.12010/34171
- Palabra clave:
- Bacillus thuringiensis
Delta-endotoxinas
PCR
Proteinas Cry
Biología molecular -- Caracterización
Biotecnología -- Identificación de genes
Control de plagas -- Ensayos de toxicidad
Bacillus thuringiensis
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En este estudio se estandarizó una metodología para la caracterización molecular de cepas nativas de Bacillus thuringiensis, la cual se basó en la amplificación de los genes cry mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Se utilizaron cuatro mezclas de oligonucleótidos: dos Generales (I y II), los cuales reconocen genes de las familias cry1, cry2, cry3, cry4 y cry1Ia, y dos Específicos (A y B), que identifican los genes de la familia cry1 (cry1Aa, cry1Ab, cry1Ac, cry1Ba, cry1Ca y cry1Da). La calidad y concentración del ADN bacteriano influyó sobre la especificidad y concentración de los productos obtenidos mediante la amplificación de los genes cry. La calidad del ADN purificado a través del método rápido reportado por M. He et al. (Nucleic Ac. Res. 18:1660, 1990) permitió una amplificación eficiente. Para realizar la PCR en condiciones óptimas, se utilizó una mezcla de reacción con un volumen final de 20 µl, la cual contenía 0,4 µM de cada oligonucleótido, 1X PCR buffer (50 mM KCL, wmM Tris-HCl, pH 8,3 y 3,0 mM MgCl 2), 200 µM de cada dNTP y 1U de Taq-ADN-polimerasa, además de 10-100 y 300- 500 ng de ADN bacterial para las mezclas de los oligonucleótidos Generales y Específicos, respectivamente. El programa de amplificación incluyó 30 ciclos de desnaturalización a 94°C, hibridación a 53°C y síntesis a 72°C durante 20 segundos cada uno. La metodología estandarizada se puede utilizar rutinariamente para amplificar los genes cry procedentes de aislamientos nativos de B. thuringiensis, lo cual permite clasificarlos y seleccionarlos de una manera rápida y precisa de acuerdo con su actividad biológica y potencial biotecnológico; adicionalmente, como paso previo de los ensayos de toxicidad contra diversas especies de insectos plaga de interés agrícola. |
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Para realizar la PCR en condiciones óptimas, se utilizó una mezcla de reacción con un volumen final de 20 µl, la cual contenía 0,4 µM de cada oligonucleótido, 1X PCR buffer (50 mM KCL, wmM Tris-HCl, pH 8,3 y 3,0 mM MgCl 2), 200 µM de cada dNTP y 1U de Taq-ADN-polimerasa, además de 10-100 y 300- 500 ng de ADN bacterial para las mezclas de los oligonucleótidos Generales y Específicos, respectivamente. El programa de amplificación incluyó 30 ciclos de desnaturalización a 94°C, hibridación a 53°C y síntesis a 72°C durante 20 segundos cada uno. La metodología estandarizada se puede utilizar rutinariamente para amplificar los genes cry procedentes de aislamientos nativos de B. thuringiensis, lo cual permite clasificarlos y seleccionarlos de una manera rápida y precisa de acuerdo con su actividad biológica y potencial biotecnológico; adicionalmente, como paso previo de los ensayos de toxicidad contra diversas especies de insectos plaga de interés agrícola.#Reacciónencadena#Polimerasa#Aislamientosnativos#BacillutshuringiensisChain Reaction (PCR) techniques was standardized for the molecular characterization of cry genesi n BacíIlus thuringiensis. Four oligonucleotides mixes (primers) were used: two General (I and II) -which recognize the genes families cryt, cry2, cry3, cry4 and cryúa-, and two Specific (A and B) which recognize the genes family cry (crytAa, cryAb, crytAc, cryrBa, crytCa and rytDa). The quality of bacterial DNA influenced the amplification product specificity and concentration. The quality of the DNA purified by M. He et al.fast method (NucleicAc.R es.1 8:166or,9 9o) allowed an efficient amplification. The optimum conditions for PCR were achieved using a mixture reaction with a final volume of zo ¡rL which contained o.4 ¡rM of each primer, rX PCRbuffer (5o mM KCL, romM Tris-HCl, pH 8.3 and 3.o mM MgCI,), zoo ¡rM dNTP's, r U Taq-DNA-polymerase, roroo ng of bacterial DNA for the General mixtures and 3oo-5oo ng of bacterial DNA for the Specific mixtures. The amplification program included 3o rycles as follows: denaturation at94oC, annealing at 53oC and synthesis at TzoC during zo seconds each one. The standardized methodology could be used routinely in the cr7 genes amplification of native isolates of B. thuringiensis for the classification, rapid and precise selection according to the potential biological activity as a previous step to toxicity trials against diverse insect pests of agriculture interest.1-9 páginasapplication/pdfspaRevista Corpoica Volumen 2 Número 1Bacillus thuringiensisDelta-endotoxinasPCRProteinas CryBiología molecular -- CaracterizaciónBiotecnología -- Identificación de genesControl de plagas -- Ensayos de toxicidadBacillus thuringiensisDelta-endotoxinsProteins CryPCRUso de la reacción en cadena de la polimerasa para caracterizar aislamientos nativos de Bacillus ThuringiensisAbierto (Texto Completo)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Bourque, N., Valero, J.R., Mercier, |., Lavoie M.C. and Koziel M.G. r99r. Multipex Polymerasa Chain Reaction for detection and differentiation of microbial insecticide Bacillus thuringiensis. Appl. Environ. Microbiol. sgis 23s- 27.Carozzi, N.B., Kranen, V.4., W'arren, G.W, Evola, S, and Koziel, M.G. r99r. Prediction of insecticidal actívity of Bacillus thuringiensis strains by polymerase chain reaction product profiles. Appl. Environ. Microbiol. 57:3o 57- 3o6t.Cerón, f., Quintero R., Ortiz, A., Ortiz, M.,Aranda, E., Lina, L. and Bravo,A. 1994, PCR Analysis of the crl Insecticidal Family Genes from B¿cillus thuringiersis. Appl. Environ. Microbiol. 6 oA53-356.Cerón, J., Ortiz,A., Quintero, R.,Guereca, L. and Bravo, A. 1996, Specific PCR reaction primers directed to identifr crlll Genes withín a Bacillus thuringiensis. Appl. Environ. Microbiol. 6t3826- 383t.Chak, K.F,, Chao, D.C., Tseng, M.Y., Kao, S.S., T[an, S.J. and Feng, T.Y. 1994. Determination and Distribution of cry-Type Genes of Baclllus thuringiensls Isolates from Thiwan. Appl. Environ. Microbiol. 6o:24;.5- 2420,Donovan, WP., González, J.M' lr.' Gilbert, M.P. and Dankocsik, C. 1988. 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