Recolecta y análisis de información para el estudio de comunidades microbiológicas y su asociación con corales.
La obtención de material biológico y genético es fundamental y la base para el estudio de las comunidades microbianas que se encuentran asociadas a los corales. Este trabajo se enfocó en recolectar y analizar información relacionada con las condiciones ambientales, biológicas y microbiológicas, tant...
- Autores:
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2023
- Institución:
- Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano
- Repositorio:
- Expeditio: repositorio UTadeo
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- Acceso en línea:
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Corales
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La obtención de material biológico y genético es fundamental y la base para el estudio de las comunidades microbianas que se encuentran asociadas a los corales. Este trabajo se enfocó en recolectar y analizar información relacionada con las condiciones ambientales, biológicas y microbiológicas, tanto en campo como en condiciones experimentales, orientado en preparar el estudio de las comunidades microbianas a asociadas a corales en la bahía de Chengue e Inca Inca, Santa Marta, Magdalena. Así pues, se registraron datos de temperatura, salinidad, concentración de oxígeno y pH, provenientes de los sitios de muestreo. Además, se determinó la cobertura, frecuencia de interacciones y signos de deterioro dentro de las formaciones arrecifales. Asimismo, se extrajo ADN total microbiano a partir de muestras de tejido y mucus de los corales recolectados durante la época seca de 2022-2023 y la lluviosa de 2022. Por último, se examinó el estado de un vivero de fragmentos de coral, recolectando información sobre parámetros fisicoquímicos y condiciones de aclimatación, con el fin de preparar los fragmentos para experimentos posteriores. La información acá presentada sirve de base parala toma de decisiones a futuro y contribuye al desarrollo de estudios que permitan revelar la respuesta del microbioma asociado a los corales bajo diferentes condiciones |
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Towards enhancing coral heat tolerance: a "microbiome transplantation" treatment using inoculations of homogenized coral tissues. Microbiome, 9(1), 102 p. Forsman, Z., Rinkevich, B., y Hunter, C. 2006. Investigating fragment size for culturing reefbuilding corals (Porites lobata and P. compressa) in ex situ nurseries. Aquaculture, 261(1), 89-97. Gardner, T., Côté, I., Gill, J., Grant, A., y Watkinson, A. 2003. Long-term region-wide declines in Caribbean corals. science, 301(5635), 958-960 Garren, M., y Azam, F. 2010. New method for counting bacteria associated with coral mucus. Applied and environmental microbiology, 76(18), 6128-6133. Herrera, C. 2022. Búsqueda preliminar de candidatos a microorganismos benéficos para corales a partir del mucus y tejido de Madracis auretenra (Scleractinia: Pocilloporidae). Tesis de grado Biología marina. Universidad Jorge Tadeo Lozano. Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería. Santafé de Bogotá. 56 p. Kimes, N. E., van Nostrand, J. 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The Coral Probiotic Hypothesis. Environ Microbiol, 8(12), 2068-2073. Ritchie, K. B., y Smith, G. W. 2004. Microbial communities of coral surface mucopolysaccharide layers. In Coral Health and Disease. New York: Springer-Verlag, 259-263 Robles, A., Reyes, H., y Cáceres, C. 2021. Crecimiento y supervivencia de corales durante la fase inicial de cultivo en La Paz, Baja California Sur, México. Revista mexicana de biodiversidad, 92(4), 7 Rodríguez, R., Báez, D., Valcárcel, A., Evangelista, D., Bello De Lillo, Y., y Matos, J. 2022. Importancia de los viveros de coral y su impacto socioeconómico. AULA Revista de Humanidades y Ciencias Sociales, 68(1), 78-91 Smith, S. et al. 2018. Coral-associated bacteria demonstrate phylosymbiosis and cophylogeny. Nat Commun 9, 4921. https://doi.org/10.1038/s41467-018-07275-x Teplitski, M., y Ritchie, K. 2009. How feasible is the biological control of coral diseases?. 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EL AUTOR, manifiesta que la obra objeto de la presente autorización es original y la realizó sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto la obra es de exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre la misma. PARGRAFO: En caso de presentarse cualquier reclamación o acción por parte de un tercero en cuanto a los derechos de autor sobre la obra en cuestión, EL AUTOR, asumirá toda la responsabilidad, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos la universidad actúa como un tercero de buena fe. EL AUTOR, autoriza a LA UNIVERSIDAD DE BOGOTA JORGE TADEO LOZANO, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre la materia, utilice y use la obra objeto de la presente autorización. POLITICA DE TRATAMIENTO DE DATOS PERSONALES. Declaro que autorizo previa y de forma informada el tratamiento de mis datos personales por parte de LA UNIVERSIDAD DE BOGOTÁ JORGE TADEO LOZANO para fines académicos y en aplicación de convenios con terceros o servicios conexos con actividades propias de la academia, con estricto cumplimiento de los principios de ley. Para el correcto ejercicio de mi derecho de habeas data cuento con la cuenta de correo protecciondatos@utadeo.edu.co, donde previa identificación podré solicitar la consulta, corrección y supresión de mis datosAcceso restringidohttp://purl.org/coar/access_right/c_16ecRuiz Toquica, Jordan StevenRincón Díaz, NataliaAguilar Peña, Germán DanielBiólogo(s) marinoColombia2023-09-27T14:47:52Z2023-09-27T14:47:52Z2023http://hdl.handle.net/20.500.12010/32050http://expeditio.utadeo.edu.coLa obtención de material biológico y genético es fundamental y la base para el estudio de las comunidades microbianas que se encuentran asociadas a los corales. Este trabajo se enfocó en recolectar y analizar información relacionada con las condiciones ambientales, biológicas y microbiológicas, tanto en campo como en condiciones experimentales, orientado en preparar el estudio de las comunidades microbianas a asociadas a corales en la bahía de Chengue e Inca Inca, Santa Marta, Magdalena. Así pues, se registraron datos de temperatura, salinidad, concentración de oxígeno y pH, provenientes de los sitios de muestreo. Además, se determinó la cobertura, frecuencia de interacciones y signos de deterioro dentro de las formaciones arrecifales. Asimismo, se extrajo ADN total microbiano a partir de muestras de tejido y mucus de los corales recolectados durante la época seca de 2022-2023 y la lluviosa de 2022. Por último, se examinó el estado de un vivero de fragmentos de coral, recolectando información sobre parámetros fisicoquímicos y condiciones de aclimatación, con el fin de preparar los fragmentos para experimentos posteriores. La información acá presentada sirve de base parala toma de decisiones a futuro y contribuye al desarrollo de estudios que permitan revelar la respuesta del microbioma asociado a los corales bajo diferentes condiciones#MaterialBiológico#Corales#ChengueIncaRequerimientos de sistema: Adobe Acrobat ReaderObtaining biological and genetic material is fundamental and the basis for the study of microbial communities that are associated with corals. This work focused on collecting and analyzing information related to environmental, biological and microbiological conditions, both in the field and in experimental conditions, aimed at preparing the study of microbial communities associated with corals in the bay of Chengue and Inca Inca, Santa Marta, Magdalena. Thus, temperature, salinity, oxygen concentration and pH data were recorded from the sampling sites. In addition, the coverage, frequency of interactions and signs of deterioration within the reef formations were determined. Total microbial DNA was also extracted from tissue and mucus samples from corals collected during the 2022-2023 dry season and the 2022 rainy season. Finally, the state of a coral fragment nursery was examined, collecting information on physicochemical parameters and acclimatization conditions, in order to prepare the fragments for further experiments. The information presented here serves as a basis for future decision-making and contributes to the development of studies that reveal the response of the microbiome associated with corals under different conditions25 páginastext/html1 recurso en línea (archivo de texto)spaUniversidad de Bogotá Jorge Tadeo LozanoBiología marinaFacultad de Ciencias Naturales e IngenieríaUniversidad de Bogotá Jorge Tadeo LozanoExpeditio Repositorio Institucional UJTLComunidades microbianasADN microbianoCoralesBiología marinaAspectos ambientalesRecolecta y análisis de información para el estudio de comunidades microbiológicas y su asociación con corales.Trabajo de grado de pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fBarott, K. L., Rodriguez, B., Janouškovec, J., Marhaver, K. L., Smith, J. E., Keeling, P., y Rohwer, F. L. 2011. Microbial diversity associated with four functional groups of benthic reef algae and the reef‐building coral Montastraea annularis. Environmental microbiology, 13(5), 1192-1204.Borneman, E. 2008. Introduction to the husbandry of corals in aquariums: A review. Public Aquar. Husb. Ser, 2, 3-14.Bourne, D. G., y Munn, C. B. 2005. Diversity of bacteria associated with the coral Pocillopora damicornis from the Great Barrier Reef. Environmental microbiology, 7(8), 1162-1174.Calixto, R., Portz, L., Manzolli, R., Oliveira, L., Suarez, J., Acevedo, T. y Schorr, C. 2020. Evaluación espaciotemporal de los efectos de estresores ambientales sobre la microbiota coralina y la salud de los arrecifes coralinos del caribe colombiano. Corporación Universidad de la Costa.Doering, T., Wall, M., Putchim, L., Rattanawongwan, T., Schroeder, R., Hentschel, U. y Roik, A. 2021. Towards enhancing coral heat tolerance: a "microbiome transplantation" treatment using inoculations of homogenized coral tissues. Microbiome, 9(1), 102 p.Forsman, Z., Rinkevich, B., y Hunter, C. 2006. Investigating fragment size for culturing reefbuilding corals (Porites lobata and P. compressa) in ex situ nurseries. Aquaculture, 261(1), 89-97.Gardner, T., Côté, I., Gill, J., Grant, A., y Watkinson, A. 2003. Long-term region-wide declines in Caribbean corals. science, 301(5635), 958-960Garren, M., y Azam, F. 2010. New method for counting bacteria associated with coral mucus. Applied and environmental microbiology, 76(18), 6128-6133.Herrera, C. 2022. Búsqueda preliminar de candidatos a microorganismos benéficos para corales a partir del mucus y tejido de Madracis auretenra (Scleractinia: Pocilloporidae). Tesis de grado Biología marina. Universidad Jorge Tadeo Lozano. Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería. Santafé de Bogotá. 56 p.Kimes, N. E., van Nostrand, J. D., Weil, E., Zhou, J., y Morris, P. J. 2010. Microbial functional structure of Montastraea faveolata, an important Caribbean reef‐building coral, differs between healthy and yellow‐band diseased colonies. 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Efecto e incidencia de las interacciones alga – coral en comunidades coralinas de dos bahías de la regio de Santa Marta (Caribe colombiano) con distinto grado de influencia antropogénica. Tesis de grado Biología marina. Universidad Jorge Tadeo Lozano. Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería. Santafé de Bogotá. 188 p.Ocampo, H., Rodríguez, F. A., y Becerril, A. 2021. Más allá del cambio climático: Implicaciones de la contaminación marina por agroquímicos sobre las interacciones simbióticas y el éxito ecológico de los corales. E-CUCBA, (15), 1–9. https://doi.org/10.32870/e-cucba.v0i15.174Ramos, A., García, U., De Los Santos, C., y Aguirre, M. 2018. Metagenómica marina: un enfoque al descubrimiento de nuevos biosurfactantes para su posible aplicación ambiental. En R. Zamora (Ed), Avances y perspectivas de la biotecnología en la península de Yucatán. 208-226.Reshef, L., Koren, O., Loya, Y., Zilber, I., y Rosenberg, E. 2006. The Coral Probiotic Hypothesis. 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