Análisis y predición de epitopes T y B en proteínas de Helicobacter pylori: Una aproximación inicial al diseño racional de estrategias terapeuticas alternativas sin uso de antibióticos
Helicobacter pylori (H. pylori) es un bacteria de forma espiral gram negativa que se estima afecta a más de la mitad de la población mundial, estableciendo una infección crónica en el estómago, debido a diversos mecanismos de evasión de la respuesta inmune. Este microorganismo se ha asociado con div...
- Autores:
-
Navarro-Quiroz, Elkin
Navarro-Quiroz, Roberto
España-Puccini, Pierine
Ahmad, Mostapha
Rios-Anillo, Margarita
Olave-Jaller, Valeria
Diaz, Anderson
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2017
- Institución:
- Universidad Simón Bolívar
- Repositorio:
- Repositorio Digital USB
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:bonga.unisimon.edu.co:20.500.12442/1778
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/20.500.12442/1778
- Palabra clave:
- Rights
- License
- licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
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Helicobacter pylori (H. pylori) es un bacteria de forma espiral gram negativa que se estima afecta a más de la mitad de la población mundial, estableciendo una infección crónica en el estómago, debido a diversos mecanismos de evasión de la respuesta inmune. Este microorganismo se ha asociado con diversos trastornos gástricos que van desde gastritis hasta cáncer, por lo que es reconocido por la Organización Mundial de la Salud (OMS) como carcinógeno clase I. Regímenes de tratamiento convencionales involucran el uso de antibióticos, y estos fracasan cada vez más en el control de la infección, debido a que H. pylori ha adquirido de forma progresiva resistencia a los compuestos utilizados, lo cual sugiere la necesidad de desarrollar nuevas estrategias terapéuticas, lo cual implica la identificación de nuevos blancos terapéuticos. Este estudio tuvo como propósito la evaluación in silico de epitopes T y B en proteínas del Helicobacter pylori. Para ello fueron identificadas 22 proteínas de membrana externas de Helicobacter pylori Cepa 26695 con número de acceso NC_000915; en la selección se empleó la herramienta web Vaxign (disponible gratis en http://www.violinet.org/vaxign/), en las que se predijeron 100 epítopes (60 epítopes clases I y 40 epítopes clase II), que potencialmente podrían se utilizados en el desarrollo de nuevos abordajes terapéuticos de la infección por H. pylori sin uso de antibióticos. |
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licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacionalhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Navarro-Quiroz, Elkinb7f1ab18-ac07-40cf-9df1-f25f0c54e259-1Navarro-Quiroz, Robertob6533240-1b1b-40e4-9123-44fefcab6c1e-1España-Puccini, Pierinee716f995-cc83-4bbe-998e-255729e97108-1Ahmad, Mostaphae2a2bc14-8863-46f5-a6fc-6020fca57918-1Rios-Anillo, Margarita669d77da-b7fe-45f9-a379-d897ae372d1c-1Olave-Jaller, Valeria673e5d3b-5de0-4fac-808b-58bdf20735ea-1Diaz, Andersonb3dfa115-a233-49df-8810-87b41e8715cb-12018-03-05T15:16:13Z2018-03-05T15:16:13Z2017-1001205552http://hdl.handle.net/20.500.12442/1778Helicobacter pylori (H. pylori) es un bacteria de forma espiral gram negativa que se estima afecta a más de la mitad de la población mundial, estableciendo una infección crónica en el estómago, debido a diversos mecanismos de evasión de la respuesta inmune. Este microorganismo se ha asociado con diversos trastornos gástricos que van desde gastritis hasta cáncer, por lo que es reconocido por la Organización Mundial de la Salud (OMS) como carcinógeno clase I. Regímenes de tratamiento convencionales involucran el uso de antibióticos, y estos fracasan cada vez más en el control de la infección, debido a que H. pylori ha adquirido de forma progresiva resistencia a los compuestos utilizados, lo cual sugiere la necesidad de desarrollar nuevas estrategias terapéuticas, lo cual implica la identificación de nuevos blancos terapéuticos. Este estudio tuvo como propósito la evaluación in silico de epitopes T y B en proteínas del Helicobacter pylori. Para ello fueron identificadas 22 proteínas de membrana externas de Helicobacter pylori Cepa 26695 con número de acceso NC_000915; en la selección se empleó la herramienta web Vaxign (disponible gratis en http://www.violinet.org/vaxign/), en las que se predijeron 100 epítopes (60 epítopes clases I y 40 epítopes clase II), que potencialmente podrían se utilizados en el desarrollo de nuevos abordajes terapéuticos de la infección por H. pylori sin uso de antibióticos.Helicobacter pylori (H. pylori) is a gram-negative spiral bacterium, estimated to affect more than half the world population, establishing chronic infection in the stomach, due to diverse mechanisms of immune response evasion. This microorganism has been associated with various gastric disorders ranging from gastritis to cancer, and is recognized by the World Health Organization (WHO) as a class I carcinogen. Conventional treatment regimes involve the use of antibiotics and these fail every time but in the control of the infection, because H. pylori has progressively acquired resistance to the compounds used, suggesting the need to develop new therapeutic strategies, which implies the identification of new therapeutic targets. The present study aimed at the in silico evaluation of T and B epitopes in Helicobacter pylori proteins. For this, 22 external membrane proteins of Helicobacter pylori Strain 26695 with accession number NC_000915 were identified, in the selection the web tool Vaxign (was available free at http://www.violinet.org/vaxign/), in which they were predicted 100 epitopes (60 class I epitopes and 40 class II epitopes), which could potentially be used in the development of new therapeutic approaches to H. pylori infection without the use of antibiotics.spaUniversidad del NorteRevista Científica Salud UninorteVol. 33, No. 3 (2017)http://rcientificas.uninorte.edu.co/index.php/salud/article/view/9275/10918Análisis y predición de epitopes T y B en proteínas de Helicobacter pylori: Una aproximación inicial al diseño racional de estrategias terapeuticas alternativas sin uso de antibióticosAnalysis and prediction of T and B epitopes in enHelicobacter pylori proteins: An initial approach to the rational design of alternative therapeutic strategies without the use of antibioticsarticlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501Naz A, Awan FM, Obaid A, Muhammad SA, Paracha RZ, Ahmad J et al. Identification of putative vaccine candidates against Helicobacter pylori exploiting exoproteome and secretome: a reverse vaccinology based approach. Infect Genet Evol. Jun 2015;32:280–91. Available: http://www.sciencedirect.com/ science/article/pii/S1567134815001124Robin Warren J. Unidentified curved bacilli on gastric epithelium in active cronic gastritis. Lancet. Jun 1983];321(8336):1273–5. Available: http://www.thelancet.com/article/ S0140673683927198/fulltextTomb J-F, White O, Kerlavage AR, Clayton RA, Sutton GG, Fleischmann RD, et al. The complete genome sequence of the gastric pathogen Helicobacter pylori. Aug 1997;388(6642):539-47.Spohn G, Scarlato V, Motility, Chemotaxis, and Flagella. Helicobacter pylori: Physiology and Genetics. ASM Press; 2001. Available: http:// www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21290725Lambert JR, Lin SK, Aranda-Michel J. Helicobacter pylori. Scand J Gastroenterol Suppl. Jan 1995;208:33-46. 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