Implementación de un algoritmo de seguimiento de objetos para analizar las dinámicas de movimiento en peces guppies (Poecilia reticulata)
Este proyecto surge a partir de la investigación de la profesora Natasha Bloch de la Universidad de los Andes, centrada en el estudio de los comportamientos de los peces guppy en relación con los cambios neuronales. El objetivo del proyecto es proporcionar apoyo a la investigación en cuanto al regis...
- Autores:
-
Merchán Cáceres, Manuel Felipe
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2024
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/73253
- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/1992/73253
- Palabra clave:
- DeepSort
Object detection
Object tracking
YOLO
Geometría epipolar
Guppy
Ingeniería
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Este proyecto surge a partir de la investigación de la profesora Natasha Bloch de la Universidad de los Andes, centrada en el estudio de los comportamientos de los peces guppy en relación con los cambios neuronales. El objetivo del proyecto es proporcionar apoyo a la investigación en cuanto al registro de las dinámicas de movimiento de los peces. Para abordar esto, se propone el desarrollo de un algoritmo especializado que detecta y registra los movimientos de cada pez. El proceso implica la utilización de dos algoritmos basados en redes neuronales para la detección y el seguimiento de objetos y un proceso de caracterización del entorno de experimentación para obtener la localización de los objetos en coordenadas 3D. |
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Luis Gonzalo. Entre libertad y Determinismo. Ediciones Cristianda, 2007, pages 12–13. Alberto Corral et al. “Female brain size affects the assessment of male attractiveness during mate choice”. In: Science Advances 3 (2017), page 1601990 (cited on page 8). Alberto Corral et al. “Early neurogenomic response associated with variation in guppy female mate preference”. In: Nature ecology and evolution 14 (2018), 1772––1781 (citedon page 8). Yunhao Du et al. “StrongSORT: Make DeepSORT Great Again”. In: IEEE Transactions on Multimedia (2023) (cited on pages 19, 22). Chen Fei et al. “Visual object tracking: A survey”. In: Computer Vision and Image Understanding 4222 (2022) (cited on pages 8, 9). Rachel Huang, Jonathan Pedoeem, and Cuixian Chen. “YOLO-LITE: A Real-Time Object Detection Algorithm Optimized for Non-GPU Computers”. In: IEEE International Conference on Big Data (Big Data) (2018), pages 2503–2510 (cited on page 11) Julia M.George et al. “Acute social isolation alters neurogenomic state in songbird fore brain”. In: PNAS 117 (2019), pages 23311–23316 (cited on page 7) Joaquín Sanz et al. “Social history and exposure to pathogen signals modulate social status effects on gene regulation in rhesus macaques”. In: PNAS 38 (2019), pages 23317–23322 (cited on page 7). Alison Wright et al. “Convergent recombination suppression suggests role of sexual selection in guppy sex chromosome formation”. In: nature communications 8 (2017), page 14251 (cited on page 8). Li Xi et al. “A Survey of Appearance Models in Visual Object Tracking”. In: ACM transactions on Intelligent Systems and Technology 4 (4 2013), pages 1–48 (cited on page 8) Soleimanitaleb Zahra and Ali Keyvanrad Mohammad. “Single Object Tracking: A Survey of Methods, Datasets, and Evaluation Metrics”. In: Cornell University (2022) (cited on page 8). Departamento de Ingeniería Biomédica: Neurogenética Genómica: Universidad de los Andes. URL: https://ingbiomedica.uniandes.edu.co/investigacion/lineas investigacion/neurogenetica-comportamiento (cited on page 5) QUÉ ES LA COGNICIÓN Y CÓMO ESTIMULARLA. URL: https://www.elrincondelcuidador.es / otros - cuidados / que - es - la - cognicion - y - como - estimularla (cited on page 5). The Complete Guide to Object Tracking [+V7 Tutorial]. URL: https://www.v7labs. com/blog/object-tracking-guide (cited on page 8). Ultralytics YOLOv8 Docs. URL: https://docs.ultralytics.com/yolov5/tutorials/architecture_description/#41-compute-losses (cited on page 17). When to use Grayscale as a Preprocessing step. URL: https://blog.roboflow.com/when-to-use-grayscale-as-a-preprocessing-step/ (cited on page 20). |
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El proceso implica la utilización de dos algoritmos basados en redes neuronales para la detección y el seguimiento de objetos y un proceso de caracterización del entorno de experimentación para obtener la localización de los objetos en coordenadas 3D.Ingeniero ElectrónicoPregrado31 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesIngeniería ElectrónicaFacultad de IngenieríaDepartamento de Ingeniería Eléctrica y ElectrónicaAttribution 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Implementación de un algoritmo de seguimiento de objetos para analizar las dinámicas de movimiento en peces guppies (Poecilia reticulata)Trabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPDeepSortObject detectionObject trackingYOLOGeometría epipolarGuppyIngenieríaLuis Gonzalo. 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In: IEEE International Conference on Big Data (Big Data) (2018), pages 2503–2510 (cited on page 11)Julia M.George et al. “Acute social isolation alters neurogenomic state in songbird fore brain”. In: PNAS 117 (2019), pages 23311–23316 (cited on page 7)Joaquín Sanz et al. “Social history and exposure to pathogen signals modulate social status effects on gene regulation in rhesus macaques”. In: PNAS 38 (2019), pages 23317–23322 (cited on page 7).Alison Wright et al. “Convergent recombination suppression suggests role of sexual selection in guppy sex chromosome formation”. In: nature communications 8 (2017), page 14251 (cited on page 8).Li Xi et al. “A Survey of Appearance Models in Visual Object Tracking”. In: ACM transactions on Intelligent Systems and Technology 4 (4 2013), pages 1–48 (cited on page 8)Soleimanitaleb Zahra and Ali Keyvanrad Mohammad. “Single Object Tracking: A Survey of Methods, Datasets, and Evaluation Metrics”. In: Cornell University (2022) (cited on page 8).Departamento de Ingeniería Biomédica: Neurogenética Genómica: Universidad de los Andes. URL: https://ingbiomedica.uniandes.edu.co/investigacion/lineas investigacion/neurogenetica-comportamiento (cited on page 5)QUÉ ES LA COGNICIÓN Y CÓMO ESTIMULARLA. URL: https://www.elrincondelcuidador.es / otros - cuidados / que - es - la - cognicion - y - como - estimularla (cited on page 5).The Complete Guide to Object Tracking [+V7 Tutorial]. URL: https://www.v7labs. com/blog/object-tracking-guide (cited on page 8).Ultralytics YOLOv8 Docs. URL: https://docs.ultralytics.com/yolov5/tutorials/architecture_description/#41-compute-losses (cited on page 17).When to use Grayscale as a Preprocessing step. URL: https://blog.roboflow.com/when-to-use-grayscale-as-a-preprocessing-step/ (cited on page 20).201817265PublicationORIGINALImplementación de un algoritmo de seguimiento de objetos para analizar las dinámicas de movimiento en peces guppies (poecilia reticulata).pdfImplementación de un algoritmo de seguimiento de objetos para analizar las dinámicas de movimiento en peces guppies (poecilia reticulata).pdfapplication/pdf10510430https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/afb830a1-9beb-4d9b-95a3-e5c0de4a2d4f/downloadc4bc861a608ff6cac3a219cdbd447914MD512320_PG-BIBLIO-Manuel Felipe Merchan Caceres-FS_AA.pdf2320_PG-BIBLIO-Manuel Felipe Merchan Caceres-FS_AA.pdfHIDEapplication/pdf262553https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/f1038c03-e1e0-4cf6-b00a-93b46fadec0e/download24193f7cfda62696ff6137b1ccab4771MD52CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; 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