Nota científica: Análisis de un método rápido para la extracción de ADN de Colletotrichum spp.

Se evaluó la aplicabilidad de un método de extracción de ácidos nucleicos para hongos del género Colletrotrichum basado en el procedimiento desarrollado por Zou et al. (2017). Se modificó el protocolo reportado, evaluando factores como la forma de maceración, el tiempo de cada paso del proceso, el t...

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Autores:
Gutiérrez Góngora, Camila Andrea
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2024
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
spa
OAI Identifier:
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Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/1992/74220
Palabra clave:
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Colletotrichum
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Microbiología
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description Se evaluó la aplicabilidad de un método de extracción de ácidos nucleicos para hongos del género Colletrotrichum basado en el procedimiento desarrollado por Zou et al. (2017). Se modificó el protocolo reportado, evaluando factores como la forma de maceración, el tiempo de cada paso del proceso, el tipo y cantidad de muestra y la edad de los aislamientos. El ADN extraído con este método fue suficiente para realizar la amplificación por PCR de punto final (convencional) y puede ser utilizada para procesos en los que se necesite un método rápido y de bajo costo para obtener material genético de Colletotrichum spp., siempre y cuando no se necesite que este sea de alta calidad o concentración.
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El ADN extraído con este método fue suficiente para realizar la amplificación por PCR de punto final (convencional) y puede ser utilizada para procesos en los que se necesite un método rápido y de bajo costo para obtener material genético de Colletotrichum spp., siempre y cuando no se necesite que este sea de alta calidad o concentración.Here we test the applicability of a nucleic acid extraction method for fungi of the genus Colletrotrichum was conducted based on the procedure developed by Zou et al. (2017). The reported protocol was modified, evaluating factors such as the method of maceration, the time for each step, the type and quantity of sample, and the age of isolates. The DNA extracted with this method was sufficient for performing endpoint PCR amplification and can be used for processes requiring a rapid and cost-effective method to obtain genetic material from Colletotrichum spp., provided high quality or concentration is not required.Centro Nacional de Investigaciones de Café (Cenicafé), Disciplina de FitopatologíaPregrado8 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesMicrobiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias Biológicashttps://repositorio.uniandes.edu.co/static/pdf/aceptacion_uso_es.pdfinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_f1cfNota científica: Análisis de un método rápido para la extracción de ADN de Colletotrichum spp.Trabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPExtracción de ADNHongosColletotrichumProtocoloDNA extractionFungiColletotrichumProtocolMicrobiologíaAlhudaib, K., Ismail, A. 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Pathological, Morphological, Cytogenomic, Biochemical and Molecular Data Support the Distinction between Colletotrichum cigarro comb. et stat. nov. and Colletotrichum kahawae. Plants, 9(4), 502. MDPI AG. Retrieved from http://dx.doi.org/10.3390/plants9040502Cannon, P. F., Damm, U., Johnston, P. R., & Weir, B. S. (2012). Colletotrichum: current status and future directions. Studies in mycology, 73(1), 181-213.Cao, X. R., Xu, X. M., Che, H. Y., West, J. S., & Luo, D. Q. (2019). Characteristics and distribution of Colletotrichum species in coffee plantations in Hainan, China. Plant Pathology, 68(6), 1146-1156.Gaitán, Á., Rivillas, C. A., Castro Caicedo, B. L., & Cristancho Ardila, M. A. (2013). Manejo integrado de enfermedades. En Federación Nacional de Cafeteros de Colombia, Manual del cafetero colombiano: Investigación y tecnología para la sostenibilidad de la caficultura (Vol. 2, pp. 143–178). 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El documento tiene acceso restringido debido a que este está en proceso de evaluación por parte del Comité Editorial de Cenicafé; para ser publicado en la Revista Cenicafé. El documento cuenta con información confidencial que no puede ser de acceso abierto hasta su publicación.application/pdf465579https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/a101686f-2a03-4721-b7b9-2e8f966f68bd/downloadbe6877ec164ba6fd77a6a9315ed0e409MD53TEXTautorizacion tesis (1).pdf.txtautorizacion tesis (1).pdf.txtExtracted texttext/plain1996https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/8f578342-46b3-48f5-9d88-5186d8eb3990/download184de28b46e36203449b67023166365cMD54Nota científica: Análisis de un método rápido para la extracción de ADN de Colletotrichum spp.pdf.txtNota científica: Análisis de un método rápido para la extracción de ADN de Colletotrichum spp.pdf.txtExtracted texttext/plain24569https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/01d39fbf-ced3-4cc1-9530-3a5a7f05d7b7/downloaddb7f4ea7d20b82f328ea02e8ecf27b5aMD56THUMBNAILautorizacion tesis (1).pdf.jpgautorizacion tesis (1).pdf.jpgGenerated 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