Diseño de constructo para marcación de tejido pronéfrico en pez cebra (Danio rerio)

Zebrafish (Danio rerio) is an ideal animal model for in vivo studies using transgenes of temporary or permanent expression by insertion of constructs into the genome of the organism. This study was aimed to identify the minimum elements for the design and assembly of a transgenic construct for expre...

Full description

Autores:
Quevedo Arias, Andrés David
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/51251
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/1992/51251
Palabra clave:
Peces cebra
Regeneración (Biología)
Biotecnología animal
Biología
Rights
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License
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description Zebrafish (Danio rerio) is an ideal animal model for in vivo studies using transgenes of temporary or permanent expression by insertion of constructs into the genome of the organism. This study was aimed to identify the minimum elements for the design and assembly of a transgenic construct for expression in renal precursors and pronephric tissue in this organism. Short sequences of coding and regulatory regions of candidate genes for kidney expression like Pax2.1, Lhx1a, Cdh17 and Atp1a1a.4, were identified including their upstream and downstream elements. Finally, using bioinformatic analysis data from mouse model (Mus musculus) as reference, families of transcription factors like Forkhead, Egr and p53 and some subgroups of families like Hox, Rar and Sox were found as relevant during early kidney development in this animal model. This information is not only relevant to identify evolutionarily conserved regulatory elements but also to contribute to the design of constructs applicable to follow-up early stages of kidney development in zebrafish.
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spelling Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Garavito Aguilar, Zayra Vivianavirtual::8307-1Quevedo Arias, Andrés Davide9a1832b-773f-42ae-9c1f-11e8302456b15002021-08-10T18:17:19Z2021-08-10T18:17:19Z2021http://hdl.handle.net/1992/5125123703.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/Zebrafish (Danio rerio) is an ideal animal model for in vivo studies using transgenes of temporary or permanent expression by insertion of constructs into the genome of the organism. This study was aimed to identify the minimum elements for the design and assembly of a transgenic construct for expression in renal precursors and pronephric tissue in this organism. Short sequences of coding and regulatory regions of candidate genes for kidney expression like Pax2.1, Lhx1a, Cdh17 and Atp1a1a.4, were identified including their upstream and downstream elements. Finally, using bioinformatic analysis data from mouse model (Mus musculus) as reference, families of transcription factors like Forkhead, Egr and p53 and some subgroups of families like Hox, Rar and Sox were found as relevant during early kidney development in this animal model. This information is not only relevant to identify evolutionarily conserved regulatory elements but also to contribute to the design of constructs applicable to follow-up early stages of kidney development in zebrafish.El pez cebra (Danio rerio) es un modelo animal ideal para realizar estudios in vivo usando transgenes de expresión temporal o permanente por inserción de constructos en el genoma del organismo. Este estudio buscó identificar los elementos mínimos para el diseño y ensamblaje de un constructo transgénico para expresión en precursores renales y tejido pronefrico en este organismo. Se lograron identificar secuencias cortas de regiones codificantes y reguladoras de los genes candidatos de expresión renal Pax2.1, Lhx1a, Cdh17 y Atp1a1a.4 y sus elementos adyacentes upstream y downstream. Finalmente, utilizando como referencia el modelo murino, a través de análisis bioinformático se determinaron las familias de factores de transcripción Forkhead, Egr y p53, y algunos subgrupos de las familias Hox, Rar y Sox como relevantes en procesos de regulación tempranos durante el desarrollo renal en este modelo animal. Esta información es relevante no solamente para identificar elementos de regulación conservados evolutivamente, sino también para contribuir al diseño de constructos aplicables al seguimiento en etapas tempranas del desarrollo renal en pez cebra.BiólogoPregrado20 hojasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesBiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias BiológicasDiseño de constructo para marcación de tejido pronéfrico en pez cebra (Danio rerio)Trabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPPeces cebraRegeneración (Biología)Biotecnología animalBiología201417203Publicationhttps://scholar.google.es/citations?user=J1xQFB4AAAAJvirtual::8307-10000-0001-5671-7017virtual::8307-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001443145virtual::8307-14033451d-4829-428f-99e0-968786798fcbvirtual::8307-14033451d-4829-428f-99e0-968786798fcbvirtual::8307-1THUMBNAIL23703.pdf.jpg23703.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg23975https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/98e97a14-7b79-4ac6-873f-34a31a54ef8e/downloadfb6c5edadda7b90a7879b2a8cddaf218MD55TEXT23703.pdf.txt23703.pdf.txtExtracted texttext/plain48285https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/9f48de73-6f32-4b84-9176-95657b82f645/downloadbc3fc543b5aa4bf1d257d145bb8fa883MD54ORIGINAL23703.pdfapplication/pdf1401060https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/c6c6be00-ba72-4e41-bb69-66a00e984b84/download85de1dc4c9db9e7610259bbe8a8defbeMD511992/51251oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/512512024-03-13 13:38:54.084http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co