Evaluación de aplicaciones biomédicas de la Uncaria Tomentosa por medio de las interacciones entre proteínas y ligandos
En este documento se analiza la compatibilidad entre los compuestos presentes en la Uncaria Tomentosa, una planta medicinal peruana, y diferentes objetivos o proteínas de enfermedades que se encuentran en PLA-net. Se encontraron 10 compuestos de la Uncaria Tomentosa que logran interacción con al men...
- Autores:
-
González Chimá, Paula Andrea
Ortiz Mateus, Geraldyne
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/59018
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/59018
- Palabra clave:
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En este documento se analiza la compatibilidad entre los compuestos presentes en la Uncaria Tomentosa, una planta medicinal peruana, y diferentes objetivos o proteínas de enfermedades que se encuentran en PLA-net. Se encontraron 10 compuestos de la Uncaria Tomentosa que logran interacción con al menos 1 de las 12 proteínas interactuantes con estos compuestos. Se organizó las probabilidades de interacción con respecto a las proteínas de cada uno de los compuestos. Por otro lado, se graficó los porcentajes de cada estructura secundaria que conforman cada una de las 12 proteínas. Además, se encontró que el flavonoide es el compuesto que interactúa con mayor número de proteínas siendo en total 6. Por último, se cuenta que la posible unión entre el Ácido Ursólico con el DHI1 tiene una probabilidad de interacción del 0.9999, siendo así la posible unión con mayor probabilidad del estudio. |
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Se organizó las probabilidades de interacción con respecto a las proteínas de cada uno de los compuestos. Por otro lado, se graficó los porcentajes de cada estructura secundaria que conforman cada una de las 12 proteínas. Además, se encontró que el flavonoide es el compuesto que interactúa con mayor número de proteínas siendo en total 6. Por último, se cuenta que la posible unión entre el Ácido Ursólico con el DHI1 tiene una probabilidad de interacción del 0.9999, siendo así la posible unión con mayor probabilidad del estudio.El descubrimiento de nuevos medicamentos y de formas para aliviar las dolencias de los seres humanos ha sido un tema muy importante desde el inicio de las civilizaciones. Estos medicamentos se basaban, inicialmente, en los ungüentos y mezclas provenientes de las plantas medicinales. Estos medicamentos han cambiado de forma y de métodos para elaborarlos a lo largo de los años. Actualmente, se utiliza el método en donde se busca que un objetivo, el cual es una proteína de alguna enfermedad, tenga afinidad con un ligando, el cuál es un compuesto. Estos métodos tienen algunas desventajas por lo que las herramientas computacionales mejoran el tiempo y el dinero invertido en las investigaciones. En este documento se analiza la compatibilidad entre los compuestos presentes en la Uncaria Tomentosa, una planta medicinal peruana, y diferentes objetivos o proteínas de enfermedades que se encuentran en PLA-net. Se encontraron 10 compuestos de la Uncaria Tomentosa que logran interacción con al menos 1 de las 12 proteínas interactuantes con estos compuestos.Ingeniero QuímicoPregradoIngeniería Química10 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesIngeniería QuímicaFacultad de IngenieríaDepartamento de Ingeniería Química y de AlimentosEvaluación de aplicaciones biomédicas de la Uncaria Tomentosa por medio de las interacciones entre proteínas y ligandosTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPUncaria TomentosaAplicaciones biomédicasLigandosProteínasInteraccionesIngenieríaF. Chast, "A History of Drug Discovery", The Practice of Medicinal Chemistry, pp. 1-62, 2008. Available: 10.1016/b978-0-12-374194-3.00001-9L. Iversen, Una Brevísima Introducción a Los Medicamentos. Ciudad de México: Editorial Oceano de Mexico, 2017, pp. 2-10.R. Service, "Pills give patients a shot inside the stomach", Science, vol. 363, no. 6427, pp. 571-571, 2019. Available: 10.1126/science.363.6427.571The practice of medicinal chemistry, 3rd ed. Amsterdam: Elsevier/Academic Press, 2008, pp. 1, 3-62.A. Lavecchia and C. Cerchia, "In silico methods to address polypharmacology: current status, applications and future perspectives", Drug Discovery Today, vol. 21, no. 2, pp. 288-298, 2016. Available: 10.1016/j.drudis.2015.12.007T. Bartfai and G. Lees, Drug discovery. Amsterdam: Elsevier/AP, 2006, pp. 79-158.F. SAMSDODD, "Target-based drug discovery: is something wrong?", Drug Discovery Today, vol. 10, no. 2, pp. 139-147, 2005. Available: 10.1016/s1359-6446(04)03316-1J. Wilson et al., "Scientific considerations for global drug development", Science Translational Medicine, vol. 12, no. 554, 2020. Available: 10.1126/scitranslmed.aax2550R. Winslow, N. Trayanova, D. Geman and M. 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Sternberg, "The Phyre2 web portal for protein modeling, prediction and analysis", Nature Protocols, vol. 10, no. 6, pp. 845-858, 2015. Available: 10.1038/nprot.2015.053.I. UCBL, "NPS@ : GOR4 secondary structure prediction", Npsa-prabi.ibcp.fr, 2016. [Online]. Available: https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_gor4.html."PubChem", Pubchem.ncbi.nlm.nih.gov, 2022. [Online]. Available: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/.S. Martínez Flórez, J. González Gallejo, J. Culebras and M. Tuñón, "Los flavonoides: propiedades y acciones antioxidantes", Nutrición hospitalaria, vol. 17, no. 6, pp. 271-278, 2002.D. Limón, A. Díaz, L. Mendieta, F. Luna, E. Zenteno and J. Guevara, "Los flavonoides: mecanismo de acción, neuroprotección y efectos farmacológicos", Mensaje Bioquímico, vol. 34, no. 1, pp. 143-155, 2010.201716363201718176Publicationhttps://scholar.google.es/citations?user=2vO8IrIAAAAJvirtual::6093-10000-0001-7251-5298virtual::6093-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001574664virtual::6093-17bc6dc94-4e9c-4245-8b42-9f7dbc69de83virtual::6093-110c65e28-e393-4bfe-91e5-f3a7d32e6771virtual::6094-17bc6dc94-4e9c-4245-8b42-9f7dbc69de83virtual::6093-110c65e28-e393-4bfe-91e5-f3a7d32e6771virtual::6094-1CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/8aa6516c-86ca-46da-b8c0-d4b25c3bed0a/download4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347MD52TEXTEvaluacion de aplicaciones biomédicas de la Uncaria Tomentosa por medio de las interacciones entre proteínas y ligandos.pdf.txtEvaluacion de aplicaciones biomédicas de la Uncaria Tomentosa por medio de las interacciones entre proteínas y ligandos.pdf.txtExtracted texttext/plain31167https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/3adb76fe-5452-4626-891c-99154fbadefc/download1753993889b3dd58e4fd7d7b38d0bc5bMD55Formato de autorización y entrega de tesis:trabajo de grado al sistema de bibliotecas.pdf.txtFormato de autorización y entrega de tesis:trabajo de grado al sistema de bibliotecas.pdf.txtExtracted texttext/plain1163https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/4e83aba0-7ea7-4c3d-94e0-54ad6ba6b2d7/download4491fe1afb58beaaef41a73cf7ff2e27MD57THUMBNAILEvaluacion de aplicaciones biomédicas de la Uncaria Tomentosa por medio de las interacciones entre proteínas y ligandos.pdf.jpgEvaluacion de aplicaciones biomédicas de la Uncaria Tomentosa por medio de las interacciones entre proteínas y ligandos.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg29893https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/a3dd7146-c491-44eb-b7bd-5a67128e6e54/download20d102b1303fef4cd26bf58b47adf690MD56Formato de autorización y entrega de tesis:trabajo de grado al sistema de bibliotecas.pdf.jpgFormato de autorización y entrega de tesis:trabajo de grado al sistema de bibliotecas.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg17113https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/02e825b8-13a6-4375-a07c-81b574b7564b/download9cdf2ed7aec8235119ff4c8b79d72f6eMD58LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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