Caracterización antigénica In Silico de las proteínas de unión a la fibronectina A y B, y del factor de aglutinación A de Staphylococcus aureus como candidatos vacunales para la prevención de mastisis subclínica en Bos taurus
In silico approach of vaccine candidates for Staphylococcus aureus that causes subclinical mastitis in Bos taurus was carried out. This, by bioinformatic analysis of sequences from fibronectin B binding proteins and the agglutination factor A genes, this sequences obtained from S. aureus strains fro...
- Autores:
-
Corredor Rodríguez, José Daniel
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/51329
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/51329
- Palabra clave:
- Mastitis bovina
Staphylococcus aureus
Fibronectinas
Microbiología
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In silico approach of vaccine candidates for Staphylococcus aureus that causes subclinical mastitis in Bos taurus was carried out. This, by bioinformatic analysis of sequences from fibronectin B binding proteins and the agglutination factor A genes, this sequences obtained from S. aureus strains from the Agrosavia collection of Microorganisms of interest in animal health. Subsequently, reported sequences of these proteins were included in the analysis and, additionally, reported sequences of the fibronectin A binding protein. Through predictions of the secondary and tertiary structure of these proteins, in addition to the analysis of the interaction with the respective ligands and predictions of antigenicity of the proteins, antigenic domains were identified. Finally, the prediction of candidate epitopes capable of generating a humoral response that allows preventing cases of subclinical mastitis was carried out. |
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Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Jiménez Velázquez, Sabrina del Carmen4f7cf735-3fa0-4cd4-b2d0-75e26fcf5977500Celis Ramírez, Adriana Marcelavirtual::8806-1Corredor Rodríguez, José Daniel265e7736-ec08-457b-baac-acfad4222b73400Lattig Matiz, María ClaudiaCelis Ramírez, Adriana MarcelaGaravito Aguilar, Zayra VivianaHernández Amaya, Luis Carlos2021-08-10T18:20:28Z2021-08-10T18:20:28Z2020http://hdl.handle.net/1992/5132923501.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/In silico approach of vaccine candidates for Staphylococcus aureus that causes subclinical mastitis in Bos taurus was carried out. This, by bioinformatic analysis of sequences from fibronectin B binding proteins and the agglutination factor A genes, this sequences obtained from S. aureus strains from the Agrosavia collection of Microorganisms of interest in animal health. Subsequently, reported sequences of these proteins were included in the analysis and, additionally, reported sequences of the fibronectin A binding protein. Through predictions of the secondary and tertiary structure of these proteins, in addition to the analysis of the interaction with the respective ligands and predictions of antigenicity of the proteins, antigenic domains were identified. Finally, the prediction of candidate epitopes capable of generating a humoral response that allows preventing cases of subclinical mastitis was carried out.Se realizó una aproximación In silico de candidatos vacunales para Staphylococcus aureus causante de mastitis subclínica en Bos taurus. Lo anterior, mediante el análisis bioinformático de secuencias de los genes de las proteínas de unión a la fibronectina B y el factor de aglutinación A, obtenidos de cepas de S. aureus de la colección de Microorganismos de interés en salud animal de Agrosavia. Posteriormente, se incluyeron en el análisis secuencias de estas proteínas reportadas en la literatura y, adicionalmente, secuencias reportadas de la proteína de unión a la fibronectina A. Por medio de predicciones de la estructura secundaria y terciaria de estas proteínas, además del análisis de la interacción con los respectivos ligandos y predicciones de antigenicidad de las proteínas, se identificaron dominios antigénicos. Finalmente, se realizó la predicción de epítopes candidatos potencialmente capaces de generar una respuesta humoral que permita prevenir casos de mastitis subclínica.MicrobiólogoPregrado15 hojasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesMicrobiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias BiológicasCaracterización antigénica In Silico de las proteínas de unión a la fibronectina A y B, y del factor de aglutinación A de Staphylococcus aureus como candidatos vacunales para la prevención de mastisis subclínica en Bos taurusTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPMastitis bovinaStaphylococcus aureusFibronectinasMicrobiología201511670Publication0000-0003-3057-1966virtual::8806-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000178225virtual::8806-17ec7a7b4-b510-4816-b236-023aaa0754f0virtual::8806-17ec7a7b4-b510-4816-b236-023aaa0754f0virtual::8806-1TEXT23501.pdf.txt23501.pdf.txtExtracted texttext/plain58529https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/aec28088-1ed4-4683-9f05-d7dd1b536485/download44b9cb332691561fc1f1962964489aaaMD54THUMBNAIL23501.pdf.jpg23501.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg29885https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/1df61deb-b5ea-46c3-aae0-7fb252cbceb5/download81d1414eb375677ee1c261e38c60a501MD55ORIGINAL23501.pdfapplication/pdf1214444https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/d203f24c-c45c-4ddd-b7b9-4a37521e2d0e/downloadf51a29da61929e26c9c7cca281dab63aMD511992/51329oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/513292024-11-14 14:50:04.365http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |