Development of a software solution for genome alignment

"En este trabajo presentamos una nueva solución de software para el alineamiento de genomas completos a través de la identificación eficiente de bloques sinténicos construidos a partir de cadenas largas de genes ortólogos. En contraste con herramientas clásicas que construyen alineamientos basados solamente en secuencias similares, las cadenas de ortólogos permite el alineamiento entre cromosomas y genomas muy grandes en solo minutos, con pocos procesadores y 8Gb de memoria RAM. Nuestra solución fue comparada contra algunas de las herramientas más comunes para hacer genómica comparativa, requiriendo significativamente menos tiempo y recursos computacionales para procesar genomas de gran tamaño. Adicionalmente, usando tecnologías de visualización de última generación, proporcionamos vistas novedosas e interactivas del alineamiento generado por nuestro software. Esperamos que este desarrollo represente una contribución importante al campo de la genómica comparativa, facilitando descubrimientos en evolución, genómica funcional y campos relativos." -- Tomado del Formato de Documento de Grado.

• Autores: Tello Velasco, Daniel
• Fecha de publicación: 2018
• Institución: Universidad de los Andes
• Repositorio: Séneca: repositorio Uniandes
• Idioma: eng
• OAI Identifier: oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/35046
• Acceso en línea: http://hdl.handle.net/1992/35046
• Palabra clave: Genómica comparativa - Programas para computador - Investigaciones; Biología computacional - Investigaciones; Genómica - Procesamiento de datos - Investigaciones; Complejidad computacional - Investigaciones; Algoritmos genéticos - Investigaciones; Biología
• Rights: openAccess
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