Evaluación de candidatos a efectores de Phytophthora betacei como posibles factores de virulencia

Algunas plantas de la familia Solanaceae se ven afectadas por diferentes patógenos que comprometen la salud y funcionamiento de la planta y por tanto la producción de ésta. Dentro de los patógenos más importantes que atacan esta familia se encuentran los oomicetes hemibiotrofos del género Phytophtho...

Full description

Autores:
Quevedo Sarmiento, Cristian David
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/54000
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/1992/54000
Palabra clave:
Phytophthora betacei
Tomate de árbol
Efectores
Microbiología
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description Algunas plantas de la familia Solanaceae se ven afectadas por diferentes patógenos que comprometen la salud y funcionamiento de la planta y por tanto la producción de ésta. Dentro de los patógenos más importantes que atacan esta familia se encuentran los oomicetes hemibiotrofos del género Phytophthora que causan la enfermedad conocida como el tizón tardío. Recientemente, se ha encontrado en Colombia una nueva especie, Phytophthora betacei, la cual presenta una preferencia de hospedero por la planta de tomate de árbol. Estudios de comparación realizados con el grupo de proteínas codificadas por P. infestans y P. betacei muestran que esta última presenta proteínas potencialmente efectoras que no tiene P. infestans y que posiblemente puedan ayudar a explicar su preferencia de hospedero. En este estudio se realizó la preparación de la metodología para la evaluación de algunos candidatos a efectores de P. betacei para comprobar su papel como efectores mediante agro-infiltración y expresión transitoria en Nicotiana benthamiana determinando la interacción de los candidatos con la proteína inductora de necrosis PiNPP1.1. Se realizó el análisis y selección de las proteínas a evaluar, el diseño de primers, estandarización de los protocolos de PCR y se realizaron los primeros ensayos de clonación y transformación.
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Dentro de los patógenos más importantes que atacan esta familia se encuentran los oomicetes hemibiotrofos del género Phytophthora que causan la enfermedad conocida como el tizón tardío. Recientemente, se ha encontrado en Colombia una nueva especie, Phytophthora betacei, la cual presenta una preferencia de hospedero por la planta de tomate de árbol. Estudios de comparación realizados con el grupo de proteínas codificadas por P. infestans y P. betacei muestran que esta última presenta proteínas potencialmente efectoras que no tiene P. infestans y que posiblemente puedan ayudar a explicar su preferencia de hospedero. En este estudio se realizó la preparación de la metodología para la evaluación de algunos candidatos a efectores de P. betacei para comprobar su papel como efectores mediante agro-infiltración y expresión transitoria en Nicotiana benthamiana determinando la interacción de los candidatos con la proteína inductora de necrosis PiNPP1.1. Se realizó el análisis y selección de las proteínas a evaluar, el diseño de primers, estandarización de los protocolos de PCR y se realizaron los primeros ensayos de clonación y transformación.Some plants of the Solanaceae family are affected by different pathogens that compromise the health and functioning of the plant and therefore its production. Among the most important pathogens that attack this family are the hemibiotrophic oomycetes of the genus Phytophthora which cause the disease known as late blight. Recently, a new species, Phytophthora betacei, has been described in Colombia, which presents a host preference for the tree tomato plant. Comparison studies carried out with the group of proteins encoded by P. infestans and P. betacei show that the latter has putative effector proteins that P. infestans does not have and that may possibly help explain its host preference. In this study, the preparation of the methodology for the evaluation of some putative effectors of P. betacei was carried out to verify their role as effectors through agro-infiltration assays and transient expression in Nicotiana benthamiana by determining the interaction of the candidates with the necrosis-inducing protein. PiNPP1.1. Analysis and selection of the proteins to be evaluated, primers design, PCR protocols standarization and first cloning and transformation tests were carried out.MicrobiólogoPregrado15 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesMicrobiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias BiológicasEvaluación de candidatos a efectores de Phytophthora betacei como posibles factores de virulenciaTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPPhytophthora betaceiTomate de árbolEfectoresMicrobiología201317640Publicationhttps://scholar.google.es/citations?user=vQ9yFZoAAAAJvirtual::6852-1https://scholar.google.es/citations?user=7_dVIeAAAAAJvirtual::6853-10000-0002-3557-697Xvirtual::6852-10000-0001-9016-1040virtual::6853-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000296775virtual::6851-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000622354virtual::6852-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000468800virtual::6853-1cc60ebb6-b856-4f56-b942-f2b217eb6c75virtual::6851-14e93f81c-d517-4226-80b7-2c5d693a24f4virtual::6852-1d7d594d1-aae9-471e-be1d-fc6bbcabef5cvirtual::6853-1cc60ebb6-b856-4f56-b942-f2b217eb6c75virtual::6851-14e93f81c-d517-4226-80b7-2c5d693a24f4virtual::6852-1d7d594d1-aae9-471e-be1d-fc6bbcabef5cvirtual::6853-1ORIGINAL25060.pdfapplication/pdf411004https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/6088f4a3-b3b3-4a07-a8a2-b3854991d38a/download68cc82ec5e67411762f820155b9e3ddfMD51TEXT25060.pdf.txt25060.pdf.txtExtracted texttext/plain38550https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/86e9e084-a4e9-4704-9168-ea6498bcd87b/download74963dd59361a0fa50521c712b2afd79MD54THUMBNAIL25060.pdf.jpg25060.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg23819https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/ab5428b4-d4ed-4cb5-bd47-e4f69fc5e7dc/downloadfbbee52427825d067959b0256e011131MD551992/54000oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/540002024-03-13 13:17:18.803http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co

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