Walking the tightrope : genomic characterization of the bumblebee Bombus atratus in Colombia
In recent years, habitat loss and climate change have been one of the main causes of the decline of pollinator insects of high importance. However, one of the most affected groups has been the bumblebees of the genus Bombus. In Colombia, the dynamics and processes of dispersion of these species in l...
- Autores:
-
Peña Polanía, Julián Felipe
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/43968
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/43968
- Palabra clave:
- Abejorros
Abejorros - Distribución geográfica - Investigaciones - Colombia
Abejorros - Variación genética - Investigaciones - Colombia
Biología
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- openAccess
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In recent years, habitat loss and climate change have been one of the main causes of the decline of pollinator insects of high importance. However, one of the most affected groups has been the bumblebees of the genus Bombus. In Colombia, the dynamics and processes of dispersion of these species in landscapes affected by humans remain unknown. Since the change in habitat can increase intrinsic threats to populations, including genetic drift and inbreeding, the use of molecular tools in conjunction with population genetics is essential to understand the most basic levels of biological diversity, and identify the genetic status of populations affected by changes in the landscape. We examine the patterns of genetic diversity and how environmental factors can shape it through the use of NextRAD, in a population of bumblebees of the species Bombus atratus, which has a range of distribution that overlaps highly agricultural ecosystems. Our results reveal a low genetic differentiation among sample localities, suggesting a low effect of land use on genetic flow. However, we found a negative correlation between genetic diversity and land use, this indicated that environmental variables at the local level are what are shaping genetic variations. We identified several loci under selection, a subset of which was associated with land use, taken as the percentage of surface surrounding each sampling site. Our findings shed important light on the life history of B. atratus and highlight the role of land use as a phenomenon of change regarding the genetic diversity of these bumblebees. Likewise, our research reveals for the first time patterns of local adaptation in this species in Colombia. |
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Since the change in habitat can increase intrinsic threats to populations, including genetic drift and inbreeding, the use of molecular tools in conjunction with population genetics is essential to understand the most basic levels of biological diversity, and identify the genetic status of populations affected by changes in the landscape. We examine the patterns of genetic diversity and how environmental factors can shape it through the use of NextRAD, in a population of bumblebees of the species Bombus atratus, which has a range of distribution that overlaps highly agricultural ecosystems. Our results reveal a low genetic differentiation among sample localities, suggesting a low effect of land use on genetic flow. However, we found a negative correlation between genetic diversity and land use, this indicated that environmental variables at the local level are what are shaping genetic variations. We identified several loci under selection, a subset of which was associated with land use, taken as the percentage of surface surrounding each sampling site. Our findings shed important light on the life history of B. atratus and highlight the role of land use as a phenomenon of change regarding the genetic diversity of these bumblebees. Likewise, our research reveals for the first time patterns of local adaptation in this species in Colombia."En los últimos años, la pérdida de hábitat y el cambio climático han sido una de las principales causas del declive de los insectos polinizadores de gran importancia. Sin embargo, uno de los grupos más afectados ha sido los abejorros del género Bombus. En Colombia, la dinámica y los procesos de dispersión de estas especies en paisajes afectados por humanos siguen siendo desconocidos. Dado que el cambio en el hábitat puede aumentar las amenazas intrínsecas a las poblaciones, incluida la deriva genética y la endogamia, el uso de herramientas moleculares junto con la genética de poblaciones es esencial para comprender los niveles más básicos de diversidad biológica e identificar el estado genético de las poblaciones afectadas por los cambios. en el paisaje Examinamos los patrones de diversidad genética y cómo los factores ambientales pueden moldearla mediante el uso de NextRAD, en una población de abejorros de la especie Bombus atratus, que tiene un rango de distribución que se superpone a ecosistemas altamente agrícolas. Nuestros resultados revelan una baja diferenciación genética entre las localidades de la muestra, lo que sugiere un bajo efecto del uso de la tierra en el flujo genético. Sin embargo, encontramos una correlación negativa entre la diversidad genética y el uso de la tierra, esto indicó que las variables ambientales a nivel local son las que están dando forma a las variaciones genéticas. Identificamos varios loci bajo selección, un subconjunto de los cuales estaba asociado con el uso de la tierra, tomado como el porcentaje de la superficie que rodea cada sitio de muestreo. Nuestros hallazgos arrojan luz importante sobre la historia de vida de B. atratus y destacan el papel del uso de la tierra como un fenómeno de cambio con respecto a la diversidad genética de estos abejorros. Asimismo, nuestra investigación revela por primera vez patrones de adaptación local en esta especie en Colombia."--Tomado del Formato de Documento de Grado.Magíster en Ciencias BiológicasMaestría35 hojasapplication/pdfengUniandesMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasDepartamento de Biologíainstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional SénecaWalking the tightrope : genomic characterization of the bumblebee Bombus atratus in ColombiaTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMAbejorrosAbejorros - Distribución geográfica - Investigaciones - ColombiaAbejorros - Variación genética - Investigaciones - ColombiaBiologíaPublicationTEXTu830529.pdf.txtu830529.pdf.txtExtracted texttext/plain72717https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/080fa349-d514-4817-a590-bc3d01a30e85/downloadabf6dc7fcee778964f9e403485eee8d6MD54ORIGINALu830529.pdfapplication/pdf1749183https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/5d166c32-422e-4ac2-aa5b-a5601f6f8781/downloadd9a9481d3376cefcc00a3aef7806c362MD51THUMBNAILu830529.pdf.jpgu830529.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6696https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/ea773aae-3ecd-438f-b2dc-c8cb438670e8/downloade1dcbc47105eeceb7d5e9fc305e4ff46MD551992/43968oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/439682023-10-10 19:47:49.397http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |