Identificación de especies de Neocosmospora asociadas a micosis humanas usando MALDI-TOF
Algunas especies de fusaria que se encuentran en los géneros Fusarium y Neocosmospora se han reportado como saprofitos de suelo asociados a enfermedades en plantas, animales y humanos, donde el rango de infección puede incluir desde infecciones superficiales como onicomicosis y queratitis hasta infe...
- Autores:
-
Gutiérrez Pardo, Yinneth Marcela
Guevara Suárez, Marcela Isabel
Parra Giraldo, Claudia
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/44583
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/44583
- Palabra clave:
- Fusarium Oxysporum
Espectrometría de masas
Proteínas
Microbiología
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- openAccess
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Algunas especies de fusaria que se encuentran en los géneros Fusarium y Neocosmospora se han reportado como saprofitos de suelo asociados a enfermedades en plantas, animales y humanos, donde el rango de infección puede incluir desde infecciones superficiales como onicomicosis y queratitis hasta infecciones diseminadas. En los últimos años, las infecciones ocasionadas por estos géneros han incrementado, con una alta tasa de falla terapéutica. Por otra parte, la clasificación taxonómica actual es controversial haciendo igualmente difícil la correcta identificación de estos hongos. Con lo cual implementar otros métodos además de los que actualmente se utilizan con los acercamientos convencionales mediante el uso de criterios morfológicos y la identificación molecular son necesarios para hacer el diagnóstico oportuno de estas infecciones de forma acertada y rápida. Es por esto, que el MALDI-TOF es una alternativa novedosa para el diagnóstico de estas infecciones, sin embargo, debido a dichos cambios taxonómicos dentro de este grupo de hongos, es importante la actualización de las bases de datos de las mismas. El objetivo del presente estudio fue caracterizar un grupo de aislamientos clínicos de Neocosmospora usando MALDI-TOF. Para ello, se procedió a hacer una confirmación molecular de la subunidad ARN polimerasa (RPB2) para los aislamientos a evaluar y posteriormente se realizó el protocolo de MALDI-TOF para su identificación. Entre los resultados obtenidos, se encuentra que MALDI-TOF tuvo un nivel de concordancia aceptable estadísticamente con la identificación molecular ya que esta identifico a nivel de complejo al que pertenecían los aislamientos. Sin embargo, y dado las inconsistencias obtenidas en este estudio, es necesario llevar a cabo análisis adicionales que permitan asertivamente actualizar las bases de datos de MALDI-TOF. |
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En los últimos años, las infecciones ocasionadas por estos géneros han incrementado, con una alta tasa de falla terapéutica. Por otra parte, la clasificación taxonómica actual es controversial haciendo igualmente difícil la correcta identificación de estos hongos. Con lo cual implementar otros métodos además de los que actualmente se utilizan con los acercamientos convencionales mediante el uso de criterios morfológicos y la identificación molecular son necesarios para hacer el diagnóstico oportuno de estas infecciones de forma acertada y rápida. Es por esto, que el MALDI-TOF es una alternativa novedosa para el diagnóstico de estas infecciones, sin embargo, debido a dichos cambios taxonómicos dentro de este grupo de hongos, es importante la actualización de las bases de datos de las mismas. El objetivo del presente estudio fue caracterizar un grupo de aislamientos clínicos de Neocosmospora usando MALDI-TOF. Para ello, se procedió a hacer una confirmación molecular de la subunidad ARN polimerasa (RPB2) para los aislamientos a evaluar y posteriormente se realizó el protocolo de MALDI-TOF para su identificación. Entre los resultados obtenidos, se encuentra que MALDI-TOF tuvo un nivel de concordancia aceptable estadísticamente con la identificación molecular ya que esta identifico a nivel de complejo al que pertenecían los aislamientos. Sin embargo, y dado las inconsistencias obtenidas en este estudio, es necesario llevar a cabo análisis adicionales que permitan asertivamente actualizar las bases de datos de MALDI-TOF."Some fusaria species found in the Fusarium and Neocosmospora genera have been reported as soil saprophytes associated with diseases in plants, animals and humans, where the range of infection can vary from superficial infections such as onychomycosis and keratitis to disseminated infections. In recent years, infections caused by these genera have increased, with a high rate of therapeutic failure. On the other hand, the current taxonomic classification is controversial, which makes the correct identification of these fungi equally difficult. Therefore, the implementation of other methods in addition to those currently used with specific approaches through the use of morphological criteria and molecular identification are necessary to make the timely diagnosis of these infections correctly and quickly. Therefore, MALDI-TOF is a novel alternative for the diagnosis of these infections, however, due to these taxonomic changes within this group of fungi, it is important to update their databases. The objective of the present study was to characterize a group of clinical isolates of Neocosmospora using MALDI-TOF. For this, a molecular confirmation procedure of the RNA polymerase subunit (RPB2) was performed for the isolates under evaluation and subsequently the MALDI-TOF protocol was performed for identification. Among the results obtained, it is found that MALDI-TOF had a statistically acceptable level according to molecular identification since this is a level of complex to which the isolates belonged. However, given the inconsistencies obtained in this study, it is necessary to carry out an additional analysis that can assertively update the MALDI-TOF databases."--Tomado del Formato de Documento de Grado.MicrobiólogoPregrado9 hojasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesMicrobiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias Biológicasinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional SénecaIdentificación de especies de Neocosmospora asociadas a micosis humanas usando MALDI-TOFTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPFusarium OxysporumEspectrometría de masasProteínasMicrobiologíaPublication0000-0003-3057-1966virtual::13000-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000178225virtual::13000-17ec7a7b4-b510-4816-b236-023aaa0754f0virtual::13000-17ec7a7b4-b510-4816-b236-023aaa0754f0virtual::13000-1ORIGINALu830727.pdfapplication/pdf218826https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/794f8669-1899-4c8f-bff5-eac575dead75/download986894365164778cf073ad6babc067b1MD51TEXTu830727.pdf.txtu830727.pdf.txtExtracted texttext/plain23523https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/2a7f7a1d-1a04-43f5-bc68-aa1bf3de150e/downloada14cc4929a2abfef9392ce85fb23e710MD54THUMBNAILu830727.pdf.jpgu830727.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg22338https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/16672b39-90d8-4cd8-bc8a-59d79a51914d/download0a384f875b3221ced8beb63db31c237eMD551992/44583oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/445832024-03-13 14:49:47.726http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |