Assembly process and structure of the platelet Glycoprotein Ib membrane receptor studied through multi-scale simulations
Las interacciones lípido-proteína tienen un rol clave en organismos vivos. Durante la hemostasis las plaquetas se adhieren a sitios de lesión vascular para crear un tapón que detiene el sangrado, y hay evidencia que sugiere que los receptores de plaqueta que intervienen en este proceso son regulados...
- Autores:
-
Orjuela Zúñiga, Juan David
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/43920
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/43920
- Palabra clave:
- Glucoproteinas - Investigaciones
Hemostasis - Investigaciones
Dinámica molecular - Investigaciones
Física
- Rights
- openAccess
- License
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
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Las interacciones lípido-proteína tienen un rol clave en organismos vivos. Durante la hemostasis las plaquetas se adhieren a sitios de lesión vascular para crear un tapón que detiene el sangrado, y hay evidencia que sugiere que los receptores de plaqueta que intervienen en este proceso son regulados por interacciones lípido-proteína. En particular se ha mostrado que el receptor glicoproteína Ib solamente es activado en presencia de balsas lipídicas enriquecidas con glicosfingolípidos. Sin embargo, no se comprende bien el mecanismo molecular detrás de esta activación mediada por lípidos. Aquí examinamos ese interrogante modelando el complejo y haciendo simulaciones atomísticas de dinámica molecular con muestreo mejorado y simulaciones de grano grueso de varios microsegundos. Nuestras simulaciones preliminares revelaron el mecanismo por el cual la glicoproteína Ib se emsambla para formar un complejo funcional. Nuestros datos destacan interacciones entre residuos clave para la estabilidad del complejo y dan una intuición sobre el papel de las balsas de glicosfingolípidos en la función de este receptor... |
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