Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea

El efecto de los mecanismos evolutivos en la divergencia de un sistema dado, y las bases genéticas de las diferencias fenotípicas son aún temas centrales en evolución. En la cordillera Oriental de los Andes colombianos, habitan las especies de colibríes Coeligena bonapartei y C. helianthea, que son...

Full description

Autores:
Palacios Bustos, Diana Catalina
Tipo de recurso:
Doctoral thesis
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/49363
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/1992/49363
Palabra clave:
Coeligena bonapartei - Investigaciones
Coeligena helianthea - Investigaciones
Colibríes - Investigaciones - Andes (Región, Colombia)
Colibríes - Genética - Investigaciones
Biología
Rights
openAccess
License
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
id UNIANDES2_9f6b049eeda12fd6d02e430a66bde89f
oai_identifier_str oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/49363
network_acronym_str UNIANDES2
network_name_str Séneca: repositorio Uniandes
repository_id_str
dc.title.es_CO.fl_str_mv Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
title Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
spellingShingle Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
Coeligena bonapartei - Investigaciones
Coeligena helianthea - Investigaciones
Colibríes - Investigaciones - Andes (Región, Colombia)
Colibríes - Genética - Investigaciones
Biología
title_short Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
title_full Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
title_fullStr Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
title_full_unstemmed Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
title_sort Evolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena helianthea
dc.creator.fl_str_mv Palacios Bustos, Diana Catalina
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Cadena Ordónez, Carlos Daniel
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Palacios Bustos, Diana Catalina
dc.contributor.jury.none.fl_str_mv Lamichhaney, Sangeet
Sánchez Muñoz, Juan Armando
dc.subject.armarc.es_CO.fl_str_mv Coeligena bonapartei - Investigaciones
Coeligena helianthea - Investigaciones
Colibríes - Investigaciones - Andes (Región, Colombia)
Colibríes - Genética - Investigaciones
topic Coeligena bonapartei - Investigaciones
Coeligena helianthea - Investigaciones
Colibríes - Investigaciones - Andes (Región, Colombia)
Colibríes - Genética - Investigaciones
Biología
dc.subject.themes.none.fl_str_mv Biología
description El efecto de los mecanismos evolutivos en la divergencia de un sistema dado, y las bases genéticas de las diferencias fenotípicas son aún temas centrales en evolución. En la cordillera Oriental de los Andes colombianos, habitan las especies de colibríes Coeligena bonapartei y C. helianthea, que son muy diferentes en coloración, pero mostraron baja divergencia genética en una filogenia del género. Estas especies tienen 5 subespecies descritas entre alopátricas y simpátricas. En esta tesis estudié la evolución de C. bonapartei y C. helianthea para identificar los mecanismos evolutivos asociados a su divergencia y las bases genéticas de sus diferencias fenotípicas. Secuencié por primera vez los genomas de una muestra poblacional de colibríes, y utilicé herramientas de genómica comparativa, modelos de nicho, y comparaciones morfológicas, para aclarar las relaciones filogenéticas entre estos linajes, evaluar la hipótesis de que divergieron en presencia de flujo génico, e identificar genes candidatos asociados a sus diferencias fenotípicas
publishDate 2020
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-03-01T08:57:48Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-03-01T08:57:48Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Doctorado
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TD
format http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1992/49363
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.57784/1992/49363
dc.identifier.pdf.none.fl_str_mv u837596.pdf
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Universidad de los Andes
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional Séneca
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/
url http://hdl.handle.net/1992/49363
identifier_str_mv 10.57784/1992/49363
u837596.pdf
instname:Universidad de los Andes
reponame:Repositorio Institucional Séneca
repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/
dc.language.iso.es_CO.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.es_CO.fl_str_mv 109 hojas
dc.format.mimetype.es_CO.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.es_CO.fl_str_mv Uniandes
dc.publisher.program.es_CO.fl_str_mv Doctorado en Ciencias - Biología
dc.publisher.faculty.es_CO.fl_str_mv Facultad de Ciencias
dc.publisher.department.spa.fl_str_mv Departamento de Ciencias Biológicas
dc.source.es_CO.fl_str_mv instname:Universidad de los Andes
reponame:Repositorio Institucional Séneca
instname_str Universidad de los Andes
institution Universidad de los Andes
reponame_str Repositorio Institucional Séneca
collection Repositorio Institucional Séneca
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/ad174d37-f05a-4f15-a00d-4e6a78d79e2f/download
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/a2c5ad29-4ad7-47fe-b418-3a65ac0a1f24/download
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/c1172ed7-f748-4d3a-9703-ef8a3527677c/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 2fa7372d6fbb77cefe24f287bce777fe
431ab04830e3eb9033b3d2ee2b8fd3d3
888dcc720f775935734e149859446e83
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio institucional Séneca
repository.mail.fl_str_mv adminrepositorio@uniandes.edu.co
_version_ 1818111733723561984
spelling Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Cadena Ordónez, Carlos Danielvirtual::3508-1Palacios Bustos, Diana Catalina9677500Lamichhaney, SangeetSánchez Muñoz, Juan Armando2021-03-01T08:57:48Z2021-03-01T08:57:48Z2020http://hdl.handle.net/1992/4936310.57784/1992/49363u837596.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/El efecto de los mecanismos evolutivos en la divergencia de un sistema dado, y las bases genéticas de las diferencias fenotípicas son aún temas centrales en evolución. En la cordillera Oriental de los Andes colombianos, habitan las especies de colibríes Coeligena bonapartei y C. helianthea, que son muy diferentes en coloración, pero mostraron baja divergencia genética en una filogenia del género. Estas especies tienen 5 subespecies descritas entre alopátricas y simpátricas. En esta tesis estudié la evolución de C. bonapartei y C. helianthea para identificar los mecanismos evolutivos asociados a su divergencia y las bases genéticas de sus diferencias fenotípicas. Secuencié por primera vez los genomas de una muestra poblacional de colibríes, y utilicé herramientas de genómica comparativa, modelos de nicho, y comparaciones morfológicas, para aclarar las relaciones filogenéticas entre estos linajes, evaluar la hipótesis de que divergieron en presencia de flujo génico, e identificar genes candidatos asociados a sus diferencias fenotípicasThe evolutionary mechanisms driving lineage differentiation in a system and the genetic basis of phenotypic differentiation remain central issues in evolutionary biology. In the Colombian Andes, two hummingbird species, Coeligena bonapartei and C. helianthea, show striking phenotypic differences in coloration but low genetic differentiation in a phylogeny of the Coeligena genus. These species comprise five allopatric and sympatric subspecies. In this thesis I studied the evolution of the lineages in C. bonapartei and C. helianthea to identify the evolutionary mechanisms driving their divergence and the genetic basis of their phenotypic differences. I sequenced for the first time the genomes of a population sample of hummingbirds and I used tools from population genetics, comparative genomics, niche modeling, and comparative morphology to clarify the evolutionary relationships among lineages of Coeligena; to test the hypothesis that they diverged in the presence of gene flow; and to identify candidate genes related to their phenotypic differencesDoctor en Ciencias - BiologíaDoctorado109 hojasapplication/pdfengUniandesDoctorado en Ciencias - BiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias Biológicasinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional SénecaEvolution, speciation, and genomics of the andean hummingbirds : Coeligena bonapartei and Coeligena heliantheaTrabajo de grado - Doctoradoinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TDCoeligena bonapartei - InvestigacionesCoeligena helianthea - InvestigacionesColibríes - Investigaciones - Andes (Región, Colombia)Colibríes - Genética - InvestigacionesBiologíaPublicationhttps://scholar.google.es/citations?user=HC_mHmUAAAAJvirtual::3508-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000756580virtual::3508-111af7bde-0a26-4d8f-8dd9-4e99b1569940virtual::3508-111af7bde-0a26-4d8f-8dd9-4e99b1569940virtual::3508-1ORIGINALu837596.pdfapplication/pdf3272329https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/ad174d37-f05a-4f15-a00d-4e6a78d79e2f/download2fa7372d6fbb77cefe24f287bce777feMD51THUMBNAILu837596.pdf.jpgu837596.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg9438https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/a2c5ad29-4ad7-47fe-b418-3a65ac0a1f24/download431ab04830e3eb9033b3d2ee2b8fd3d3MD57TEXTu837596.pdf.txtu837596.pdf.txtExtracted texttext/plain242256https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/c1172ed7-f748-4d3a-9703-ef8a3527677c/download888dcc720f775935734e149859446e83MD561992/49363oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/493632024-11-14 10:33:03.604http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co