Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer
Pruebas experimentales demuestran que la enzima caspasa-l juega un papel importante en el desarrollo de la enfermedad del Alzheimer. Así, encontrar inhibidores de para esta enzima es de gran interés farmacológico. El presente estudio describe una metodología de virtual screening que permite encontra...
- Autores:
-
Ramos Guzmán, Carlos Alberto
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2016
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/13786
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/13786
- Palabra clave:
- Enzimas - Simulación por computadores - Investigaciones
Inhibidores enzimáticos
Dinámica molecular - Investigaciones
Enfermedad de Alzheimer - Investigaciones
Química
- Rights
- openAccess
- License
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
id |
UNIANDES2_9af81697bafa41a61c4c23d6a1e9fe18 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/13786 |
network_acronym_str |
UNIANDES2 |
network_name_str |
Séneca: repositorio Uniandes |
repository_id_str |
|
spelling |
Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Miscione, Gian Pietro5cf6bb80-21c5-4749-bde2-b724ac885a44500Ramos Guzmán, Carlos Alberto493b9e42-f9ad-4074-88ce-c828680d2aa8500Bohórquez, HugoJiménez Díaz, ElizabethBogotá2018-09-28T10:54:33Z2018-09-28T10:54:33Z2016http://hdl.handle.net/1992/13786u729346.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/Pruebas experimentales demuestran que la enzima caspasa-l juega un papel importante en el desarrollo de la enfermedad del Alzheimer. Así, encontrar inhibidores de para esta enzima es de gran interés farmacológico. El presente estudio describe una metodología de virtual screening que permite encontrar compuestos con mejores valores de AGbind a los reportados para los inhibidores previamente reportados. Esta metodología involucra el uso de conformaciones de la enzima provenientes de cristales y de MDS. Además, se encontraron inhibidores que interactúan con la enzima a pesar de no tener un aspartato en su estructura. Por medio de estudios de dinámica molecular se logró establecer un conjunto de interacciones proteína-inhibidor que aumentan la estabilidad del ligando en el sitio activo, las cuales no son tan evidentes en los cristales disponibles de la enzima. Estos resultados alientan a realizar pruebas in vitro a las moléculas identificadas como potenciales inhibidoresMagíster en Ciencias - QuímicaMaestría106 hojasapplication/pdfspainstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional SénecaEstudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimerTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMMaestría en QuímicaFacultad de CienciasDepartamento de QuímicaEnzimas - Simulación por computadores - InvestigacionesInhibidores enzimáticosDinámica molecular - InvestigacionesEnfermedad de Alzheimer - InvestigacionesQuímicaPublicationTEXTu729346.pdf.txtu729346.pdf.txtExtracted texttext/plain149621https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/5e6d95e3-4079-43d7-8eb2-4f4ad57c35ae/download2e947be5e74fe348b4e4c78bcb61a56dMD54ORIGINALu729346.pdfapplication/pdf40103461https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/2882a6c7-8175-4e0d-bfbc-b4e3abf13f9a/download339aeb7d5ab2d194634b5cca085b9712MD51THUMBNAILu729346.pdf.jpgu729346.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg9259https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/a2c854eb-1c99-4509-a78f-8cc5a77345cf/download7040d39067e85b02be63d4305196b8c7MD551992/13786oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/137862023-10-10 17:18:22.642http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |
dc.title.es_CO.fl_str_mv |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer |
title |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer |
spellingShingle |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer Enzimas - Simulación por computadores - Investigaciones Inhibidores enzimáticos Dinámica molecular - Investigaciones Enfermedad de Alzheimer - Investigaciones Química |
title_short |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer |
title_full |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer |
title_fullStr |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer |
title_full_unstemmed |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer |
title_sort |
Estudio de virtual screening y simulaciones de dinámica molecular aplicadas en el diseño de potentes y selectivos inhibidores de la enzima caspasa-1 hacia la enfermedad de alzheimer |
dc.creator.fl_str_mv |
Ramos Guzmán, Carlos Alberto |
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Miscione, Gian Pietro |
dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Ramos Guzmán, Carlos Alberto |
dc.contributor.jury.none.fl_str_mv |
Bohórquez, Hugo Jiménez Díaz, Elizabeth |
dc.subject.keyword.es_CO.fl_str_mv |
Enzimas - Simulación por computadores - Investigaciones Inhibidores enzimáticos Dinámica molecular - Investigaciones Enfermedad de Alzheimer - Investigaciones |
topic |
Enzimas - Simulación por computadores - Investigaciones Inhibidores enzimáticos Dinámica molecular - Investigaciones Enfermedad de Alzheimer - Investigaciones Química |
dc.subject.themes.none.fl_str_mv |
Química |
description |
Pruebas experimentales demuestran que la enzima caspasa-l juega un papel importante en el desarrollo de la enfermedad del Alzheimer. Así, encontrar inhibidores de para esta enzima es de gran interés farmacológico. El presente estudio describe una metodología de virtual screening que permite encontrar compuestos con mejores valores de AGbind a los reportados para los inhibidores previamente reportados. Esta metodología involucra el uso de conformaciones de la enzima provenientes de cristales y de MDS. Además, se encontraron inhibidores que interactúan con la enzima a pesar de no tener un aspartato en su estructura. Por medio de estudios de dinámica molecular se logró establecer un conjunto de interacciones proteína-inhibidor que aumentan la estabilidad del ligando en el sitio activo, las cuales no son tan evidentes en los cristales disponibles de la enzima. Estos resultados alientan a realizar pruebas in vitro a las moléculas identificadas como potenciales inhibidores |
publishDate |
2016 |
dc.date.issued.es_CO.fl_str_mv |
2016 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2018-09-28T10:54:33Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2018-09-28T10:54:33Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Maestría |
dc.type.coarversion.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TM |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/1992/13786 |
dc.identifier.pdf.none.fl_str_mv |
u729346.pdf |
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv |
instname:Universidad de los Andes |
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Institucional Séneca |
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv |
repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
url |
http://hdl.handle.net/1992/13786 |
identifier_str_mv |
u729346.pdf instname:Universidad de los Andes reponame:Repositorio Institucional Séneca repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
dc.language.iso.es_CO.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.rights.uri.*.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.extent.es_CO.fl_str_mv |
106 hojas |
dc.format.mimetype.es_CO.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.coverage.spatial.es_CO.fl_str_mv |
Bogotá |
dc.publisher.program.es_CO.fl_str_mv |
Maestría en Química |
dc.publisher.faculty.es_CO.fl_str_mv |
Facultad de Ciencias |
dc.publisher.department.es_CO.fl_str_mv |
Departamento de Química |
dc.source.es_CO.fl_str_mv |
instname:Universidad de los Andes reponame:Repositorio Institucional Séneca |
instname_str |
Universidad de los Andes |
institution |
Universidad de los Andes |
reponame_str |
Repositorio Institucional Séneca |
collection |
Repositorio Institucional Séneca |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/5e6d95e3-4079-43d7-8eb2-4f4ad57c35ae/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/2882a6c7-8175-4e0d-bfbc-b4e3abf13f9a/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/a2c854eb-1c99-4509-a78f-8cc5a77345cf/download |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
2e947be5e74fe348b4e4c78bcb61a56d 339aeb7d5ab2d194634b5cca085b9712 7040d39067e85b02be63d4305196b8c7 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio institucional Séneca |
repository.mail.fl_str_mv |
adminrepositorio@uniandes.edu.co |
_version_ |
1812133929659924480 |