Visualizing taxonomic reports from biological sequence alignments
En el proceso de identificación y clasificación de secuencias, el alineamiento de secuencias cumple una función muy importante. Este proceso consiste en comparar secuencias desconocidas con bases de datos biológicos que están en continuo crecimiento. Estas comparaciones producen grandes cantidades d...
- Autores:
-
Vanegas Hernández, Meili
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/34744
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/34744
- Palabra clave:
- Biología - Procesamiento electrónico de datos - Investigaciones
Biología computacional - Investigaciones
Bioinformática - Investigaciones
Análisis de datos - Investigaciones
Ingeniería
- Rights
- openAccess
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Guerra Gómez, John Alexis Hernández Peñaloza, José Tiberio |
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En el proceso de identificación y clasificación de secuencias, el alineamiento de secuencias cumple una función muy importante. Este proceso consiste en comparar secuencias desconocidas con bases de datos biológicos que están en continuo crecimiento. Estas comparaciones producen grandes cantidades de resultados y extraer información útil de dichos resultados es costoso sin una herramienta que permita resumirlos. La falta de herramientas de análisis de resultados lleva a la clasificación errónea de secuencias. Este proyecto es el resultado de una colaboración cercana con bioinformáticos y una evaluación del estado del arte. Como resultado, se presentan seis tareas comúnmente realizadas por los expertos en el área, con las cuales se buscan principalmente resumir y comparar resultados de alineamientos: para regiones de interés (AT1), reportes taxonómicos (AT2) y descripción de secuencias (AT3). AT1 es el más desarrollado por el estado del arte. Asimismo, AT2 tiene gran cobertura, sin embargo, todavía existen muchas oportunidades de mejora... |
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