Phylogenetic inferences on caribbean scleractinian corals based on ITS2 secondary structures prediction
La mayoría de los corales formadores de arrecifes pertenecen al orden Scleractinia. Históricamente, la clasificación taxonómica de este orden ha sido objeto de mucha controversia, dado que se ha basado principalmente en características morfológicas y la falta de marcadores moleculares robustos para...
- Autores:
-
Rivera Cárdenas, Gisselle Beatriz
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/43911
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/43911
- Palabra clave:
- Scleractinia - Investigaciones
Corales - Filogenia - Investigaciones - Caribe (Mar)
Filogenia - Investigaciones
Biología
- Rights
- openAccess
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La mayoría de los corales formadores de arrecifes pertenecen al orden Scleractinia. Históricamente, la clasificación taxonómica de este orden ha sido objeto de mucha controversia, dado que se ha basado principalmente en características morfológicas y la falta de marcadores moleculares robustos para dilucidar las verdaderas relaciones monofiléticas entre especies. El marcador nuclear ITS2 ha demostrado ser muy útil para reconstruir relaciones filogenéticas bien soportadas, porque las alineaciones primarias pueden corregirse de acuerdo con el plegamiento de la estructura secundaria. Este estudio presenta la reconstrucción filogenética más completa para los corales escleractinios del Caribe (44 especies) a través de este método. Las secuencias ITS2 para todas las especies de corales del Caribe se amplificaron por PCR, luego se plegaron usando la predicción de estructura secundaria considerando la mayor energía libre negativa disponible y finalmente, se analizaron a través de los métodos estadísticos de máxima probabilidad e inferencia bayesiana. Los resultados muestran la divergencia entre los dos clados principales... |
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