Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR
Un transposón o elemento transponible es una secuencia de ADN que puede moverse de manera autosuficiente a diferentes ubicaciones del genoma de una célula. Los transposones se subdividen, entre otras clases, en retrotransposones LTR, los cuales se mueven mediante la acción de intermediarios de ARN....
- Autores:
-
Villamil Pachón, Leonidas
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2025
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/75432
- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/1992/75432
- Palabra clave:
- Retrotransposon LTR
Domino proteico
Modelo de Markov oculto
Ingeniería
- Rights
- openAccess
- License
- Attribution 4.0 International
id |
UNIANDES2_70da3a1e9aecb69d7f27048f9071b93e |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/75432 |
network_acronym_str |
UNIANDES2 |
network_name_str |
Séneca: repositorio Uniandes |
repository_id_str |
|
dc.title.none.fl_str_mv |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR |
title |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR |
spellingShingle |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR Retrotransposon LTR Domino proteico Modelo de Markov oculto Ingeniería |
title_short |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR |
title_full |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR |
title_fullStr |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR |
title_full_unstemmed |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR |
title_sort |
Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR |
dc.creator.fl_str_mv |
Villamil Pachón, Leonidas |
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Duitama Castellanos, Jorge Alexander |
dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Villamil Pachón, Leonidas |
dc.subject.keyword.spa.fl_str_mv |
Retrotransposon LTR Domino proteico |
topic |
Retrotransposon LTR Domino proteico Modelo de Markov oculto Ingeniería |
dc.subject.keyword.none.fl_str_mv |
Modelo de Markov oculto |
dc.subject.themes.spa.fl_str_mv |
Ingeniería |
description |
Un transposón o elemento transponible es una secuencia de ADN que puede moverse de manera autosuficiente a diferentes ubicaciones del genoma de una célula. Los transposones se subdividen, entre otras clases, en retrotransposones LTR, los cuales se mueven mediante la acción de intermediarios de ARN. El objetivo principal de este proyecto es el desarrollo de un método para la identificación de transposones LTR. Para este fin, se desarrolló una herramienta que recibe secuencias de ADN de posibles retrotransposones LTR e identifica sus dominios y su superfamilia correspondientes. Se utilizaron modelos ocultos de markov para la identificación de los dominios y posterior clasificación por superfamilia. Los resultados muestran un alto grado de precisión en la identificación de los dominios para los retrotransposones LTR , así como una alta precisión de predicción para la superfamilia Gypsy. La herramienta desarrollada demuestra su utilidad en la identificación precisa de retrotransposones LTR y su clasificación, por medio de sus características biológicas, contribuyendo significativamente al análisis genómico. |
publishDate |
2025 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2025-01-15T20:53:24Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2025-01-15T20:53:24Z |
dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2025-01-14 |
dc.type.none.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Pregrado |
dc.type.driver.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
dc.type.version.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion |
dc.type.coar.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
dc.type.content.none.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.none.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TP |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
status_str |
acceptedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://hdl.handle.net/1992/75432 |
dc.identifier.instname.none.fl_str_mv |
instname:Universidad de los Andes |
dc.identifier.reponame.none.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Institucional Séneca |
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv |
repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
url |
https://hdl.handle.net/1992/75432 |
identifier_str_mv |
instname:Universidad de los Andes reponame:Repositorio Institucional Séneca repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
dc.language.iso.none.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.references.none.fl_str_mv |
Anwar SL, Wulaningsih W, Lehmann U. Transposable Elements in Human Cancer: Causes and Consequences of Deregulation. Int J Mol Sci. 2017 May 4;18(5):974. doi: 10.3390/ijms18050974. PMID: 28471386; PMCID: PMC5454887. Abouelhoda M, Kurtz S, Ohlebusch E. Replacing suffix trees with enhanced suffix arrays, Journal of Discrete Algorithms, Volume 2, Issue 1, 2004, Pages 53-86. Biémont C. A brief history of the status of transposable elements: from junk DNA to major players in evolution. Genetics. 2010 Dec;186(4):1085-93. doi: 10.1534/genetics.110.124180. PMID: 21156958; PMCID: PMC2998295. Correa M, Lerat E, Birmelé E, Samson F, Bouillon B, Normand K, Rizzon C. The Transposable Element Environment of Human Genes Differs According to Their Duplication Status and Essentiality. Genome Biol Evol. 2021 May 7;13(5):evab062. doi: 10.1093/gbe/evab062. Erratum in: Genome Biol Evol. 2021 Sep 1;13(9):evab175. doi: 10.1093/gbe/evab175. PMID: 33973013; PMCID: PMC8155550. Cormen, T. H., Leiserson, C. E., Rivest, R. L., & Stein, C. (2009). Introduction to algorithms (3rd ed.). MIT Press. Galindo-González L, Mhiri C, Deyholos MK, Grandbastien M-A. LTR-retrotransposons in plants: Engines of evolution. Gene. 2017;626:14-25. doi: 10.1016/j.gene.2017.04.051. Griffith, A., Wessler, S, Carroll, S; Doebley, J. (2011) Chapter 15. The Dynamic Genome: Transposable Elements. Introduction to Genetic Analysis, 10th Edition, WH Freeman publishers. Eddy, S. R. (2011). HMMER: biosequence analysis using profile hidden Markov models. HMMER. http://hmmer.org/ Ellinghaus, D., Kurtz, S. & Willhoeft, U. LTRharvest, an efficient and flexible software for de novo detection of LTR retrotransposons. BMC Bioinformatics 9, 18 (2008). https://doi.org/10.1186/1471-2105-9-18 Feschotte C, Jiang N, Wessler SR. Plant transposable elements: where genetics meets genomics. Nat Rev Genet. 2002 May;3(5):329-41. doi: 10.1038/nrg793. PMID: 11988759. Gonzalez-García LN, Lozano-Arce D, Londoño JP, Guyot R, Duitama J. Efficient homology-based annotation of transposable elements using minimizers. Appl Plant Sci. 2023 May 11;11(4):e11520. doi: 10.1002/aps3.11520. PMID: 37601317; PMCID: PMC10439823. Qiu, Y., O’Connor, C. H., Della Coletta, R., Renk, J. S., Monnahan, P. J., Noshay, J. M., Liang, Z., Gilbert, A., Anderson, S. N., McGaugh, S. E., Springer, N. M., & Hirsch, C. N. (2021). Whole-genome variation of transposable element insertions in a maize diversity panel. G3: Genes|Genomes|Genetics, 11(10) Mistry, J., Chuguransky, S., Williams, L., Qureshi, M., Salazar, G. A., Sonnhammer, E. L. L., Tosatto, S. C. E., Paladin, L., Raj, S., Richardson, L. J., Finn, R. D., & Bateman, A. (2021). Pfam: The protein families database in 2021. Nucleic Acids Research. https://doi.org/10.1093/nar/gkaa91Orozco-Arias S, Lopez-Murillo LH, Piña JS, Valencia-Castrillon E, Tabares-Soto R, Castillo-Ossa L, et al. (2023) Genomic object detection: An improved approach for transposable elements detection and classification using convolutional neural networks. PLoS ONE 18(9): e0291925. Ou S, Jiang N. LTR_retriever: A Highly Accurate and Sensitive Program for Identification of Long Terminal Repeat Retrotransposons. Plant Physiol. 2018 Feb;176(2):1410-1422. doi: 10.1104/pp.17.01310. Epub 2017 Dec 12. PMID: 29233850; PMCID: PMC5813529. Pevzner, P. A., & Compeau, P. (2014). Bioinformatics: Algorithms: An Active Learning Approach third edition. Active Learning Publishers. Pray, L. (2008) Transposons: The jumping genes. Nature Education 1(1):204. Steinbiss S, et al. Fine-grained annotation and classification of de novo predicted LTR retrotransposons. Nucleic Acids Res. 2009 Nov;37(21):7002-13. doi: 10.1093/nar/gkp759. PMID: 19786494; PMCID: PMC2790888. Smith, Temple F. & Waterman, Michael S. (1981). "Identification of Common Molecular Subsequences" (PDF). Journal of Molecular Biology. Su W, Ou S, Hufford MB, Peterson T. A Tutorial of EDTA: Extensive De Novo TE Annotator. Methods Mol Biol. 2021;2250:55-67. doi: 10.1007/978-1-0716-1134-0_4. PMID: 33900591. Swarbreck D, Wilks C, Lamesch P, et al. The Arabidopsis Information Resource (TAIR): gene structure and function annotation. Nucleic Acids Research. 2008 Jan;36(Database issue):D1009-14. DOI: 10.1093/nar/gkm965. PMID: 17986450; PMCID: PMC2238962. Watson, J. D., Baker, T. A., Bell, S. P., Gann, A., Levine, M., & Losick, R. (2014). Molecular biology of the gene (7th ed.). Pearson. (Capítulo 12: Site-Specific Recombination and Transposition of DNA). Wicker T, Sabot F, Hua-Van A, Bennetzen JL, Capy P, Chalhoub B, Flavell A, Leroy P, Morgante M, Panaud O, Paux E, SanMiguel P, Schulman AH. A unified classification system for eukaryotic transposable elements. Nat Rev Genet. 2007 Dec;8(12):973-82. doi: 10.1038/nrg2165. PMID: 17984973. Xu Z, Wang H. LTR_FINDER: an efficient tool for the prediction of full-length LTR retrotransposons. Nucleic Acids Res. 2007 Jul;35(Web Server issue):W265-8. doi: 10.1093/nar/gkm286. Epub 2007 May 7. PMID: 17485477; PMCID: PMC1933203. |
dc.rights.en.fl_str_mv |
Attribution 4.0 International |
dc.rights.uri.none.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ |
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.rights.coar.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
rights_invalid_str_mv |
Attribution 4.0 International http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.extent.none.fl_str_mv |
161 páginas |
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidad de los Andes |
dc.publisher.program.none.fl_str_mv |
Ingeniería de Sistemas y Computación |
dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv |
Facultad de Ingeniería |
dc.publisher.department.none.fl_str_mv |
Departamento de Ingeniería de Sistemas y Computación |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidad de los Andes |
institution |
Universidad de los Andes |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/e09f801c-74d2-4d09-a00a-b958b9f80ac2/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/18975384-be10-4ba8-9c52-2a47b13a6336/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/dd05232e-cecd-4f54-9b00-91a6f4dc4a8c/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/741512ad-c1d2-475d-b38a-79af1bc32f36/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/518c3873-ae36-4d0b-a5bb-9267bde54e36/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/473268c3-d5fd-4e85-9f08-7be41377a7ff/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/7c7d125a-4e25-4a1b-9b4a-4aed864ffbf2/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/80f787df-a658-45c9-a95e-b903a8ba4345/download |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
c15d6f974b0a14a1e6c68f7ec6bbeb41 a5d4c1e9952afab109617e10e3270cbe 0175ea4a2d4caec4bbcc37e300941108 ae9e573a68e7f92501b6913cc846c39f d5b23524a464ea18c002ba7e3e9fc113 a01d217318cf56b3afee86b9c80f26c4 d66b40a6c7620f644717e40518fe7201 e7b4c061219e460fc0cdfd5d753de29a |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio institucional Séneca |
repository.mail.fl_str_mv |
adminrepositorio@uniandes.edu.co |
_version_ |
1831927786222125056 |
spelling |
Duitama Castellanos, Jorge Alexandervirtual::22110-1Villamil Pachón, Leonidas2025-01-15T20:53:24Z2025-01-15T20:53:24Z2025-01-14https://hdl.handle.net/1992/75432instname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/Un transposón o elemento transponible es una secuencia de ADN que puede moverse de manera autosuficiente a diferentes ubicaciones del genoma de una célula. Los transposones se subdividen, entre otras clases, en retrotransposones LTR, los cuales se mueven mediante la acción de intermediarios de ARN. El objetivo principal de este proyecto es el desarrollo de un método para la identificación de transposones LTR. Para este fin, se desarrolló una herramienta que recibe secuencias de ADN de posibles retrotransposones LTR e identifica sus dominios y su superfamilia correspondientes. Se utilizaron modelos ocultos de markov para la identificación de los dominios y posterior clasificación por superfamilia. Los resultados muestran un alto grado de precisión en la identificación de los dominios para los retrotransposones LTR , así como una alta precisión de predicción para la superfamilia Gypsy. La herramienta desarrollada demuestra su utilidad en la identificación precisa de retrotransposones LTR y su clasificación, por medio de sus características biológicas, contribuyendo significativamente al análisis genómico.Pregrado161 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesIngeniería de Sistemas y ComputaciónFacultad de IngenieríaDepartamento de Ingeniería de Sistemas y ComputaciónAttribution 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Desarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTRTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPRetrotransposon LTRDomino proteicoModelo de Markov ocultoIngenieríaAnwar SL, Wulaningsih W, Lehmann U. Transposable Elements in Human Cancer: Causes and Consequences of Deregulation. Int J Mol Sci. 2017 May 4;18(5):974. doi: 10.3390/ijms18050974. PMID: 28471386; PMCID: PMC5454887.Abouelhoda M, Kurtz S, Ohlebusch E. Replacing suffix trees with enhanced suffix arrays, Journal of Discrete Algorithms, Volume 2, Issue 1, 2004, Pages 53-86.Biémont C. A brief history of the status of transposable elements: from junk DNA to major players in evolution. Genetics. 2010 Dec;186(4):1085-93. doi: 10.1534/genetics.110.124180. PMID: 21156958; PMCID: PMC2998295.Correa M, Lerat E, Birmelé E, Samson F, Bouillon B, Normand K, Rizzon C. The Transposable Element Environment of Human Genes Differs According to Their Duplication Status and Essentiality. Genome Biol Evol. 2021 May 7;13(5):evab062. doi: 10.1093/gbe/evab062.Erratum in: Genome Biol Evol. 2021 Sep 1;13(9):evab175. doi: 10.1093/gbe/evab175. PMID: 33973013; PMCID: PMC8155550.Cormen, T. H., Leiserson, C. E., Rivest, R. L., & Stein, C. (2009). Introduction to algorithms(3rd ed.). MIT Press.Galindo-González L, Mhiri C, Deyholos MK, Grandbastien M-A. LTR-retrotransposons in plants: Engines of evolution. Gene. 2017;626:14-25. doi: 10.1016/j.gene.2017.04.051.Griffith, A., Wessler, S, Carroll, S; Doebley, J. (2011) Chapter 15. The Dynamic Genome: Transposable Elements. Introduction to Genetic Analysis, 10th Edition, WH Freeman publishers.Eddy, S. R. (2011). HMMER: biosequence analysis using profile hidden Markov models. HMMER. http://hmmer.org/Ellinghaus, D., Kurtz, S. & Willhoeft, U. LTRharvest, an efficient and flexible software for de novo detection of LTR retrotransposons. BMC Bioinformatics 9, 18 (2008). https://doi.org/10.1186/1471-2105-9-18Feschotte C, Jiang N, Wessler SR. Plant transposable elements: where genetics meets genomics. Nat Rev Genet. 2002 May;3(5):329-41. doi: 10.1038/nrg793. PMID: 11988759.Gonzalez-García LN, Lozano-Arce D, Londoño JP, Guyot R, Duitama J. Efficient homology-based annotation of transposable elements using minimizers. Appl Plant Sci. 2023 May 11;11(4):e11520. doi: 10.1002/aps3.11520. PMID: 37601317; PMCID: PMC10439823.Qiu, Y., O’Connor, C. H., Della Coletta, R., Renk, J. S., Monnahan, P. J., Noshay, J. M., Liang, Z., Gilbert, A., Anderson, S. N., McGaugh, S. E., Springer, N. M., & Hirsch, C. N. (2021). Whole-genome variation of transposable element insertions in a maize diversity panel. G3: Genes|Genomes|Genetics, 11(10)Mistry, J., Chuguransky, S., Williams, L., Qureshi, M., Salazar, G. A., Sonnhammer, E. L. L., Tosatto, S. C. E., Paladin, L., Raj, S., Richardson, L. J., Finn, R. D., & Bateman, A. (2021). Pfam: The protein families database in 2021. Nucleic Acids Research. https://doi.org/10.1093/nar/gkaa91Orozco-Arias S, Lopez-Murillo LH, Piña JS, Valencia-Castrillon E, Tabares-Soto R, Castillo-Ossa L, et al. (2023) Genomic object detection: An improved approach for transposable elements detection and classification using convolutional neural networks. PLoS ONE 18(9): e0291925.Ou S, Jiang N. LTR_retriever: A Highly Accurate and Sensitive Program for Identification of Long Terminal Repeat Retrotransposons. Plant Physiol. 2018 Feb;176(2):1410-1422. doi: 10.1104/pp.17.01310. Epub 2017 Dec 12. PMID: 29233850; PMCID: PMC5813529.Pevzner, P. A., & Compeau, P. (2014). Bioinformatics: Algorithms: An Active Learning Approach third edition. Active Learning Publishers.Pray, L. (2008) Transposons: The jumping genes. Nature Education 1(1):204.Steinbiss S, et al. Fine-grained annotation and classification of de novo predicted LTR retrotransposons. Nucleic Acids Res. 2009 Nov;37(21):7002-13. doi: 10.1093/nar/gkp759. PMID: 19786494; PMCID: PMC2790888.Smith, Temple F. & Waterman, Michael S. (1981). "Identification of Common Molecular Subsequences" (PDF). Journal of Molecular Biology.Su W, Ou S, Hufford MB, Peterson T. A Tutorial of EDTA: Extensive De Novo TE Annotator. Methods Mol Biol. 2021;2250:55-67. doi: 10.1007/978-1-0716-1134-0_4. PMID: 33900591.Swarbreck D, Wilks C, Lamesch P, et al. The Arabidopsis Information Resource (TAIR): gene structure and function annotation. Nucleic Acids Research. 2008 Jan;36(Database issue):D1009-14. DOI: 10.1093/nar/gkm965. PMID: 17986450; PMCID: PMC2238962.Watson, J. D., Baker, T. A., Bell, S. P., Gann, A., Levine, M., & Losick, R. (2014). Molecular biology of the gene (7th ed.). Pearson. (Capítulo 12: Site-Specific Recombination and Transposition of DNA).Wicker T, Sabot F, Hua-Van A, Bennetzen JL, Capy P, Chalhoub B, Flavell A, Leroy P, Morgante M, Panaud O, Paux E, SanMiguel P, Schulman AH. A unified classification system for eukaryotic transposable elements. Nat Rev Genet. 2007 Dec;8(12):973-82. doi: 10.1038/nrg2165. PMID: 17984973.Xu Z, Wang H. LTR_FINDER: an efficient tool for the prediction of full-length LTR retrotransposons. Nucleic Acids Res. 2007 Jul;35(Web Server issue):W265-8. doi: 10.1093/nar/gkm286. Epub 2007 May 7. PMID: 17485477; PMCID: PMC1933203.202013910Publication07e4ae59-26ee-4988-9701-129fa965d270virtual::22110-107e4ae59-26ee-4988-9701-129fa965d270virtual::22110-1ORIGINALDesarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR.pdfDesarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR.pdfapplication/pdf724494https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/e09f801c-74d2-4d09-a00a-b958b9f80ac2/downloadc15d6f974b0a14a1e6c68f7ec6bbeb41MD51autorizacion tesis.pdfautorizacion tesis.pdfHIDEapplication/pdf88832https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/18975384-be10-4ba8-9c52-2a47b13a6336/downloada5d4c1e9952afab109617e10e3270cbeMD52CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8908https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/dd05232e-cecd-4f54-9b00-91a6f4dc4a8c/download0175ea4a2d4caec4bbcc37e300941108MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82535https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/741512ad-c1d2-475d-b38a-79af1bc32f36/downloadae9e573a68e7f92501b6913cc846c39fMD54TEXTDesarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR.pdf.txtDesarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR.pdf.txtExtracted texttext/plain27271https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/518c3873-ae36-4d0b-a5bb-9267bde54e36/downloadd5b23524a464ea18c002ba7e3e9fc113MD55autorizacion tesis.pdf.txtautorizacion tesis.pdf.txtExtracted texttext/plain46https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/473268c3-d5fd-4e85-9f08-7be41377a7ff/downloada01d217318cf56b3afee86b9c80f26c4MD57THUMBNAILDesarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR.pdf.jpgDesarrollo de una herramienta computacional para la identificación de retrotransposones LTR.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6992https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/7c7d125a-4e25-4a1b-9b4a-4aed864ffbf2/downloadd66b40a6c7620f644717e40518fe7201MD56autorizacion tesis.pdf.jpgautorizacion tesis.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg8743https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/80f787df-a658-45c9-a95e-b903a8ba4345/downloade7b4c061219e460fc0cdfd5d753de29aMD581992/75432oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/754322025-03-05 10:02:42.452http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/Attribution 4.0 Internationalopen.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.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 |