Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale
Hepatitis C virus, dengue virus, and Zika virus belong to the Flaviviridae family. Unlike HCV, these viruses are transmitted mostly by vectors, are distributed worldwide and are pathogens that cause various diseases. Additionally, they present a conserved genome that encodes a polyprotein that is th...
- Autores:
-
Hernández Sánchez, Karla Vanessa
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/51318
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/51318
- Palabra clave:
- Flavivirus
Agentes antivirales
Enzimas proteolíticas
Microbiología
- Rights
- openAccess
- License
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
id |
UNIANDES2_4a614faa6d6e424dbda9f35857b727b0 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/51318 |
network_acronym_str |
UNIANDES2 |
network_name_str |
Séneca: repositorio Uniandes |
repository_id_str |
|
spelling |
Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Parra Avila, Miguel Hernando06fb30c8-f861-445d-9ca0-f1c07762c25c500Salvatierra, Karina Alejandraf894cb4a-3d3a-4289-8a2c-5a5189db9dbe500Hernández Sánchez, Karla Vanessa0941c762-3043-4049-b2eb-ed6a5337373f5002021-08-10T18:20:03Z2021-08-10T18:20:03Z2021http://hdl.handle.net/1992/5131823776.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/Hepatitis C virus, dengue virus, and Zika virus belong to the Flaviviridae family. Unlike HCV, these viruses are transmitted mostly by vectors, are distributed worldwide and are pathogens that cause various diseases. Additionally, they present a conserved genome that encodes a polyprotein that is then cleaved by cellular and viral proteases into structural and non-structural proteins. NS3 protease is a key target for antiviral treatment, since it is essential during the viral cycle. Therefore, antivirals that inhibit this protease have been evaluated for the treatment against viruses of the Flaviviridae family. However, polymorphisms could cause a decrease in the effectiveness of treatment and even prevent inhibition. Therefore, using bioinformatics tools, the interaction of simeprevir and narlaprevir with the NS3 protein with polymorphisms in Colombia was evaluated.El virus de la hepatitis C, virus del dengue y el virus del zika pertenecen a la familia Flaviviridae. A diferencia del VHC, estos virus son transmitidos en su mayoría por vectores, se encuentran distribuidos mundialmente y son patógenos causantes de diversas enfermedades. Adicionalmente, presentan un genoma conservado que codifica una poliproteína que luego es escindida por proteasas celulares y virales en proteínas estructurales y no estructurales. La proteasa NS3 es un objetivo clave para el tratamiento antiviral, dado que es primordial durante el ciclo viral. Por lo tanto, se han evaluado antivirales que inhiben esta proteasa para el tratamiento contra virus de la familia Flaviviridae. Sin embargo, los polimorfismos podrían causar una disminución en la efectividad del tratamiento e incluso impedir la inhibición. Por lo tanto, mediante herramientas bioinformáticas, se evaluó la interacción de simeprevir y narlaprevir con la proteína NS3 con polimorfismos en Colombia.MicrobiólogoPregrado15 hojasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesMicrobiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias BiológicasAnálisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antiviraleTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPFlavivirusAgentes antiviralesEnzimas proteolíticasMicrobiología201717939PublicationTHUMBNAIL23776.pdf.jpg23776.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4999https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/62c35e58-7c52-4d84-99bf-7b24089452f9/downloada990659e218c717cfbbaeff443985332MD55ORIGINAL23776.pdfapplication/pdf302960https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/470bb7bf-dff9-484c-85f8-ed395f265d3a/downloadc529b62820e578ffa91270e2307f2a7aMD51TEXT23776.pdf.txt23776.pdf.txtExtracted texttext/plain19884https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/09e700e2-a281-4843-8068-2752137ad718/downloadeb81938c4010b0a0b4ebfab6ed2df4a7MD541992/51318oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/513182024-11-14 14:50:47.041http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |
dc.title.spa.fl_str_mv |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale |
title |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale |
spellingShingle |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale Flavivirus Agentes antivirales Enzimas proteolíticas Microbiología |
title_short |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale |
title_full |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale |
title_fullStr |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale |
title_full_unstemmed |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale |
title_sort |
Análisis in silico de la interacción de variantes virales de la proteína NS3 de la familia Flaviviridae con antivirale |
dc.creator.fl_str_mv |
Hernández Sánchez, Karla Vanessa |
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Parra Avila, Miguel Hernando Salvatierra, Karina Alejandra |
dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Hernández Sánchez, Karla Vanessa |
dc.subject.armarc.spa.fl_str_mv |
Flavivirus Agentes antivirales Enzimas proteolíticas |
topic |
Flavivirus Agentes antivirales Enzimas proteolíticas Microbiología |
dc.subject.themes.none.fl_str_mv |
Microbiología |
description |
Hepatitis C virus, dengue virus, and Zika virus belong to the Flaviviridae family. Unlike HCV, these viruses are transmitted mostly by vectors, are distributed worldwide and are pathogens that cause various diseases. Additionally, they present a conserved genome that encodes a polyprotein that is then cleaved by cellular and viral proteases into structural and non-structural proteins. NS3 protease is a key target for antiviral treatment, since it is essential during the viral cycle. Therefore, antivirals that inhibit this protease have been evaluated for the treatment against viruses of the Flaviviridae family. However, polymorphisms could cause a decrease in the effectiveness of treatment and even prevent inhibition. Therefore, using bioinformatics tools, the interaction of simeprevir and narlaprevir with the NS3 protein with polymorphisms in Colombia was evaluated. |
publishDate |
2021 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2021-08-10T18:20:03Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2021-08-10T18:20:03Z |
dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2021 |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Pregrado |
dc.type.coarversion.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TP |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/1992/51318 |
dc.identifier.pdf.none.fl_str_mv |
23776.pdf |
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv |
instname:Universidad de los Andes |
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Institucional Séneca |
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv |
repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
url |
http://hdl.handle.net/1992/51318 |
identifier_str_mv |
23776.pdf instname:Universidad de los Andes reponame:Repositorio Institucional Séneca repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
dc.language.iso.none.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.rights.uri.*.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.extent.none.fl_str_mv |
15 hojas |
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidad de los Andes |
dc.publisher.program.none.fl_str_mv |
Microbiología |
dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv |
Facultad de Ciencias |
dc.publisher.department.spa.fl_str_mv |
Departamento de Ciencias Biológicas |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidad de los Andes |
institution |
Universidad de los Andes |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/62c35e58-7c52-4d84-99bf-7b24089452f9/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/470bb7bf-dff9-484c-85f8-ed395f265d3a/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/09e700e2-a281-4843-8068-2752137ad718/download |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
a990659e218c717cfbbaeff443985332 c529b62820e578ffa91270e2307f2a7a eb81938c4010b0a0b4ebfab6ed2df4a7 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio institucional Séneca |
repository.mail.fl_str_mv |
adminrepositorio@uniandes.edu.co |
_version_ |
1818111902308368384 |