Determinación de la frecuencia del polimorfismo rs8052394 del gen de la metalotioneína MT1A en una muestra de la población colombiana
Las Metalotioneínas son proteínas de tamaño relativamente pequeño y bajo peso molecular, ricas en cisteína y con múltiples funciones celulares. Son una familia multigenica con al menos 14 pseudogenes estrechamente relacionados que codifican para proteínas MT. El gen MT1A es de alta relevancia puesto...
- Autores:
-
Aguilar Méndez, Juan Sebastián
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
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- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/55303
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/55303
- Palabra clave:
- Metalotioneínas
Polimorfismo rs8052394
Microbiología
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Las Metalotioneínas son proteínas de tamaño relativamente pequeño y bajo peso molecular, ricas en cisteína y con múltiples funciones celulares. Son una familia multigenica con al menos 14 pseudogenes estrechamente relacionados que codifican para proteínas MT. El gen MT1A es de alta relevancia puesto que se expresa ampliamente en el cuerpo con evidencia de una importante actividad antioxidante. Además, se ha encontrado que el gen MT1A presenta alta variabilidad y tiene relación con el metabolismo a metales pesados. Poco se sabe de cómo los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) afectan la función de las enzimas MT. En particular el polimorfismo rs8052394 que presenta un cambio de una Adenina por una Guanina (A/G) para el gen MT1A ha sido relacionado con un aumento de MeHg en orina y sangre asociado al desarrollo de nefropatías. Así mismo se ha visto involucrado en el desarrollo de ciertos carcinomas como también en el desarrollo diabetes mellitus tipo 2 (DM2).En este estudio establecimos la frecuencia del polimorfismo rs8052394 en una población aleatoria colombiana. Se reclutó un total de 350 participantes provenientes de varias regiones de Colombia. Utilizando el método RFLP basado en PCR, con la enzima de restricción PstI, se analizó el polimorfismo rs8052394 del gen MT1A. De 350 participantes, 290 individuos poseían el alelo A con una frecuencia del 58,4% y 231 individuos poseían el alelo G con una frecuencia del 41,5%. De toda la población de estudio, el 34% poseían el genotipo Wild type (AA), 48.8% el genotipo heterocigoto (AG) y 17.1% el genotipo homocigoto para el SNP (GG). Estos datos sugieren que hay una incidencia importante del polimorfismo rs8052394 en la población de estudio, basados en esto recomendamos estudios con poblaciones más grandes en el territorio colombiano, puesto que la presencia del polimorfismo en la población puede ser de interés a nivel de salud pública. |
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El gen MT1A es de alta relevancia puesto que se expresa ampliamente en el cuerpo con evidencia de una importante actividad antioxidante. Además, se ha encontrado que el gen MT1A presenta alta variabilidad y tiene relación con el metabolismo a metales pesados. Poco se sabe de cómo los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) afectan la función de las enzimas MT. En particular el polimorfismo rs8052394 que presenta un cambio de una Adenina por una Guanina (A/G) para el gen MT1A ha sido relacionado con un aumento de MeHg en orina y sangre asociado al desarrollo de nefropatías. Así mismo se ha visto involucrado en el desarrollo de ciertos carcinomas como también en el desarrollo diabetes mellitus tipo 2 (DM2).En este estudio establecimos la frecuencia del polimorfismo rs8052394 en una población aleatoria colombiana. Se reclutó un total de 350 participantes provenientes de varias regiones de Colombia. Utilizando el método RFLP basado en PCR, con la enzima de restricción PstI, se analizó el polimorfismo rs8052394 del gen MT1A. De 350 participantes, 290 individuos poseían el alelo A con una frecuencia del 58,4% y 231 individuos poseían el alelo G con una frecuencia del 41,5%. De toda la población de estudio, el 34% poseían el genotipo Wild type (AA), 48.8% el genotipo heterocigoto (AG) y 17.1% el genotipo homocigoto para el SNP (GG). Estos datos sugieren que hay una incidencia importante del polimorfismo rs8052394 en la población de estudio, basados en esto recomendamos estudios con poblaciones más grandes en el territorio colombiano, puesto que la presencia del polimorfismo en la población puede ser de interés a nivel de salud pública.Metallothioneins are proteins of relatively small size and low molecular weight, rich in cysteine and with multiple cellular functions. They are a multigene family with at least 14 closely related pseudogenes that code for MT proteins. The MT1A gene is highly relevant since it is widely expressed in the body with evidence of significant antioxidant activity. In addition, it has been found that the MT1A gene has high variability and is related to heavy metal metabolism. Little is known about how single nucleotide polymorphisms (SNPs) affect the function of MT enzymes. In particular, the rs8052394 polymorphism that presents a change from an Adenine to a Guanine (A / G) for the MT1A gene has been related to an increase in MeHg in urine and blood associated with the development of nephropathies. Likewise, it has been involved in the development of certain carcinomas as well as in the development of type 2 diabetes mellitus (DM2). In this study we established the frequency of the rs8052394 polymorphism in a random Colombian population. A total of 350 participants were recruited from various regions of Colombia. Using the RFLP method based on PCR, with the restriction enzyme PstI, the polymorphism rs8052394 of the MT1A gene was analyzed. Of 350 participants, 290 individuals had the A allele with a frequency of 58.4% and 231 individuals had the G allele with a frequency of 41.5%. Of the entire study population, 34% had the Wild type (AA) genotype, 48.8% the heterozygous (AG) genotype and 17.1% the homozygous genotype for the SNP (GG). These data suggest that there is a significant incidence of the rs8052394 polymorphism in the study population, based on this we recommend studies with larger populations in the Colombian territory, because the presence of the polymorphism in the population may be of interest at the public health level.MicrobiólogoPregrado13 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesMicrobiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias BiológicasDeterminación de la frecuencia del polimorfismo rs8052394 del gen de la metalotioneína MT1A en una muestra de la población colombianaTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPMetalotioneínasPolimorfismo rs8052394Microbiología201630424PublicationTEXT25382.pdf.txt25382.pdf.txtExtracted texttext/plain31029https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/f8768a56-571e-4c41-9092-6113839b23bb/download0b8eddd901f78b3c67ed5145b0bd1c3aMD52ORIGINAL25382.pdfapplication/pdf498877https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/7b350155-e364-4e10-a1f6-4e870ed7b561/download369a65994aacd3dbea74bd37ef4a28c1MD51THUMBNAIL25382.pdf.jpg25382.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg22190https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/c76580bd-0954-417a-b02b-77591087b39d/download30c95adb83506f07bc6789c4bfa351bcMD531992/55303oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/553032023-10-10 17:28:53.854http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |