Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning

"En este trabajo se propuso un método para la detección automática de crisis epilépticas, usando una representación de imagen de señales cerebrales. Se analizaron registros de EEG de dos bases de datos: CHB-MIT scalp EEG y EPILEPSIAE, la cual incluye registros intracraneales. Para cambiar del d...

Full description

Autores:
Gómez Caballero, Catalina
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2019
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/35055
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/1992/35055
Palabra clave:
Epilepsia - Prevención y control - Procesamiento de datos - Investigaciones
Electroencefalografía - Procesamiento de señales - Investigaciones
Redes neurales (Neurobiología) - Investigaciones
Convoluciones (Matemáticas) - Investigaciones
Ingeniería
Rights
openAccess
License
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
id UNIANDES2_3dd08d4bb42db75882b8598cae85084e
oai_identifier_str oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/35055
network_acronym_str UNIANDES2
network_name_str Séneca: repositorio Uniandes
repository_id_str
dc.title.es_CO.fl_str_mv Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
title Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
spellingShingle Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
Epilepsia - Prevención y control - Procesamiento de datos - Investigaciones
Electroencefalografía - Procesamiento de señales - Investigaciones
Redes neurales (Neurobiología) - Investigaciones
Convoluciones (Matemáticas) - Investigaciones
Ingeniería
title_short Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
title_full Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
title_fullStr Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
title_full_unstemmed Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
title_sort Automatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learning
dc.creator.fl_str_mv Gómez Caballero, Catalina
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Valderrama Manrique, Mario Andrés
Arbeláez Escalante, Pablo Andrés
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Gómez Caballero, Catalina
dc.contributor.jury.none.fl_str_mv Hernández Hoyos, Marcela
Cordovez Álvarez, Juan Manuel
dc.subject.keyword.es_CO.fl_str_mv Epilepsia - Prevención y control - Procesamiento de datos - Investigaciones
Electroencefalografía - Procesamiento de señales - Investigaciones
Redes neurales (Neurobiología) - Investigaciones
Convoluciones (Matemáticas) - Investigaciones
topic Epilepsia - Prevención y control - Procesamiento de datos - Investigaciones
Electroencefalografía - Procesamiento de señales - Investigaciones
Redes neurales (Neurobiología) - Investigaciones
Convoluciones (Matemáticas) - Investigaciones
Ingeniería
dc.subject.themes.none.fl_str_mv Ingeniería
description "En este trabajo se propuso un método para la detección automática de crisis epilépticas, usando una representación de imagen de señales cerebrales. Se analizaron registros de EEG de dos bases de datos: CHB-MIT scalp EEG y EPILEPSIAE, la cual incluye registros intracraneales. Para cambiar del dominio de señales a imágenes, definimos la amplitud de la señal de EEG como el atributo del píxel, y se segmentaron los registros en ventanas de 4 segundos que corresponden a periodos de actividad ictal e interictal. Se usaron redes completamente convolucionales para hacer predicciones en registros de longitud variable. Se entrenaron 3 tipos de modelos multi-paciente: validación cruzada (3FCV), un paciente fuera (LOO) y primeras crisis. Para la evaluación, se utilizaron las métricas de un problema de detección: precisión, cobertura, F-medida y precisión promedio. En los pacientes de PhysioNet (modelo LOO), la F-medida promedio fue de 46.6% al evaluar en todos los registros (n=642)." -- Tomado del Formato de Documento de Grado.
publishDate 2019
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2019
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2020-06-10T09:32:54Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2020-06-10T09:32:54Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1992/35055
dc.identifier.pdf.none.fl_str_mv u821308.pdf
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Universidad de los Andes
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional Séneca
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/
url http://hdl.handle.net/1992/35055
identifier_str_mv u821308.pdf
instname:Universidad de los Andes
reponame:Repositorio Institucional Séneca
repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/
dc.language.iso.es_CO.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.es_CO.fl_str_mv 10 hojas
dc.format.mimetype.es_CO.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.es_CO.fl_str_mv Uniandes
dc.publisher.program.es_CO.fl_str_mv Maestría en Ingeniería Biomédica
dc.publisher.faculty.es_CO.fl_str_mv Facultad de Ingeniería
dc.publisher.department.es_CO.fl_str_mv Departamento de Ingeniería Biomédica
dc.source.es_CO.fl_str_mv instname:Universidad de los Andes
reponame:Repositorio Institucional Séneca
instname_str Universidad de los Andes
institution Universidad de los Andes
reponame_str Repositorio Institucional Séneca
collection Repositorio Institucional Séneca
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/4b231ef7-a17d-4490-9135-e573dbdf7f35/download
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/cbce925b-4cb3-45aa-bf9b-8b5beff83e1a/download
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/638c2392-71ed-4944-9a94-3d1bf8b1801a/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 294aca4e279bc439f006d39bc509a1a4
4f23d6567e00378a0ff98f0a55b8f91e
fe30c01f8d450848fdcbb0dc5d70a01d
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio institucional Séneca
repository.mail.fl_str_mv adminrepositorio@uniandes.edu.co
_version_ 1812133832496775168
spelling Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Valderrama Manrique, Mario Andrésvirtual::2489-1Arbeláez Escalante, Pablo Andrésvirtual::2490-1Gómez Caballero, Catalinae621bfdc-10be-474b-be46-a110dd3373a3500Hernández Hoyos, MarcelaCordovez Álvarez, Juan Manuel2020-06-10T09:32:54Z2020-06-10T09:32:54Z2019http://hdl.handle.net/1992/35055u821308.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/"En este trabajo se propuso un método para la detección automática de crisis epilépticas, usando una representación de imagen de señales cerebrales. Se analizaron registros de EEG de dos bases de datos: CHB-MIT scalp EEG y EPILEPSIAE, la cual incluye registros intracraneales. Para cambiar del dominio de señales a imágenes, definimos la amplitud de la señal de EEG como el atributo del píxel, y se segmentaron los registros en ventanas de 4 segundos que corresponden a periodos de actividad ictal e interictal. Se usaron redes completamente convolucionales para hacer predicciones en registros de longitud variable. Se entrenaron 3 tipos de modelos multi-paciente: validación cruzada (3FCV), un paciente fuera (LOO) y primeras crisis. Para la evaluación, se utilizaron las métricas de un problema de detección: precisión, cobertura, F-medida y precisión promedio. En los pacientes de PhysioNet (modelo LOO), la F-medida promedio fue de 46.6% al evaluar en todos los registros (n=642)." -- Tomado del Formato de Documento de Grado."We proposed an automatic method to detect epileptic seizures using an "imaged-EEG" representation of brain signals. To accomplish this task, we analyzed scalp EEG recordings from two datasets: 24 pediatric patients belonging to the public CHB-MIT Scalp EEG Database, and 11 patients from the EPILEPSIAE project. To change from signals to images domain, we took the raw amplitude of the EEG signals as the pixel attribute and divided the recordings into four-second windows to generate ictal and interictal instances. We used Fully Convolutional Neural Networks (FCN) to make predictions of variable-length recordings. The data from both classes was distributed into three cross-patient models: 3 fold Cross-Validation (3FCV), Leave-one-out (LOO), and first seizures model. We evaluated the performance of the algorithms using the standard metrics of detection problems: precision, recall, F-measure and Average Precision (AP). Our method in the PhysioNet patients with the LOO model achieves an average F-measure of 46.6% in all the recordings (n=642)." -- Tomado del Formato de Documento de Grado.Magíster en Ingeniería BiomédicaMaestría10 hojasapplication/pdfengUniandesMaestría en Ingeniería BiomédicaFacultad de IngenieríaDepartamento de Ingeniería Biomédicainstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional SénecaAutomatic seizure detection based on imaged-EEG signals through statistical learningTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMEpilepsia - Prevención y control - Procesamiento de datos - InvestigacionesElectroencefalografía - Procesamiento de señales - InvestigacionesRedes neurales (Neurobiología) - InvestigacionesConvoluciones (Matemáticas) - InvestigacionesIngenieríaPublicationhttps://scholar.google.es/citations?user=k0nZO90AAAAJvirtual::2490-10000-0001-5244-2407virtual::2490-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000344079virtual::2489-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001579086virtual::2490-1036bf7e3-a4e3-40cc-b3a3-fa2effe4b3aevirtual::2489-1b4f52d42-ce2a-4e74-a22f-e52a6bfbd48evirtual::2490-1036bf7e3-a4e3-40cc-b3a3-fa2effe4b3aevirtual::2489-1b4f52d42-ce2a-4e74-a22f-e52a6bfbd48evirtual::2490-1TEXTu821308.pdf.txtu821308.pdf.txtExtracted texttext/plain48056https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/4b231ef7-a17d-4490-9135-e573dbdf7f35/download294aca4e279bc439f006d39bc509a1a4MD54ORIGINALu821308.pdfapplication/pdf4395668https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/cbce925b-4cb3-45aa-bf9b-8b5beff83e1a/download4f23d6567e00378a0ff98f0a55b8f91eMD51THUMBNAILu821308.pdf.jpgu821308.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg29196https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/638c2392-71ed-4944-9a94-3d1bf8b1801a/downloadfe30c01f8d450848fdcbb0dc5d70a01dMD551992/35055oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/350552024-03-13 12:12:53.61http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co