Eficiencia de dos protocolos de extracción de ADN para el estudio de la microbiota de la epidermis
En estudios actuales se ha demostrado que cambios en la composición normal de la microbiota de la piel pueden llevar a favorecer el desarrollo y la severidad de la dermatitis atópica. Es por esta razón, que el objetivo principal de este proyecto es comparar la eficiencia de dos protocolos de extracc...
- Autores:
-
Ojeda Velandia, Natalia
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2024
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
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- OAI Identifier:
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- Acceso en línea:
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Microbiota
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En estudios actuales se ha demostrado que cambios en la composición normal de la microbiota de la piel pueden llevar a favorecer el desarrollo y la severidad de la dermatitis atópica. Es por esta razón, que el objetivo principal de este proyecto es comparar la eficiencia de dos protocolos de extracción de ADN a partir de hisopados para el estudio de la microbiota de la epidermis. Esto se logró mediante la evaluación de los protocolos Fenol Cloroformo y PureLink Microbiome DNA Purification Kit de Invitrogen en donde se analizó la concentración y pureza para cada uno, resultando en que el protocolo Fenol Cloroformo es mejor para obtener mayores concentraciones de ADN y en cuanto a la pureza los dos métodos presentaron resultados similares. Finalmente, se identificó la presencia de marcadores moleculares de bacterias (16S) y hongos (ITS) en las muestras de ADN obteniendo que el mejor método para estudiar la microbiota de la epidermis es el PureLink Microbiome DNA Purification Kit de Invitrogen. Lo anterior es importante debido a que el estudio de esta enfermedad con métodos no invasivos podría tener un impacto positivo al obtener una mayor evidencia científica. |
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IL-4Rα blockade by dupilumab decreases Staphylococcus aureus colonization and increases microbial diversity in atopic dermatitis. Journal of Investigative Dermatology, 140(1), 191-202. Condrò, G., Guerini, M., Castello, M., & Perugini, P. (2022). Acne Vulgaris, Atopic Dermatitis and Rosacea: The Role of the Skin Microbiota—A Review. Biomedicines, 10(10), 2523. Dairawan, M., & Shetty, P. J. (2020). The evolution of DNA extraction methods. Am. J. Biomed. Sci. Res, 8(1), 39-45. Fang, Z., Li, L., Zhang, H., Zhao, J., Lu, W., & Chen, W. (2021). Gut microbiota, probiotics, and their interactions in prevention and treatment of atopic dermatitis: a review. Frontiers in immunology, 12, 720393. Frazier, W., & Bhardwaj, N. (2020). Atopic dermatitis: diagnosis and treatment. American family physician, 101(10), 590-598. Fyhrquist, N., Muirhead, G., Prast-Nielsen, S., Jeanmougin, M., Olah, P., Skoog, T., ... & Alenius, H. (2019). Microbe-host interplay in atopic dermatitis and psoriasis. 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Kazantseva, J., Malv, E., Kaleda, A., Kallastu, A., & Meikas, A. (2021). Optimisation of sample storage and DNA extraction for human gut microbiota studies. BMC microbiology, 21(1), 1-13. Kim, B. E., Goleva, E., Kim, P. S., Norquest, K., Bronchick, C., Taylor, P., & Leung, D. Y. (2019). Side-by-side comparison of skin biopsies and skin tape stripping highlights abnormal stratum corneum in atopic dermatitis. Journal of Investigative Dermatology, 139(11), 2387-2389. Londoño, A. M., Castro-Ayarza, J. R., Kronfly, A., Buitrago, D. C., & Samacá, D. F. (2023). Epidemiology and healthcare resource utilization in atopic dermatitis in Colombia: A retrospective analysis of data from the National Health Registry from 2015 to 2020. Biomédica, 43, 107-20. Minchala Maurat, E. G., & Tacuri Ochoa, C. E. (2023). Determinación por taxonomía molecular de hongos contaminantes persistentes en el laboratorio de Biotecnología Vegetal (Bachelors thesis). MURO, A. L., Celis, A. B., & Chan, M. G. C. (2019). Diálogo entre bacterias¿ cómo se comunican las bacterias?. Recursos Naturales y Sociedad. Organización Panamericana de la Salud. (2020). Fiestas de fin de año: ¿Qué tenemos que saber sobre las alergias y las restricciones alimentarias? Panzarelli, A. (2020). Dermatitis atópica del adulto: enfermedad de alto impacto. Dermatología Venezolana, 58(1). Park, M., Park, S., & Jung, W. H. (2021). Skin commensal fungus Malassezia and its lipases. Journal of Microbiology and Biotechnology, 31(5), 637. Peñafiel Carangui, D. E. (2023). Evaluación de dos protocolos convencionales para la extracción de ADN humano a partir de hisopados bucales (Bachelors thesis). Pérez Rodríguez, G. (2023). Optimización y validación en entorno de laboratorio de biomarcadores para la detección temprana de bacterias viables en la red de distribución de agua potable (Doctoral dissertation, Universitat Politècnica de València). RAMIREZ PUERTA, J. S. (2022). Estudio de infiltración tangencial de lisados mecánicos de E. 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Acne Vulgaris, Atopic Dermatitis and Rosacea: The Role of the Skin Microbiota—A Review. Biomedicines, 10(10), 2523.Dairawan, M., & Shetty, P. J. (2020). The evolution of DNA extraction methods. Am. J. Biomed. Sci. Res, 8(1), 39-45.Fang, Z., Li, L., Zhang, H., Zhao, J., Lu, W., & Chen, W. (2021). Gut microbiota, probiotics, and their interactions in prevention and treatment of atopic dermatitis: a review. Frontiers in immunology, 12, 720393.Frazier, W., & Bhardwaj, N. (2020). Atopic dermatitis: diagnosis and treatment. American family physician, 101(10), 590-598.Fyhrquist, N., Muirhead, G., Prast-Nielsen, S., Jeanmougin, M., Olah, P., Skoog, T., ... & Alenius, H. (2019). Microbe-host interplay in atopic dermatitis and psoriasis. Nature communications, 10(1), 4703.He, H., Olesen, C. M., Pavel, A. B., Clausen, M. L., Wu, J., Estrada, Y., ... & Guttman-Yassky, E. (2020). Tape-strip proteomic profiling of atopic dermatitis on dupilumab identifies minimally invasive biomarkers. 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Side-by-side comparison of skin biopsies and skin tape stripping highlights abnormal stratum corneum in atopic dermatitis. Journal of Investigative Dermatology, 139(11), 2387-2389.Londoño, A. M., Castro-Ayarza, J. R., Kronfly, A., Buitrago, D. C., & Samacá, D. F. (2023). Epidemiology and healthcare resource utilization in atopic dermatitis in Colombia: A retrospective analysis of data from the National Health Registry from 2015 to 2020. Biomédica, 43, 107-20.Minchala Maurat, E. G., & Tacuri Ochoa, C. E. (2023). Determinación por taxonomía molecular de hongos contaminantes persistentes en el laboratorio de Biotecnología Vegetal (Bachelors thesis).MURO, A. L., Celis, A. B., & Chan, M. G. C. (2019). Diálogo entre bacterias¿ cómo se comunican las bacterias?. Recursos Naturales y Sociedad.Organización Panamericana de la Salud. (2020). Fiestas de fin de año: ¿Qué tenemos que saber sobre las alergias y las restricciones alimentarias?Panzarelli, A. (2020). 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