Caracterización de la mutación c.4009C>T en el gen IGF1R en un paciente con retraso en el crecimiento y su familia.
Esta investigación fue aprobada por el comite de etica de la universidad.
- Autores:
-
Balen Cuadros, Gabriela
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
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- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/57762
- Palabra clave:
- genética
mutación
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IGF1R
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Dicha proteína junto con el factor de crecimiento participa en rutas metabólicas relacionadas con el crecimiento, inhibición de la apoptosis y la proliferación celular. En el presente estudio, se examina el caso de un paciente con retraso en el crecimiento al cual se le encontró la mutación c.4009C>T en un alelo del gen IGF1R. Los objetivos de este estudio son, primero, evaluar la mutación c.4009C>T del gen IGF1R en los participantes para determinar el comportamiento mendeliano de la mutación; segundo, analizar la mutación usando predictores in silico para establecer su impacto en la función de la proteína; tercero, modelar el dominio intracelular de la proteína para localizar el residuo afectado. Para el primer objetivo, se llevaron a cabo las metodologías de extracción de ADN, PCR end point, secuenciación Sanger y procesamiento bioinformático en Benchling para evaluar la mutación en los participantes. En el segundo, los predictores usados fueron SIFT, Provean y MutationTaster. Y para el tercer objetivo se predijo la estructura del dominio intracelular con el programa I-Tasser usando la cristalografía 3NW5 para restringir la predicción. Como resultado se estableció el Pedigree que permite diagramar la presencia de la mutación en los participantes y dicha mutación se encontró en la familia paterna. También, todos los predictores usados establecieron que la mutación tiene un impacto negativo en la proteína. En cuanto al resultado de MutationTaster, el programa especificó que el daño se presenta en el dominio intracelular, específicamente en el TK. Adicionalmente, se llegó al modelamiento de la secuencia aminoacídica intracelular de la proteína, más ajustada a las estructuras cristalográficas, lo que permitió resolver la estructura proteica desde el aminoácido 985 hasta el c terminal. El gen IGF1R es un gen vital cuya función es indispensable. En consecuencia, sólo se toleran mutaciones en un alelo. Este hecho y la diagramación del pedigree nos dan argumentos para pensar que esta es una mutación dominante. En este estudio algunos portadores de la mutación no presentan fenotipo, por lo que podemos hablar de dominancia incompleta de la patología. La mutación c.4009C>T fue reportada en la literatura en un paciente de un estudio que buscaba mutaciones causantes de fenotipos severos de microcefalia con deterioro del crecimiento prenatal y posnatal. En su búsqueda inicial, la mutación fue descartada por no estar ubicada en el dominio TK y no estar relacionada con las expresiones fenotípicas más severas. Pero considerando los resultados de los predictores in silico determinamos que la mutación c.4009C>T sí genera un daño en la proteína.Laboratorio de Genetica HumanaBiólogoPregrado19 paginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesBiologíaFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias BiológicasCaracterización de la mutación c.4009C>T en el gen IGF1R en un paciente con retraso en el crecimiento y su familia.Trabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPgenéticamutaciónmolecularIGF1Restudio de casoMutación (Biología)FenotiposGenética humanaBiologíaAbbott, A., Bueno, R., Pedrini, M., Murray, J., & Smith, R. (1992). Insulin-like growth factor I receptor gene structure. The Journal Of Biological Chemistry, 267(15), 10759-1076.Abuzzahab, M., Schneider, A., Goddard, A., Grigorescu, F., Lautier, C., & Keller, E. et al. (2003). 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