Grafo métrico y no dirigido para el ensamblaje de novo de genomas completos
En este documento se presenta la definición de un grafo no dirigido y métrico para el ensamblaje de genomas de novo. Además, se plantea un algoritmo para la construcción del mismo grafo, con sus respectivos análisis. Finalmente se plantea un algoritmo para el layout implementando una aproximación al...
- Autores:
-
Bojacá Aguilar, Juan Camilo
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2020
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/44557
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/44557
- Palabra clave:
- Biología computacional
Grafos
Genomas
Ingeniería
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Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Duitama Castellanos, Jorge Alexander579ff412-de79-4c40-a3c9-02c47a5ad340400Bojacá Aguilar, Juan Camilo9756b16b-34b7-4292-938b-466122e3ffba5002020-09-03T14:55:23Z2020-09-03T14:55:23Z2020http://hdl.handle.net/1992/44557u830690.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/En este documento se presenta la definición de un grafo no dirigido y métrico para el ensamblaje de genomas de novo. Además, se plantea un algoritmo para la construcción del mismo grafo, con sus respectivos análisis. Finalmente se plantea un algoritmo para el layout implementando una aproximación al problema del agente viajero sobre grafos métricos.This document presents the definition of an undirected and metric graph for the de novo genome assembly. In addition, an algorithm is proposed for the construction of the graph, with their respective tests. Finally, an algorithm for the layout phase is proposed, implementing an approximation algorithm to the traveling salesman problem on metric graphs.Ingeniero de Sistemas y ComputaciónPregrado18 hojasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesIngeniería de Sistemas y ComputaciónFacultad de IngenieríaDepartamento de Ingeniería de Sistemas y Computacióninstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional SénecaGrafo métrico y no dirigido para el ensamblaje de novo de genomas completosTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPBiología computacionalGrafosGenomasIngenieríaPublicationTHUMBNAILu830690.pdf.jpgu830690.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8852https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/c62c0561-41d5-441c-8708-327bda4ffd28/download1ed12390fae532e0b2eb019439388507MD55TEXTu830690.pdf.txtu830690.pdf.txtExtracted texttext/plain33799https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/953e6fca-4f28-4544-a274-6b3ca7365e53/download839f4893feb59e389a2853b48645d015MD54ORIGINALu830690.pdfapplication/pdf408422https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/ae292895-f73a-4efc-8cc9-4609402609a8/download8ecfac0c541f1ebf4323f05354593f44MD511992/44557oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/445572023-10-10 19:34:35.337http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |
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