Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays
La papa, Solanum tuberosum, es el tercer cultivo más importante a nivel mundial, y es el primer tubérculo más cultivado. Como cualquier cultivo, esta expuesto a diferentes estrés, entre ellos el estrés salino, el cual causa una sobreproducción de especies reactivas de oxígeno (ROS) provocando daños...
- Autores:
-
Fuentes Suárez, Luis Eduardo
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad de los Andes
- Repositorio:
- Séneca: repositorio Uniandes
- Idioma:
- eng
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/56591
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/1992/56591
- Palabra clave:
- Solanum tuberosum
Reactive oxygen species
Pyrimidine catabolism
Salt stress tolerance
Dihydropyrimidine dehydrogenase
Pull-down technique
Recombinant StDHPD
Biología
- Rights
- openAccess
- License
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
id |
UNIANDES2_222163599d345fb5426c3c7c54a08453 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/56591 |
network_acronym_str |
UNIANDES2 |
network_name_str |
Séneca: repositorio Uniandes |
repository_id_str |
|
dc.title.eng.fl_str_mv |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays |
title |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays |
spellingShingle |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays Solanum tuberosum Reactive oxygen species Pyrimidine catabolism Salt stress tolerance Dihydropyrimidine dehydrogenase Pull-down technique Recombinant StDHPD Biología |
title_short |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays |
title_full |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays |
title_fullStr |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays |
title_full_unstemmed |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays |
title_sort |
Plant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assays |
dc.creator.fl_str_mv |
Fuentes Suárez, Luis Eduardo |
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv |
Zimmermann, Barbara Hanna |
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Fuentes Suárez, Luis Eduardo |
dc.contributor.jury.spa.fl_str_mv |
Zimmermann, Barbara Hanna |
dc.subject.keyword.spa.fl_str_mv |
Solanum tuberosum Reactive oxygen species Pyrimidine catabolism Salt stress tolerance Dihydropyrimidine dehydrogenase Pull-down technique Recombinant StDHPD |
topic |
Solanum tuberosum Reactive oxygen species Pyrimidine catabolism Salt stress tolerance Dihydropyrimidine dehydrogenase Pull-down technique Recombinant StDHPD Biología |
dc.subject.themes.none.fl_str_mv |
Biología |
description |
La papa, Solanum tuberosum, es el tercer cultivo más importante a nivel mundial, y es el primer tubérculo más cultivado. Como cualquier cultivo, esta expuesto a diferentes estrés, entre ellos el estrés salino, el cual causa una sobreproducción de especies reactivas de oxígeno (ROS) provocando daños morfológicos en las plantas y causando su muerte. Diferentes estudios han determinado que la ruta de pirimidinas esta involucrada en la tolerancia al estrés salino, principalmente la ruta de catabolismo de pirimidinas. La dihidropirimidina deshidrogenasa (DHPD), es la primera enzima en esta ruta y sin ella la ruta no puede llevarse a cabo. Debido a esto, es indispensable una caracterización de está enzima, pero existe un impedimento, el cual radica en que la enzima de plantas únicamente tiene homología al C-terminal de la DHPD de Sus scrofa, lo que sugiere que en plantas para poder realizar su catálisis, requiere de una o mas proteínas asociadas. A partir de lo anterior, el objetivo del presente trabajo fue establecer una aproximación a la o las proteínas asociadas con la StDHPD, mediante el uso de la técnica de Pull-down, usando como proteína señuelo la StDHPD recombinante y como proteínas presa, todas aquellas proteínas presentes en la fracción del estroma de los cloroplastos intactos de hojas de papa. Como resultado se pudo obtener tres bandas importantes, 10 kDa, 30 kDa y 100 kDa; las cuales muestran posibles proteínas que puedan estar relacionadas con la StDHPD. Sin embargo, es importante aclarar que los resultados presentados aquí son preliminares y requieren réplicas para validar la información. |
publishDate |
2021 |
dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2021 |
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2022-03-23T21:51:54Z |
dc.date.available.none.fl_str_mv |
2022-03-23T21:51:54Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Maestría |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TM |
status_str |
acceptedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/1992/56591 |
dc.identifier.pdf.none.fl_str_mv |
26292.pdf |
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv |
instname:Universidad de los Andes |
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Institucional Séneca |
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv |
repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
url |
http://hdl.handle.net/1992/56591 |
identifier_str_mv |
26292.pdf instname:Universidad de los Andes reponame:Repositorio Institucional Séneca repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/ |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.uri.*.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.extent.spa.fl_str_mv |
34 páginas |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.spa.fl_str_mv |
Universidad de los Andes |
dc.publisher.program.spa.fl_str_mv |
Maestría en Ciencias Biológicas |
dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv |
Facultad de Ciencias |
dc.publisher.department.spa.fl_str_mv |
Departamento de Ciencias Biológicas |
institution |
Universidad de los Andes |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/780d7856-6737-4f1b-a8d5-f12b4e5b2c61/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/8713212c-5166-44ce-bf36-297bba708eee/download https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/82d6ffa9-d910-4634-bfe4-246a0917297b/download |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
d08558df9da577de1b01a13aac8f76a6 694ef23b9feb01c400c25776c8610641 a101b028eada888bdb8e372aeb823e5a |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio institucional Séneca |
repository.mail.fl_str_mv |
adminrepositorio@uniandes.edu.co |
_version_ |
1818111927754162176 |
spelling |
Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Zimmermann, Barbara Hanna81271423-588b-479b-a844-0d7443608a49500Fuentes Suárez, Luis Eduardoe98f1b24-4b74-4b5d-beda-feb3c22d79a3500Zimmermann, Barbara Hanna2022-03-23T21:51:54Z2022-03-23T21:51:54Z2021http://hdl.handle.net/1992/5659126292.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/La papa, Solanum tuberosum, es el tercer cultivo más importante a nivel mundial, y es el primer tubérculo más cultivado. Como cualquier cultivo, esta expuesto a diferentes estrés, entre ellos el estrés salino, el cual causa una sobreproducción de especies reactivas de oxígeno (ROS) provocando daños morfológicos en las plantas y causando su muerte. Diferentes estudios han determinado que la ruta de pirimidinas esta involucrada en la tolerancia al estrés salino, principalmente la ruta de catabolismo de pirimidinas. La dihidropirimidina deshidrogenasa (DHPD), es la primera enzima en esta ruta y sin ella la ruta no puede llevarse a cabo. Debido a esto, es indispensable una caracterización de está enzima, pero existe un impedimento, el cual radica en que la enzima de plantas únicamente tiene homología al C-terminal de la DHPD de Sus scrofa, lo que sugiere que en plantas para poder realizar su catálisis, requiere de una o mas proteínas asociadas. A partir de lo anterior, el objetivo del presente trabajo fue establecer una aproximación a la o las proteínas asociadas con la StDHPD, mediante el uso de la técnica de Pull-down, usando como proteína señuelo la StDHPD recombinante y como proteínas presa, todas aquellas proteínas presentes en la fracción del estroma de los cloroplastos intactos de hojas de papa. Como resultado se pudo obtener tres bandas importantes, 10 kDa, 30 kDa y 100 kDa; las cuales muestran posibles proteínas que puedan estar relacionadas con la StDHPD. Sin embargo, es importante aclarar que los resultados presentados aquí son preliminares y requieren réplicas para validar la información.Potato, Solanum tuberosum, is the third most important crop in the world and is the first most cultivated tuber. Like any crop, it is exposed to different stresses, including salt stress which causes an overproduction of reactive oxygen species (ROS). These cause morphological damage and could cause death. Different studies have shown that the pyrimidine pathway is involved in salt stress tolerance, mainly pyrimidine catabolism. Dihydropyrimidine dehydrogenase (DHPD) is the first enzyme in this pathway and without it, the pathway cannot proceed. Due to this, the characterization of this enzyme is essential, however, the enzyme in plants only has homology to the C-terminal of the DHPD of Sus scrofa, which suggests that in plants this enzyme requires one or more partner proteins for its catalysis. Therefore, the objective of this study was to establish an approximation to the protein or proteins associated with StDHPD, through the Pull-down technique, using recombinant StDHPD as bait protein and as prey proteins, all those proteins present in the stroma fraction of intact chloroplasts of potato leaves. As a result, three important bands could be obtained, 10 kDa, 30 kDa and 100 kDa; which show possible proteins that may be related to StDHPD, however it is important to clarify that the results presented here are preliminary results and require replicas to validate the information.Magíster en Ciencias BiológicasMaestría34 páginasapplication/pdfengUniversidad de los AndesMaestría en Ciencias BiológicasFacultad de CienciasDepartamento de Ciencias BiológicasPlant dihydropyrimidine dehydrogenase: searching for a partner by pull-down assaysTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMSolanum tuberosumReactive oxygen speciesPyrimidine catabolismSalt stress toleranceDihydropyrimidine dehydrogenasePull-down techniqueRecombinant StDHPDBiología201910066PublicationTEXT26292.pdf.txt26292.pdf.txtExtracted texttext/plain69882https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/780d7856-6737-4f1b-a8d5-f12b4e5b2c61/downloadd08558df9da577de1b01a13aac8f76a6MD52THUMBNAIL26292.pdf.jpg26292.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6037https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/8713212c-5166-44ce-bf36-297bba708eee/download694ef23b9feb01c400c25776c8610641MD53ORIGINAL26292.pdfapplication/pdf1061120https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/82d6ffa9-d910-4634-bfe4-246a0917297b/downloada101b028eada888bdb8e372aeb823e5aMD511992/56591oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/565912023-10-10 18:27:05.726http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co |