Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity

Pleurotus ostreatus es un hongo que secreta lacasas en su entorno de crecimiento. La secreción de estas oxidasas multicobre por este hongo dependen de la composición del medio de cultivo, por tanto, muchos estudios se había enfocado en evaluar diversos sustratos para incrementar la secreción de esta...

Full description

Autores:
Durán Sequeda, Dinary Eloisa
Tipo de recurso:
Doctoral thesis
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/55136
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/1992/55136
Palabra clave:
Pleurotus ostreatus
Medio de cultivo
Lacasas
Ingeniería
Rights
openAccess
License
https://repositorio.uniandes.edu.co/static/pdf/aceptacion_uso_es.pdf
id UNIANDES2_1dc39e6df424871314830efd14fdd8df
oai_identifier_str oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/55136
network_acronym_str UNIANDES2
network_name_str Séneca: repositorio Uniandes
repository_id_str
dc.title.eng.fl_str_mv Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
title Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
spellingShingle Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
Pleurotus ostreatus
Medio de cultivo
Lacasas
Ingeniería
title_short Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
title_full Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
title_fullStr Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
title_full_unstemmed Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
title_sort Biological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase Activity
dc.creator.fl_str_mv Durán Sequeda, Dinary Eloisa
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv Sierra Ramírez, Rocío
Pisabarro de Lucas, Antonio Gerardo
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Durán Sequeda, Dinary Eloisa
dc.contributor.jury.spa.fl_str_mv Restrepo Restrepo, Silvia
Martínez Galán, Fernando
González Rivera, Juan Camilo
dc.subject.keyword.none.fl_str_mv Pleurotus ostreatus
Medio de cultivo
Lacasas
topic Pleurotus ostreatus
Medio de cultivo
Lacasas
Ingeniería
dc.subject.themes.none.fl_str_mv Ingeniería
description Pleurotus ostreatus es un hongo que secreta lacasas en su entorno de crecimiento. La secreción de estas oxidasas multicobre por este hongo dependen de la composición del medio de cultivo, por tanto, muchos estudios se había enfocado en evaluar diversos sustratos para incrementar la secreción de estas enzimas. Aunque estos estudios habían mostraron que los factores como el carbono y nitrógeno y algunas sustancias inductoras en el medio de cultivo influían en la actividad lacasa de los extractos de cultivos del hongo, se desconocía cómo estos factores se relacionan entre sí en la regulación de la transcripción de genes lacasas. En consecuencia, el objetivo principal de la investigación fue determinar la influencia de la composición del medio de cultivo y los compuestos lignocelulósicos en la secreción de enzimas lacasas por P. ostreatus en cultivos sumergidos. Utilizando un enfoque estadístico y sistemático que permitió el control de la composición de los medios de cultivo, se encontraron las condiciones nutricionales óptimas que simultáneamente incrementaban el crecimiento fúngico y la actividad lacasa en ausencia y presencia de sulfato de cobre, un inductor reconocido de esta actividad enzimática. En dichas condiciones se indagó sobre los aspectos bioquímicos transcripciones en P. ostreatus relacionados con la secreción de lacasas, lo cual reveló la participación de transportadores de membrana de alta afinidad por el cobre (CTRs) como candidatos intermediarios de la regulación de tres genes lacasas lacc2, lacc6 and lacc10. Los resultados de la evaluación de la composición de los medios de cultivos sugieren que la regulación de estos trasportadores se encuentra estrechamente ligada a condiciones nutricionales suficientes en carbono y nitrógeno, con una participación central del metabolismo del nitrógeno orgánico en dicho proceso. Este conocimiento fue orientado a determinar el papel de la actividad lacasa en el pretratamiento biológico de la cáscara de arroz.
publishDate 2021
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2021
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2022-02-22T19:51:12Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2022-02-22T19:51:12Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Doctorado
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TD
format http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1992/55136
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.57784/1992/55136
dc.identifier.pdf.spa.fl_str_mv 25399.pdf
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Universidad de los Andes
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional Séneca
dc.identifier.repourl.spa.fl_str_mv repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/
url http://hdl.handle.net/1992/55136
identifier_str_mv 10.57784/1992/55136
25399.pdf
instname:Universidad de los Andes
reponame:Repositorio Institucional Séneca
repourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.uri.*.fl_str_mv https://repositorio.uniandes.edu.co/static/pdf/aceptacion_uso_es.pdf
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv https://repositorio.uniandes.edu.co/static/pdf/aceptacion_uso_es.pdf
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 129 páginas
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad de los Andes
dc.publisher.program.spa.fl_str_mv Doctorado en Ingeniería
dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv Facultad de Ingeniería
institution Universidad de los Andes
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/00359c54-96c2-4830-b20a-34e66e0c1e18/download
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/375fa0fe-209a-41d0-b27d-49048980725a/download
https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/11da75ac-9413-45bb-91c5-8cddda291ff8/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 52c3bac8b97936f89c4ef08a68725df5
efe10922d0634b3a7a90c887d01f3fa0
93cf76ff49a17a861c570de3a1908e7d
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio institucional Séneca
repository.mail.fl_str_mv adminrepositorio@uniandes.edu.co
_version_ 1812133981349478400
spelling Al consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores.https://repositorio.uniandes.edu.co/static/pdf/aceptacion_uso_es.pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Sierra Ramírez, Rocíoa2c596be-8ba3-4256-812c-92f6dd28e05f400Pisabarro de Lucas, Antonio Gerardo40066974-784e-4af9-aae4-3d97a9b8f21e500Durán Sequeda, Dinary Eloisa1027caff-2372-4b72-ab16-4eab53e44ca8400Restrepo Restrepo, SilviaMartínez Galán, FernandoGonzález Rivera, Juan Camilo2022-02-22T19:51:12Z2022-02-22T19:51:12Z2021http://hdl.handle.net/1992/5513610.57784/1992/5513625399.pdfinstname:Universidad de los Andesreponame:Repositorio Institucional Sénecarepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/Pleurotus ostreatus es un hongo que secreta lacasas en su entorno de crecimiento. La secreción de estas oxidasas multicobre por este hongo dependen de la composición del medio de cultivo, por tanto, muchos estudios se había enfocado en evaluar diversos sustratos para incrementar la secreción de estas enzimas. Aunque estos estudios habían mostraron que los factores como el carbono y nitrógeno y algunas sustancias inductoras en el medio de cultivo influían en la actividad lacasa de los extractos de cultivos del hongo, se desconocía cómo estos factores se relacionan entre sí en la regulación de la transcripción de genes lacasas. En consecuencia, el objetivo principal de la investigación fue determinar la influencia de la composición del medio de cultivo y los compuestos lignocelulósicos en la secreción de enzimas lacasas por P. ostreatus en cultivos sumergidos. Utilizando un enfoque estadístico y sistemático que permitió el control de la composición de los medios de cultivo, se encontraron las condiciones nutricionales óptimas que simultáneamente incrementaban el crecimiento fúngico y la actividad lacasa en ausencia y presencia de sulfato de cobre, un inductor reconocido de esta actividad enzimática. En dichas condiciones se indagó sobre los aspectos bioquímicos transcripciones en P. ostreatus relacionados con la secreción de lacasas, lo cual reveló la participación de transportadores de membrana de alta afinidad por el cobre (CTRs) como candidatos intermediarios de la regulación de tres genes lacasas lacc2, lacc6 and lacc10. Los resultados de la evaluación de la composición de los medios de cultivos sugieren que la regulación de estos trasportadores se encuentra estrechamente ligada a condiciones nutricionales suficientes en carbono y nitrógeno, con una participación central del metabolismo del nitrógeno orgánico en dicho proceso. Este conocimiento fue orientado a determinar el papel de la actividad lacasa en el pretratamiento biológico de la cáscara de arroz.Pleurotus ostreatus is a fungus that secretes an amount of laccase that varies in a wide range. The secretion of these multicopper oxidase enzymes by P. ostreatus depends on the composition of the culture medium. Consequently, many studies had focused on evaluating various culture media to increase the secretion of these enzymes by the fungus. Although these studies had shown that nutritional factors and some inducing substances influenced the secretion of laccases in P. ostreatus, it was unknown how these factors are related to each other and influence the secretion of these enzymes. Therefore, the main objective of this study was to determine the influence of the composition of the culture medium and lignocellulosic compounds on the secretion of laccase enzymes by P. ostreatus in submerged cultures. These studies were done using a statistical and systematic approach that allowed the control of the culture media composition. The optimal nutritional conditions were found that simultaneously increased fungal growth and laccase activity in the absence and presence of copper sulfate, a recognized inducer of laccase. Under these conditions, the biochemical aspects of transcripts in P. ostreatus related to laccase secretion were evaluated, which revealed the participation of membrane transporters with high affinity for copper (CTRs) as intermediate candidates for the regulation of three laccase genes, lacc2, lacc6, and lacc10. Moreover, the evaluation of the results of the culture media composition suggests that the regulation of these transporters is closely linked to sufficient nutritional conditions in carbon and nitrogen, with central participation of the metabolism of organic nitrogen in this process. With these findings, it was possible to obtain more profound knowledge of the pretreatment of lignocellulosic biomass by P. ostreatus in a submerged culture that was oriented to determine the role of laccase activity in the biological pretreatment of rice husks.Doctor en IngenieríaDoctorado129 páginasapplication/pdfengUniversidad de los AndesDoctorado en IngenieríaFacultad de IngenieríaBiological Pretreatment of Rice Husks with the White-rot Fungus Pleurotus ostreatus: the Role of Laccase ActivityTrabajo de grado - Doctoradoinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TDPleurotus ostreatusMedio de cultivoLacasasIngeniería201528599PublicationORIGINAL25399.pdfapplication/pdf4952712https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/00359c54-96c2-4830-b20a-34e66e0c1e18/download52c3bac8b97936f89c4ef08a68725df5MD51THUMBNAIL25399.pdf.jpg25399.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg9605https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/375fa0fe-209a-41d0-b27d-49048980725a/downloadefe10922d0634b3a7a90c887d01f3fa0MD53TEXT25399.pdf.txt25399.pdf.txtExtracted texttext/plain344589https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/11da75ac-9413-45bb-91c5-8cddda291ff8/download93cf76ff49a17a861c570de3a1908e7dMD521992/55136oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/551362024-08-26 15:24:25.855https://repositorio.uniandes.edu.co/static/pdf/aceptacion_uso_es.pdfrestrictedhttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co