Multilevel Selection in Escherichia coli Plasmids: a theoretical and experimental approach

La cooperación es necesaria para que la evolución construya nuevos niveles de organización. Desde la existencia de colonias de bacterias hasta la sociedad humana se requiere que los individuos cooperen entre sí. Sin embargo, la teoría evolutiva de Darwin indica, desde la selección natural, que el éx...

Full description

Autores:
Bernal Murcia, Catalina María
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/53786
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/1992/53786
Palabra clave:
Selección de grupos (Evolución)
Plásmidos
Escherichia coli
Física
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License
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description La cooperación es necesaria para que la evolución construya nuevos niveles de organización. Desde la existencia de colonias de bacterias hasta la sociedad humana se requiere que los individuos cooperen entre sí. Sin embargo, la teoría evolutiva de Darwin indica, desde la selección natural, que el éxito reproductivo está fundamentado en la competencia. Luego, se debe analizar mecanismos que permitan que la cooperación sea una estrategia estable en el tiempo. Con base en lo anterior, Johan Paulsson en su artículo Multilevel Selection on Plasmid Replication formula la hipótesis, a partir del mecanismo de la selección multinivel, en la que los individuos altruistas son aquellos que logran establecerse en una población por encima de los egoístas. En detalle, Paulsson se refiere a individuos altruistas como plásmidos con sistemas de control de replicación más estrictos relativo a otro tipo de plásmido. Por su parte, los individuos egoístas son plásmidos cuyo sistema de replicación es menos estricto y, por ende, cada plásmido tiene un número de copias superior al tipo mencionado. Así, se plantea, en primer lugar, un modelo estocástico de la replicación de plásmidos. Dicho modelo se compone de una parte que describe el proceso de replicación de los posibles tipos de plásmidos y otra parte que describe el proceso de la división celular. En segundo lugar, se busca comprobar experimentalmente que los plásmidos altruistas son los que logran fijarse en una población de E. coli. Para ello, se propone realizar un experimento de evolución bacteriana usando un Turbidostato. Aquí, se plantea analizar, después de un número significativo de generaciones bacterianas, qué tipo de plásmido logra fijarse en la población bacteriana y corroborar que la hipótesis, experimentalmente, es verdadera. Por último, los resultados que se obtienen son relevantes para la comprensión de la evolución social no solo en la escala bacteriana sino para comprender comportamientos de seres pluricelulares.
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Luego, se debe analizar mecanismos que permitan que la cooperación sea una estrategia estable en el tiempo. Con base en lo anterior, Johan Paulsson en su artículo Multilevel Selection on Plasmid Replication formula la hipótesis, a partir del mecanismo de la selección multinivel, en la que los individuos altruistas son aquellos que logran establecerse en una población por encima de los egoístas. En detalle, Paulsson se refiere a individuos altruistas como plásmidos con sistemas de control de replicación más estrictos relativo a otro tipo de plásmido. Por su parte, los individuos egoístas son plásmidos cuyo sistema de replicación es menos estricto y, por ende, cada plásmido tiene un número de copias superior al tipo mencionado. Así, se plantea, en primer lugar, un modelo estocástico de la replicación de plásmidos. Dicho modelo se compone de una parte que describe el proceso de replicación de los posibles tipos de plásmidos y otra parte que describe el proceso de la división celular. En segundo lugar, se busca comprobar experimentalmente que los plásmidos altruistas son los que logran fijarse en una población de E. coli. Para ello, se propone realizar un experimento de evolución bacteriana usando un Turbidostato. Aquí, se plantea analizar, después de un número significativo de generaciones bacterianas, qué tipo de plásmido logra fijarse en la población bacteriana y corroborar que la hipótesis, experimentalmente, es verdadera. Por último, los resultados que se obtienen son relevantes para la comprensión de la evolución social no solo en la escala bacteriana sino para comprender comportamientos de seres pluricelulares.Cooperation is necessary for evolution to build new levels of organization. From the existence of colonies of bacteria to human society, individuals are required to cooperate with each other. However, Darwin's evolutionary theory indicates, from natural selection, that reproductive success is based on competition. Therefore, mechanisms through which cooperation can be a stable strategy over time must be analyzed. Based on the above, Johan Paulsson in his article Multilevel Selection on Plasmid Replication formulates a theoretical hypothesis, based on the mechanism of multilevel selection, in which altruistic individuals are those who manage to establish themselves in a population above selfish ones. In detail, Paulsson refers to altruistic individuals as plasmids with stricter replication control systems relative to another type of plasmid. For their part, selfish individuals are plasmids whose replication system is less strict and, therefore, each plasmid has a higher copy number than the mentioned type. Thus, in the first place, a stochastic model of plasmid replication is proposed. This model consists of a part that describes the replication process of the possible types of plasmids and another part that describes the process of cell division. Secondly, the aim is to experimentally verify that altruistic plasmids are those that manage to fixate in a population of E. coli. For this, it is proposed to carry out a bacterial evolution experiment using a Turbidostat. Here, it is proposed to analyze, after a significant number of bacterial generations, what type of plasmid manages to fixate on the bacterial population and corroborate that the hypothesis, experimentally, is true. Finally, the results obtained are relevant for understanding social evolution not only on the bacterial scale but also for understanding behaviors of multicellular beings.FísicoPregrado51 páginasapplication/pdfengUniversidad de los AndesFísicaFacultad de CienciasDepartamento de FísicaMultilevel Selection in Escherichia coli Plasmids: a theoretical and experimental approachTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPSelección de grupos (Evolución)PlásmidosEscherichia coliFísica201512777Publicationhttps://scholar.google.es/citations?user=x8-YWMsAAAAJvirtual::10308-10000-0002-1802-3337virtual::10308-1https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000001817virtual::10308-1a4c0056f-ab75-4234-9297-925380d7633avirtual::10308-1a4c0056f-ab75-4234-9297-925380d7633avirtual::10308-1THUMBNAIL24802.pdf.jpg24802.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6400https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/0d91446e-fb76-466a-a487-4c87e9534d1e/downloadde7893ed763ef429c62513d21fb4d24dMD55ORIGINAL24802.pdfapplication/pdf5322655https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/cf833ba4-56a9-4b00-ac91-33291b00d1d0/download40ae0a61e9b685366e27cd18a55e8085MD51TEXT24802.pdf.txt24802.pdf.txtExtracted texttext/plain94457https://repositorio.uniandes.edu.co/bitstreams/9699b0bc-3287-4e80-b5f4-198c3fa55bc9/download86d52f168db5d8ac2a155af7bdd40fa5MD541992/53786oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/537862024-03-13 14:09:14.565http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/open.accesshttps://repositorio.uniandes.edu.coRepositorio institucional Sénecaadminrepositorio@uniandes.edu.co