Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa

Objetivos: Este estudio tuvo como objetivo evaluar la susceptibilidad de aislados clínicos de Enterobacterales y Pseudomonas aeruginosa a fosfomicina y determinar la concordancia de difusión en disco (DD) y microdilución en caldo (DMO) con dilución en agar (AD) para pruebas de susceptibilidad a fosf...

Full description

Autores:
Mojica Medina, Maria Fernanda
de la Cadena, Elsa
Hernández Gómez, Cristhian
Correa, Adriana
Appel, Tobias Manuel
Pallares, Christian José
Villegas, María Virginia
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Universidad El Bosque
Repositorio:
Repositorio U. El Bosque
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/5370
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12495/5370
https://doi.org/10.1016/j.jgar.2020.01.003
https://repositorio.unbosque.edu.co
Palabra clave:
Fosfomicina
Actividad antimicrobiana
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Pruebas de susceptibilidad
Fosfomycin
Antimicrobial activity
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Susceptibility tests
Rights
openAccess
License
Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
id UNBOSQUE2_fc36af8540108be728c81e06a37d3922
oai_identifier_str oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/5370
network_acronym_str UNBOSQUE2
network_name_str Repositorio U. El Bosque
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
dc.title.translated.spa.fl_str_mv Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
title Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
spellingShingle Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
Fosfomicina
Actividad antimicrobiana
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Pruebas de susceptibilidad
Fosfomycin
Antimicrobial activity
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Susceptibility tests
title_short Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
title_full Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
title_fullStr Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
title_full_unstemmed Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
title_sort Performance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa
dc.creator.fl_str_mv Mojica Medina, Maria Fernanda
de la Cadena, Elsa
Hernández Gómez, Cristhian
Correa, Adriana
Appel, Tobias Manuel
Pallares, Christian José
Villegas, María Virginia
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Mojica Medina, Maria Fernanda
de la Cadena, Elsa
Hernández Gómez, Cristhian
Correa, Adriana
Appel, Tobias Manuel
Pallares, Christian José
Villegas, María Virginia
dc.contributor.orcid.none.fl_str_mv de la Cadena, Elsa [0000-0003-0361-7893]
Pallares, Christian José [0000-0002-6093-7845]
Villegas, María Virginia [0000-0003-1898-9067]
dc.subject.spa.fl_str_mv Fosfomicina
Actividad antimicrobiana
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Pruebas de susceptibilidad
topic Fosfomicina
Actividad antimicrobiana
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Pruebas de susceptibilidad
Fosfomycin
Antimicrobial activity
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Susceptibility tests
dc.subject.keywords.spa.fl_str_mv Fosfomycin
Antimicrobial activity
Enterobacterales
Pseudomonas aeruginosa
Susceptibility tests
description Objetivos: Este estudio tuvo como objetivo evaluar la susceptibilidad de aislados clínicos de Enterobacterales y Pseudomonas aeruginosa a fosfomicina y determinar la concordancia de difusión en disco (DD) y microdilución en caldo (DMO) con dilución en agar (AD) para pruebas de susceptibilidad a fosfomicina. Métodos: La actividad de la fosfomicina contra 225 aislamientos clínicos de Escherichia coli ( n  = 64), Klebsiella pneumoniae ( n  = 68), Enterobacter spp. ( n  = 28) y P. aeruginosa ( n  = 65) fue probado por AD, DD y BMD. Para DD, los resultados se registraron considerando y no considerando las colonias que crecen dentro del halo de inhibición según lo recomendado por CLSI y EUCAST, respectivamente. Se utilizaron puntos de corte de Escherichia coli para todos los Enterobacterales. Los resultados se informaron como acuerdo categórico (CA), error mayor (ME; falso resistente), error muy mayor (VME; falso susceptible) y error menor (cualquier otra discrepancia). Resultados: La susceptibilidad a la fosfomicina de todas las especies analizadas fue> 90% en la EA. Siguiendo las pautas de CLSI, DD fue el único método que alcanzó ≥90% de CA con AD para E. coli y K. pneumoniae , aunque arrojó un 6% de ME. Ni DD ni BMD alcanzaron porcentajes aceptables de CA para Enterobacter spp. Siguiendo las pautas de EUCAST, ninguno de los métodos tuvo CA ≥ 90%. Para Enterobacterales, el mejor desempeño de DD se logra cuando se lee según lo indicado por EUCAST pero se interpreta de acuerdo con los puntos de corte CLSI (> 97% CA; 0% VME; ≤2% ME). Para P. aeruginosa , la DMO arrojó los mejores resultados (89% CA; 0% VME; 11% ME). Conclusión: Ni la DD ni la DMO proporcionan resultados precisos debido a porcentajes inaceptables de EM y EMV incluso cuando se realizan según lo previsto por las directrices.
publishDate 2020
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-02-18T14:14:58Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-02-18T14:14:58Z
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.local.none.fl_str_mv Artículo de revista
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.driver.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 2213-7173
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12495/5370
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv https://doi.org/10.1016/j.jgar.2020.01.003
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Universidad El Bosque
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv https://repositorio.unbosque.edu.co
identifier_str_mv 2213-7173
instname:Universidad El Bosque
reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
url http://hdl.handle.net/20.500.12495/5370
https://doi.org/10.1016/j.jgar.2020.01.003
https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.language.iso.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartofseries.spa.fl_str_mv Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2213-7173, Vol. 21, 2020, p.391-395
dc.relation.uri.none.fl_str_mv https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213716520300047
dc.rights.*.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.local.spa.fl_str_mv Acceso abierto
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
info:eu-repo/semantics/openAccess
Acceso abierto
dc.rights.creativecommons.none.fl_str_mv 2020
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Acceso abierto
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
2020
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Elsevier Ltd
dc.publisher.journal.spa.fl_str_mv Journal of Global Antimicrobial Resistance
institution Universidad El Bosque
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/c1e6f86f-a923-44f1-8797-385cec2e57a6/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/0c3cd7eb-ae0c-4893-965e-52242ff620cd/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/abc8dcf9-4b98-474f-a7c4-d4ecbbc66e57/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/bbdfc604-3460-423a-a806-2731321bd147/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/a016526e-8e76-469a-ba9c-7f937fb5a60c/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 399bcf973d9d2c39e3fd056bf0347670
4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
e139319bc82cbbf12aa5424ff7254a8d
6b56cdc489e06c491bbd85c6b94f54ce
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad El Bosque
repository.mail.fl_str_mv bibliotecas@biteca.com
_version_ 1814100701959159808
spelling Mojica Medina, Maria Fernandade la Cadena, ElsaHernández Gómez, CristhianCorrea, AdrianaAppel, Tobias ManuelPallares, Christian JoséVillegas, María Virginiade la Cadena, Elsa [0000-0003-0361-7893]Pallares, Christian José [0000-0002-6093-7845]Villegas, María Virginia [0000-0003-1898-9067]2021-02-18T14:14:58Z2021-02-18T14:14:58Z20202213-7173http://hdl.handle.net/20.500.12495/5370https://doi.org/10.1016/j.jgar.2020.01.003instname:Universidad El Bosquereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquehttps://repositorio.unbosque.edu.coObjetivos: Este estudio tuvo como objetivo evaluar la susceptibilidad de aislados clínicos de Enterobacterales y Pseudomonas aeruginosa a fosfomicina y determinar la concordancia de difusión en disco (DD) y microdilución en caldo (DMO) con dilución en agar (AD) para pruebas de susceptibilidad a fosfomicina. Métodos: La actividad de la fosfomicina contra 225 aislamientos clínicos de Escherichia coli ( n  = 64), Klebsiella pneumoniae ( n  = 68), Enterobacter spp. ( n  = 28) y P. aeruginosa ( n  = 65) fue probado por AD, DD y BMD. Para DD, los resultados se registraron considerando y no considerando las colonias que crecen dentro del halo de inhibición según lo recomendado por CLSI y EUCAST, respectivamente. Se utilizaron puntos de corte de Escherichia coli para todos los Enterobacterales. Los resultados se informaron como acuerdo categórico (CA), error mayor (ME; falso resistente), error muy mayor (VME; falso susceptible) y error menor (cualquier otra discrepancia). Resultados: La susceptibilidad a la fosfomicina de todas las especies analizadas fue> 90% en la EA. Siguiendo las pautas de CLSI, DD fue el único método que alcanzó ≥90% de CA con AD para E. coli y K. pneumoniae , aunque arrojó un 6% de ME. Ni DD ni BMD alcanzaron porcentajes aceptables de CA para Enterobacter spp. Siguiendo las pautas de EUCAST, ninguno de los métodos tuvo CA ≥ 90%. Para Enterobacterales, el mejor desempeño de DD se logra cuando se lee según lo indicado por EUCAST pero se interpreta de acuerdo con los puntos de corte CLSI (> 97% CA; 0% VME; ≤2% ME). Para P. aeruginosa , la DMO arrojó los mejores resultados (89% CA; 0% VME; 11% ME). Conclusión: Ni la DD ni la DMO proporcionan resultados precisos debido a porcentajes inaceptables de EM y EMV incluso cuando se realizan según lo previsto por las directrices.Objectives: This study aimed to evaluate the susceptibility of clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosa to fosfomycin and to determine the concordance of disk diffusion (DD) and broth microdilution (BMD) with agar dilution (AD) for fosfomycin susceptibility testing. Methods: The activity of fosfomycin against 225 clinical isolates of Escherichia coli (n = 64), Klebsiella pneumoniae (n = 68), Enterobacter spp. (n = 28) and P. aeruginosa (n = 65) was tested by AD, DD and BMD. For DD, results were recorded considering and not considering colonies growing within the inhibition halo as recommended by the CLSI and EUCAST, respectively. Escherichia coli breakpoints were used for all Enterobacterales. Results were reported as categorical agreement (CA), major error (ME; false-resistant), very major error (VME; false-susceptible) and minor error (any other discrepancies). Results: Fosfomycin susceptibility of all tested species was >90% by AD. Following CLSI guidelines, DD was the only method reaching ≥90% CA with AD for E. coli and K. pneumoniae, albeit yielding 6% ME. Neither DD nor BMD achieved acceptable CA percentages for Enterobacter spp. Following EUCAST guidelines, none of the methods had CA ≥ 90%. For Enterobacterales, the best performance of DD is achieved when read as indicated by EUCAST but interpreted according the CLSI breakpoints (>97% CA; 0% VME; ≤2% ME). For P. aeruginosa, BMD yielded the best results (89% CA; 0% VME; 11% ME). Conclusion: Neither DD or BMD provide accurate results owing to unacceptable ME and VME percentages even when performed as intended by the guidelines.application/pdfengElsevier LtdJournal of Global Antimicrobial ResistanceJournal of Global Antimicrobial Resistance, 2213-7173, Vol. 21, 2020, p.391-395https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213716520300047Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Acceso abiertohttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessAcceso abierto2020FosfomicinaActividad antimicrobianaEnterobacteralesPseudomonas aeruginosaPruebas de susceptibilidadFosfomycinAntimicrobial activityEnterobacteralesPseudomonas aeruginosaSusceptibility testsPerformance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosaPerformance of disk diffusion and broth microdilution for fosfomycin susceptibility testing of multidrug-resistant clinical isolates of Enterobacterales and Pseudomonas aeruginosaArtículo de revistahttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1info:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85ORIGINALMojica_Medina_Maria_Fernanda_2020.pdfMojica_Medina_Maria_Fernanda_2020.pdfapplication/pdf522019https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/c1e6f86f-a923-44f1-8797-385cec2e57a6/download399bcf973d9d2c39e3fd056bf0347670MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/0c3cd7eb-ae0c-4893-965e-52242ff620cd/download4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/abc8dcf9-4b98-474f-a7c4-d4ecbbc66e57/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53THUMBNAILMojica_Medina_Maria_Fernanda_2020.pdf.jpgMojica_Medina_Maria_Fernanda_2020.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg13183https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/bbdfc604-3460-423a-a806-2731321bd147/downloade139319bc82cbbf12aa5424ff7254a8dMD54TEXTMojica_Medina_Maria_Fernanda_2020.pdf.txtMojica_Medina_Maria_Fernanda_2020.pdf.txtExtracted texttext/plain28790https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/a016526e-8e76-469a-ba9c-7f937fb5a60c/download6b56cdc489e06c491bbd85c6b94f54ceMD5520.500.12495/5370oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/53702024-02-06 22:55:22.515http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalopen.accesshttps://repositorio.unbosque.edu.coRepositorio Institucional Universidad El Bosquebibliotecas@biteca.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