Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia

Toxoplasma gondii es un parásito que afecta diversos organismos de sangre caliente, entre ellos el ser humano, se caracteriza por presentar infección crónica con formación de quistes especialmente en tejido cerebral. Los quistes de este parásito presentan diversos tamaños mediados por procesos de in...

Full description

Autores:
Valencia-Vidal, Brayan A.
Juez-Castillo, Graciela
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2016
Institución:
Universidad El Bosque
Repositorio:
Repositorio U. El Bosque
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/5137
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12495/5137
Palabra clave:
Toxoplasma gondii
Volumen del quiste
Visión por computador
Procesamiento de imágenes
Rights
openAccess
License
Acceso abierto
id UNBOSQUE2_f9a2a304efab8ccf32194495982c0a1e
oai_identifier_str oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/5137
network_acronym_str UNBOSQUE2
network_name_str Repositorio U. El Bosque
repository_id_str
spelling Valencia-Vidal, Brayan A.Juez-Castillo, Graciela2020-11-26T18:48:15Z2020-11-26T18:48:15Z2016http://hdl.handle.net/20.500.12495/5137instname:Universidad El Bosquereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquerepourl:https://repositorio.unbosque.edu.coToxoplasma gondii es un parásito que afecta diversos organismos de sangre caliente, entre ellos el ser humano, se caracteriza por presentar infección crónica con formación de quistes especialmente en tejido cerebral. Los quistes de este parásito presentan diversos tamaños mediados por procesos de interacción entre el huésped y el patógeno. Este trabajo tuvo como objetivo desarrollar un algoritmo computacional para estimar el volumen de quistes de T. gondii presentes en imágenes biológicas. Las imágenes se obtuvieron mediante microscopia de fluorescencia usando un microscopio electrónico Carl Zeiss Imager.A2 AXIO y cámara Nikon Carl Zeiss SONY DSC-S85 (4.1 Mega pixels CCD 6x zoom). El algoritmo se desarrolló a través del tratamiento digital de imágenes de los quistes presentes, mediante el uso de la librería OpenCV. Este método computacional estimó el volumen de 30 quistes del parásito suponiendo una conformación elipsoidal y obteniéndose volúmenes entre 12,5 (103) y 114 (103) um3 para los quistes de T. gondii encontrados. El algoritmo calculó el volumen en pixeles y posteriormente realizó la trazabilidad de la imagen para obtener el volumen estimado del quiste en micrómetros cúbicos (um3).application/pdfspaInternational Institute of Informatics and Systemics, IIISCISCI 2016 - Decima Quinta Conferencia Iberoamericana en Sistemas, Cibernetica e Informatica, Decimo Tercer Simposium Iberoamericano en Educacion, Cibernetica e Informatica, SIECI 2016 – Memorias, 2016, p. 203-206http://www.iiis.org/CDs2016/CD2016Summer/papers/CA736GD.pdfToxoplasma gondiiVolumen del quisteVisión por computadorProcesamiento de imágenesMedición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescenciaMedición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescenciaArtículo de revistahttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1info:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Acceso abiertohttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessAcceso abierto2016ORIGINALValencia_Vidal_Brayan_A._2016.pdfValencia_Vidal_Brayan_A._2016.pdfapplication/pdf973491https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/42586f9d-ab91-4135-a102-807d81bbdf7e/download1656cd2c1c4bca49aca8abb80dccf1a6MD51THUMBNAILValencia_Vidal_Brayan_A._2016.pdf.jpgValencia_Vidal_Brayan_A._2016.pdf.jpgimage/jpeg5775https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/f0b114f8-6251-4ebf-8125-9759e4f30472/download7210a811635d1799e7c05fee5d259be7MD52TEXTValencia_Vidal_Brayan_A._2016.pdf.txtValencia_Vidal_Brayan_A._2016.pdf.txtExtracted texttext/plain16113https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/bf4a5f3c-f9aa-4bab-83a7-3244a1053311/download66374dbf680faace967ba294190cff71MD5320.500.12495/5137oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/51372024-02-06 22:55:16.799restrictedhttps://repositorio.unbosque.edu.coRepositorio Institucional Universidad El Bosquebibliotecas@biteca.com
dc.title.spa.fl_str_mv Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
dc.title.translated.spa.fl_str_mv Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
title Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
spellingShingle Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
Toxoplasma gondii
Volumen del quiste
Visión por computador
Procesamiento de imágenes
title_short Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
title_full Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
title_fullStr Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
title_full_unstemmed Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
title_sort Medición del volumen de quistes de Toxoplasma gondii mediante visión por computador en imágenes de microscopia de fluorescencia
dc.creator.fl_str_mv Valencia-Vidal, Brayan A.
Juez-Castillo, Graciela
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Valencia-Vidal, Brayan A.
Juez-Castillo, Graciela
dc.subject.spa.fl_str_mv Toxoplasma gondii
Volumen del quiste
Visión por computador
Procesamiento de imágenes
topic Toxoplasma gondii
Volumen del quiste
Visión por computador
Procesamiento de imágenes
description Toxoplasma gondii es un parásito que afecta diversos organismos de sangre caliente, entre ellos el ser humano, se caracteriza por presentar infección crónica con formación de quistes especialmente en tejido cerebral. Los quistes de este parásito presentan diversos tamaños mediados por procesos de interacción entre el huésped y el patógeno. Este trabajo tuvo como objetivo desarrollar un algoritmo computacional para estimar el volumen de quistes de T. gondii presentes en imágenes biológicas. Las imágenes se obtuvieron mediante microscopia de fluorescencia usando un microscopio electrónico Carl Zeiss Imager.A2 AXIO y cámara Nikon Carl Zeiss SONY DSC-S85 (4.1 Mega pixels CCD 6x zoom). El algoritmo se desarrolló a través del tratamiento digital de imágenes de los quistes presentes, mediante el uso de la librería OpenCV. Este método computacional estimó el volumen de 30 quistes del parásito suponiendo una conformación elipsoidal y obteniéndose volúmenes entre 12,5 (103) y 114 (103) um3 para los quistes de T. gondii encontrados. El algoritmo calculó el volumen en pixeles y posteriormente realizó la trazabilidad de la imagen para obtener el volumen estimado del quiste en micrómetros cúbicos (um3).
publishDate 2016
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2016
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2020-11-26T18:48:15Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2020-11-26T18:48:15Z
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.local.none.fl_str_mv Artículo de revista
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.driver.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12495/5137
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Universidad El Bosque
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
url http://hdl.handle.net/20.500.12495/5137
identifier_str_mv instname:Universidad El Bosque
reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartofseries.spa.fl_str_mv CISCI 2016 - Decima Quinta Conferencia Iberoamericana en Sistemas, Cibernetica e Informatica, Decimo Tercer Simposium Iberoamericano en Educacion, Cibernetica e Informatica, SIECI 2016 – Memorias, 2016, p. 203-206
dc.relation.uri.none.fl_str_mv http://www.iiis.org/CDs2016/CD2016Summer/papers/CA736GD.pdf
dc.rights.local.spa.fl_str_mv Acceso abierto
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
info:eu-repo/semantics/openAccess
Acceso abierto
dc.rights.creativecommons.none.fl_str_mv 2016
rights_invalid_str_mv Acceso abierto
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
2016
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv International Institute of Informatics and Systemics, IIIS
institution Universidad El Bosque
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/42586f9d-ab91-4135-a102-807d81bbdf7e/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/f0b114f8-6251-4ebf-8125-9759e4f30472/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/bf4a5f3c-f9aa-4bab-83a7-3244a1053311/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 1656cd2c1c4bca49aca8abb80dccf1a6
7210a811635d1799e7c05fee5d259be7
66374dbf680faace967ba294190cff71
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad El Bosque
repository.mail.fl_str_mv bibliotecas@biteca.com
_version_ 1814100701880516608