Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia

Staphylococcus aureus es uno de los principales patógenos del ser humano, que causa un espectro de infecciones clínicas que involucran desde la piel y los tejidos blandos hasta infecciones más graves como la bacteriemia. En la actualidad infecciones severas por Staphylococcus aureus susceptible a me...

Full description

Autores:
Olivares Manrique, Paula Camila
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Universidad El Bosque
Repositorio:
Repositorio U. El Bosque
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/6335
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12495/6335
Palabra clave:
Staphylococcus aureus susceptible a meticilina
Bacteriemia
Factores de virulencia
Betalactamasas
Agr
Efecto inóculo a cefazolina
Staphylococcus aureus
Factores de virulencia
Beta-Lactamasas
Cefazolin inoculum effect
Methicillin-susceptible Staphylococcus aureus
Bacteremia
Virulence factors
Agr
Betalactamases
W100
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
id UNBOSQUE2_f3e1eba8987f8160c056f0ee26bfd0f1
oai_identifier_str oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/6335
network_acronym_str UNBOSQUE2
network_name_str Repositorio U. El Bosque
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
dc.title.translated.spa.fl_str_mv Genomic characterization of clinical isolates of methycilin susceptible Staphylococcus aureus, with and without cefazoline inoculum effect recovered from a patient with bacteremia
title Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
spellingShingle Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
Staphylococcus aureus susceptible a meticilina
Bacteriemia
Factores de virulencia
Betalactamasas
Agr
Efecto inóculo a cefazolina
Staphylococcus aureus
Factores de virulencia
Beta-Lactamasas
Cefazolin inoculum effect
Methicillin-susceptible Staphylococcus aureus
Bacteremia
Virulence factors
Agr
Betalactamases
W100
title_short Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
title_full Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
title_fullStr Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
title_full_unstemmed Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
title_sort Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia
dc.creator.fl_str_mv Olivares Manrique, Paula Camila
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Rincón, Sandra
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Olivares Manrique, Paula Camila
dc.subject.spa.fl_str_mv Staphylococcus aureus susceptible a meticilina
Bacteriemia
Factores de virulencia
Betalactamasas
Agr
Efecto inóculo a cefazolina
topic Staphylococcus aureus susceptible a meticilina
Bacteriemia
Factores de virulencia
Betalactamasas
Agr
Efecto inóculo a cefazolina
Staphylococcus aureus
Factores de virulencia
Beta-Lactamasas
Cefazolin inoculum effect
Methicillin-susceptible Staphylococcus aureus
Bacteremia
Virulence factors
Agr
Betalactamases
W100
dc.subject.decs.spa.fl_str_mv Staphylococcus aureus
Factores de virulencia
Beta-Lactamasas
dc.subject.keywords.spa.fl_str_mv Cefazolin inoculum effect
Methicillin-susceptible Staphylococcus aureus
Bacteremia
Virulence factors
Agr
Betalactamases
dc.subject.nlm.none.fl_str_mv W100
description Staphylococcus aureus es uno de los principales patógenos del ser humano, que causa un espectro de infecciones clínicas que involucran desde la piel y los tejidos blandos hasta infecciones más graves como la bacteriemia. En la actualidad infecciones severas por Staphylococcus aureus susceptible a meticilina (SASM) son de gran relevancia y han excedido las causadas por Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM). La cefazolina, cefalosporina de primera generación ha mostrado buenos resultados terapéuticos, menos efectos adversos y mejor costo efectividad en infecciones graves causadas por SASM, y es una alternativa terapéutica de los agentes de primera línea en estas infecciones, las penicilinas estafilocócicas. Sin embargo, un obstáculo en la terapia clínica con cefazolina es el efecto inóculo a cefazolina (EIC), fenotipo definido como un aumento significativo en la CIM (concentración inhibitoria mínima) a cefazolina cuando el inóculo bacteriano se incrementa a 10 7 (UFC/ml) comparado con la CIM obtenida con el inóculo bacteriano estándar de 10 5 UFC/ml . El EIC se ha relacionado con falla terapéutica por cefazolina particularmente en enfermedades con alta carga bacteriana como la bacteriemia, endocarditis y también a mayor mortalidad. El presente estudio buscó caracterizar el genoma de aislamientos de S. aureus susceptibles a meticilina con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de bacteriemia a partir de un paciente. Se presenta la descripción de los hallazgos de la secuenciación de genoma completo para estudiar características genéticas asociadas al efecto inóculo a cefazolina y factores de virulencia. Asimismo, se discuten posibles hipótesis sobre el EIC como el tipo de betalactamasa, alotipo de BlaZ, y Agr, ya que el mecanismo genético de este fenotipo no se conoce completamente.
publishDate 2020
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2021-11-09T12:35:08Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2021-11-09T12:35:08Z
dc.type.local.spa.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.hasversion.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.driver.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12495/6335
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Universidad El Bosque
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
url http://hdl.handle.net/20.500.12495/6335
identifier_str_mv instname:Universidad El Bosque
reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.*.fl_str_mv Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.rights.local.spa.fl_str_mv Acceso abierto
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Acceso abierto
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.program.spa.fl_str_mv Medicina
dc.publisher.grantor.spa.fl_str_mv Universidad El Bosque
dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv Facultad de Medicina
institution Universidad El Bosque
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/116e9811-05eb-48bc-b72b-d1666ddb825b/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/661f73ad-22dd-48f3-afa6-c892c174136d/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/305c8351-97ed-43e4-bda5-fb97451d9338/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/80a5ff4f-f6e0-4475-b318-2f07a0cd4381/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/f0f9f8e5-96f6-40af-96bd-1729649eadb3/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/71862a7e-b6f4-4fda-bfaf-91416905ebac/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/a32a1e8a-40d9-42e5-b57b-3a69ca6259c7/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b3072ddd-0e58-474d-9716-4adc2544fcc2/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 934f4ca17e109e0a05eaeaba504d7ce4
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
6c7d0ff9e39bc72e48d21ebbbe82f776
a416766f48b5912b3d9218dd6bc40419
95d26d161cd2bb571afa8edd1e85dc97
4a81780ef658a67d8515091234450455
25ac895ad983bb918c30a7e0b8c4c293
c7f17d1e47340994c33042624a436de0
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad El Bosque
repository.mail.fl_str_mv bibliotecas@biteca.com
_version_ 1814100802278522880
spelling Rincón, SandraOlivares Manrique, Paula Camila2021-11-09T12:35:08Z2021-11-09T12:35:08Z2020http://hdl.handle.net/20.500.12495/6335instname:Universidad El Bosquereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquerepourl:https://repositorio.unbosque.edu.coStaphylococcus aureus es uno de los principales patógenos del ser humano, que causa un espectro de infecciones clínicas que involucran desde la piel y los tejidos blandos hasta infecciones más graves como la bacteriemia. En la actualidad infecciones severas por Staphylococcus aureus susceptible a meticilina (SASM) son de gran relevancia y han excedido las causadas por Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM). La cefazolina, cefalosporina de primera generación ha mostrado buenos resultados terapéuticos, menos efectos adversos y mejor costo efectividad en infecciones graves causadas por SASM, y es una alternativa terapéutica de los agentes de primera línea en estas infecciones, las penicilinas estafilocócicas. Sin embargo, un obstáculo en la terapia clínica con cefazolina es el efecto inóculo a cefazolina (EIC), fenotipo definido como un aumento significativo en la CIM (concentración inhibitoria mínima) a cefazolina cuando el inóculo bacteriano se incrementa a 10 7 (UFC/ml) comparado con la CIM obtenida con el inóculo bacteriano estándar de 10 5 UFC/ml . El EIC se ha relacionado con falla terapéutica por cefazolina particularmente en enfermedades con alta carga bacteriana como la bacteriemia, endocarditis y también a mayor mortalidad. El presente estudio buscó caracterizar el genoma de aislamientos de S. aureus susceptibles a meticilina con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de bacteriemia a partir de un paciente. Se presenta la descripción de los hallazgos de la secuenciación de genoma completo para estudiar características genéticas asociadas al efecto inóculo a cefazolina y factores de virulencia. Asimismo, se discuten posibles hipótesis sobre el EIC como el tipo de betalactamasa, alotipo de BlaZ, y Agr, ya que el mecanismo genético de este fenotipo no se conoce completamente.MincienciasMédico cirujanoPregradoStaphylococcus aureus is one of the main human pathogens causing a spectrum of clinical infections ranging from skin and soft tissue to more serious infections such as bacteremia. Currently, severe infections by methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA) are of great relevance and have exceeded those caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). Cefazolin, a first-generation cephalosporin, has shown good therapeutic results, fewer adverse effects, and better cost effectiveness in severe infections caused by MSSA, and is a therapeutic alternative to first-line agents in these infections; staphylococcal penicillins. However, an obstacle in clinical therapy with cefazolin is the inoculum effect to cefazolin, a phenotype defined as a significant increase in the MIC (minimal inhibitory concentration) to cefazolin when the bacterial inoculum is increased to 10 7 (CFU/ml) compared to the MIC obtained with the standard bacterial inoculum of 10 5 (CFU / ml). The cefazolin inoculum effect (CIE) has been related to therapeutic failure due to cefazolin, particularly in diseases with high bacterial load such as bacteremia, endocarditis and also to higher mortality. The present study sought to characterize the genome of methicillin-susceptible S. aureus isolates with and without cefazolin inoculum effect recovered from bacteremia from a patient. A description of the findings of the whole genome sequencing is presented to study genetic characteristics associated with the inoculum effect of cefazolin and virulence factors. Likewise, possible hypotheses about CIE are discussed, such as the beta-lactamase type, BlaZ allotype, and Agr, since the genetic mechanism of this phenotype is not fully understood.application/pdfspaAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 InternacionalAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Acceso abiertoinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Staphylococcus aureus susceptible a meticilinaBacteriemiaFactores de virulenciaBetalactamasasAgrEfecto inóculo a cefazolinaStaphylococcus aureusFactores de virulenciaBeta-LactamasasCefazolin inoculum effectMethicillin-susceptible Staphylococcus aureusBacteremiaVirulence factorsAgrBetalactamasesW100Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemiaGenomic characterization of clinical isolates of methycilin susceptible Staphylococcus aureus, with and without cefazoline inoculum effect recovered from a patient with bacteremiaMedicinaUniversidad El BosqueFacultad de MedicinaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81031https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/116e9811-05eb-48bc-b72b-d1666ddb825b/download934f4ca17e109e0a05eaeaba504d7ce4MD56LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/661f73ad-22dd-48f3-afa6-c892c174136d/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD57ORIGINALOlivares_Manrique_Paula_2020.pdfOlivares_Manrique_Paula_2020.pdfapplication/pdf1669106https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/305c8351-97ed-43e4-bda5-fb97451d9338/download6c7d0ff9e39bc72e48d21ebbbe82f776MD51Olivares_Manrique_Paula_2020_Carta de autorización.pdfOlivares_Manrique_Paula_2020_Carta de autorización.pdfapplication/pdf258369https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/80a5ff4f-f6e0-4475-b318-2f07a0cd4381/downloada416766f48b5912b3d9218dd6bc40419MD55THUMBNAILOlivares_Manrique_Paula_2020.pdf.jpgOlivares_Manrique_Paula_2020.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4419https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/f0f9f8e5-96f6-40af-96bd-1729649eadb3/download95d26d161cd2bb571afa8edd1e85dc97MD58Olivares_Manrique_Paula_2020_Carta de autorización.pdf.jpgOlivares_Manrique_Paula_2020_Carta de autorización.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8088https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/71862a7e-b6f4-4fda-bfaf-91416905ebac/download4a81780ef658a67d8515091234450455MD59TEXTOlivares_Manrique_Paula_2020.pdf.txtOlivares_Manrique_Paula_2020.pdf.txtExtracted texttext/plain101428https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/a32a1e8a-40d9-42e5-b57b-3a69ca6259c7/download25ac895ad983bb918c30a7e0b8c4c293MD510Olivares_Manrique_Paula_2020_Carta de autorización.pdf.txtOlivares_Manrique_Paula_2020_Carta de autorización.pdf.txtExtracted texttext/plain7380https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b3072ddd-0e58-474d-9716-4adc2544fcc2/downloadc7f17d1e47340994c33042624a436de0MD51120.500.12495/6335oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/63352024-02-07 07:40:58.346http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacionalopen.accesshttps://repositorio.unbosque.edu.coRepositorio Institucional Universidad El Bosquebibliotecas@biteca.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