Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae

Klebsiella pneumoniae es una bacteria Gram negativa de importancia médica, debido a su capacidad de generar diferentes infecciones en el humano dentro o fuera de ambientes hospitalarios. Además, esta bacteria también tiene la capacidad de ser resistente a un elevado número de antibióticos, como los...

Full description

Autores:
Rodríguez Torres, Mariana Alejandra
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2022
Institución:
Universidad El Bosque
Repositorio:
Repositorio U. El Bosque
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/10861
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12495/10861
Palabra clave:
Klebsiella pneumoniae
Conjugación
Tn6454
Resistencia
blaKPC
570
Klebsiella pneumoniae
Tn6454
blaKPC
Conjugation
Resistance
Rights
openAccess
License
Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional
id UNBOSQUE2_eede8d5196123d2061a10cbf6058ed5c
oai_identifier_str oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/10861
network_acronym_str UNBOSQUE2
network_name_str Repositorio U. El Bosque
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
dc.title.translated.spa.fl_str_mv Analysis of the Mobility of the Transposon Tn6454 in Klebsiella pneumoniae
title Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
spellingShingle Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae
Conjugación
Tn6454
Resistencia
blaKPC
570
Klebsiella pneumoniae
Tn6454
blaKPC
Conjugation
Resistance
title_short Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
title_full Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
title_fullStr Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
title_full_unstemmed Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
title_sort Análisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae
dc.creator.fl_str_mv Rodríguez Torres, Mariana Alejandra
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Escobar Pérez, Javier Antonio
Abril Riaño, Deisy Julieth
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Rodríguez Torres, Mariana Alejandra
dc.contributor.orcid.none.fl_str_mv Rodríguez Torres, Mariana Alejandra [0000-0002-4480-3898]
dc.subject.spa.fl_str_mv Klebsiella pneumoniae
Conjugación
Tn6454
Resistencia
blaKPC
topic Klebsiella pneumoniae
Conjugación
Tn6454
Resistencia
blaKPC
570
Klebsiella pneumoniae
Tn6454
blaKPC
Conjugation
Resistance
dc.subject.ddc.none.fl_str_mv 570
dc.subject.keywords.spa.fl_str_mv Klebsiella pneumoniae
Tn6454
blaKPC
Conjugation
Resistance
description Klebsiella pneumoniae es una bacteria Gram negativa de importancia médica, debido a su capacidad de generar diferentes infecciones en el humano dentro o fuera de ambientes hospitalarios. Además, esta bacteria también tiene la capacidad de ser resistente a un elevado número de antibióticos, como los carbapenémicos, antibióticos de última línea empleados para el tratamiento de infecciones complejas hospitalarias. Para el 2012 en Colombia se reporta un elevado incremento en aislamientos de K. pneumoniae en UCI, generando un 15% de los casos infección, con un incremento del 7% en la resistencia a carbapenémicos. El mecanismo de resistencia a carbapenémicos de Klebsiella pneumoniae es la producción de la enzima KPC, la cual es codificada por el gen blaKPC. Este gen ha presentado una alta propagación debido principalmente a su movilización por diferentes isoformas del transposón Tn4401, un elemento genético que se ha movilizado en varios plásmidos de esta bacteria. En 2021 el Laboratorio de Genética Molecular Bacteriana identificó al transposón Tn6454, un nuevo elemento no relacionado con el Tn4401 (NTEKPC-IIe), el cual también albergaba el gen blaKPC, con un tamaño de 6.648pb, dentro de un plásmido IncN de 15.947pb (p33Kpn12-KPC) en la cepa 33Kpn12 de K. pneumoniae. Teniendo en cuenta el impacto clínico que tiene esta nueva plataforma genética, el objetivo de este proyecto fue analizar la movilización del transposón Tn6454 en el aislamiento 33Kpn12 de Klebsiella pneumoniae. Para cumplir con este objetivo se plantearon dos estrategias metodológicas diferentes, la primera se basó en el método de conjugación en medio líquido donde la cepa donadora fue la 33Kpn12 de K. pneumoniae y la cepa receptora fue E.coli J53; la segunda estrategia se basó en el método de conjugación en medio sólido, donde la cepa donadora fue E.coli K12 transformada y la receptora fue E.coli J53. Finalmente, se obtuvo una población bacteriana resistente a Trimetoprim-sulfametoxazol, Meropenem y Azida de Sodio, sugiriendo la posible movilización de los plásmidos, que albergan los genes de resistencia a cada uno de estos antibióticos. Para la confirmación de la movilización de Tn6454, se realizaron pruebas moleculares mediante la técnica de PCR convencional, identificando la presencia de Tn6454 dentro de una población bacteriana, en un ambiente genómico diferente al descrito en el plásmido p33Kpn12-KPC, lo que sugiere que el transposón se movilizó de manera independiente.
publishDate 2022
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2022
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2023-07-04T20:07:09Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2023-07-04T20:07:09Z
dc.type.local.spa.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.hasversion.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.driver.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12495/10861
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv instname:Universidad El Bosque
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
url http://hdl.handle.net/20.500.12495/10861
identifier_str_mv instname:Universidad El Bosque
reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque
repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.*.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.rights.local.spa.fl_str_mv Acceso abierto
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Acceso abierto
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.program.spa.fl_str_mv Biología
dc.publisher.grantor.spa.fl_str_mv Universidad El Bosque
dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv Facultad de Ciencias
institution Universidad El Bosque
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/76c42a29-7fa9-4ec7-aec7-6e171e986c0b/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/011b3106-76a5-4c83-b8e4-cef9a76319c5/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/4ffef1c3-4c76-40a2-850d-42adf7b0bfe5/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/c891c9c7-d468-457c-9d5b-21407bb85f6c/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/4aadddb1-9960-4011-bc30-3033b5653682/download
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/91381720-2914-4693-94b5-cee3056c9835/download
bitstream.checksum.fl_str_mv ac097d8323c8f58bab56991136aee027
4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347
17cc15b951e7cc6b3728a574117320f9
6ac6a1c913106ef2d19a40b5ca8bed06
c79e75af297b71573698ae643325ecb6
6be86835fb049fc8ba46566ff136e2d0
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad El Bosque
repository.mail.fl_str_mv bibliotecas@biteca.com
_version_ 1814100794801127424
spelling Escobar Pérez, Javier AntonioAbril Riaño, Deisy JuliethRodríguez Torres, Mariana AlejandraRodríguez Torres, Mariana Alejandra [0000-0002-4480-3898]2023-07-04T20:07:09Z2023-07-04T20:07:09Z2022http://hdl.handle.net/20.500.12495/10861instname:Universidad El Bosquereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquerepourl:https://repositorio.unbosque.edu.coKlebsiella pneumoniae es una bacteria Gram negativa de importancia médica, debido a su capacidad de generar diferentes infecciones en el humano dentro o fuera de ambientes hospitalarios. Además, esta bacteria también tiene la capacidad de ser resistente a un elevado número de antibióticos, como los carbapenémicos, antibióticos de última línea empleados para el tratamiento de infecciones complejas hospitalarias. Para el 2012 en Colombia se reporta un elevado incremento en aislamientos de K. pneumoniae en UCI, generando un 15% de los casos infección, con un incremento del 7% en la resistencia a carbapenémicos. El mecanismo de resistencia a carbapenémicos de Klebsiella pneumoniae es la producción de la enzima KPC, la cual es codificada por el gen blaKPC. Este gen ha presentado una alta propagación debido principalmente a su movilización por diferentes isoformas del transposón Tn4401, un elemento genético que se ha movilizado en varios plásmidos de esta bacteria. En 2021 el Laboratorio de Genética Molecular Bacteriana identificó al transposón Tn6454, un nuevo elemento no relacionado con el Tn4401 (NTEKPC-IIe), el cual también albergaba el gen blaKPC, con un tamaño de 6.648pb, dentro de un plásmido IncN de 15.947pb (p33Kpn12-KPC) en la cepa 33Kpn12 de K. pneumoniae. Teniendo en cuenta el impacto clínico que tiene esta nueva plataforma genética, el objetivo de este proyecto fue analizar la movilización del transposón Tn6454 en el aislamiento 33Kpn12 de Klebsiella pneumoniae. Para cumplir con este objetivo se plantearon dos estrategias metodológicas diferentes, la primera se basó en el método de conjugación en medio líquido donde la cepa donadora fue la 33Kpn12 de K. pneumoniae y la cepa receptora fue E.coli J53; la segunda estrategia se basó en el método de conjugación en medio sólido, donde la cepa donadora fue E.coli K12 transformada y la receptora fue E.coli J53. Finalmente, se obtuvo una población bacteriana resistente a Trimetoprim-sulfametoxazol, Meropenem y Azida de Sodio, sugiriendo la posible movilización de los plásmidos, que albergan los genes de resistencia a cada uno de estos antibióticos. Para la confirmación de la movilización de Tn6454, se realizaron pruebas moleculares mediante la técnica de PCR convencional, identificando la presencia de Tn6454 dentro de una población bacteriana, en un ambiente genómico diferente al descrito en el plásmido p33Kpn12-KPC, lo que sugiere que el transposón se movilizó de manera independiente.Laboratorio de Genetica Molecular BacterianaBiólogoPregradoKlebsiella pneumoniae is a Gram-negative bacterium of medical importance, due to its ability to generate different infections in humans inside or outside hospital environments. In addition, this bacterium also has the capacity to be resistant to a large number of antibiotics, such as carbapenems, last-line antibiotics used to treat complex hospital infections. For 2012 in Colombia, a high increase in K. pneumoniae isolates in the ICU was reported, generating 15% of infection cases, with a 7% increase in resistance to carbapenems. The mechanism of resistance to carbapenems in Klebsiella pneumoniae is the production of the KPC enzyme, which is encoded by the blaKPC gene. This gene has shown a high propagation mainly due to its mobilization by different isoforms of the Tn4401 transposon, a genetic element that has been mobilized in various plasmids of this bacterium. In 2021, the Bacterial Molecular Genetics Laboratory identified the transposon Tn6454, a new element not related to Tn4401 (NTEKPC-IIe), which also harbored the blaKPC gene, with a size of 6,648bp, within a 15,947bp IncN plasmid (p33Kpn12-KPC) in the K. pneumoniae strain 33Kpn12. Taking into account the clinical impact of this new genetic platform, the aim of this project was to analyze the mobilization of the Tn6454 transposon in the 33Kpn12 isolate of Klebsiella pneumoniae. To meet this objective, two different methodological strategies were proposed. The first was based on the conjugation method in liquid medium where the donor strain was K. pneumoniae 33Kpn12 and the recipient strain was E.coli J53; The second strategy was based on the solid medium conjugation method, where the donor strain was transformed E.coli K12 and the recipient was E.coli J53. Finally, a bacterial population resistant to Trimethoprim-sulfamethoxazole, Meropenem and Sodium Azide was obtained, suggesting the possible mobilization of the plasmids, which house the resistance genes to each of these antibiotics. To confirm the mobilization of Tn6454, molecular tests were performed using the conventional PCR technique, identifying the presence of Tn6454 within a bacterial population, in a different genomic environment from that described in the p33Kpn12-KPC plasmid, suggesting that the transposon mobilized independently.application/pdfspaAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Acceso abiertoinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Klebsiella pneumoniaeConjugaciónTn6454ResistenciablaKPC570Klebsiella pneumoniaeTn6454blaKPCConjugationResistanceAnálisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniaeAnalysis of the Mobility of the Transposon Tn6454 in Klebsiella pneumoniaeBiologíaUniversidad El BosqueFacultad de CienciasTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALAnálisis de la movilidad del transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae.pdfAnálisis de la movilidad del transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae.pdfAnálisis de la Movilidad del Transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniaeapplication/pdf9072135https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/76c42a29-7fa9-4ec7-aec7-6e171e986c0b/downloadac097d8323c8f58bab56991136aee027MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8805https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/011b3106-76a5-4c83-b8e4-cef9a76319c5/download4460e5956bc1d1639be9ae6146a50347MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82000https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/4ffef1c3-4c76-40a2-850d-42adf7b0bfe5/download17cc15b951e7cc6b3728a574117320f9MD54Anexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB (2).pdfAnexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB (2).pdfCarta d autorizaciónapplication/pdf272216https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/c891c9c7-d468-457c-9d5b-21407bb85f6c/download6ac6a1c913106ef2d19a40b5ca8bed06MD56THUMBNAILAnálisis de la movilidad del transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae.pdf.jpgAnálisis de la movilidad del transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae.pdf.jpgPortadaimage/jpeg22927https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/4aadddb1-9960-4011-bc30-3033b5653682/downloadc79e75af297b71573698ae643325ecb6MD55TEXTAnálisis de la movilidad del transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae.pdf.txtAnálisis de la movilidad del transposón Tn6454 en Klebsiella pneumoniae.pdf.txtExtracted texttext/plain101665https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/91381720-2914-4693-94b5-cee3056c9835/download6be86835fb049fc8ba46566ff136e2d0MD5720.500.12495/10861oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/108612024-02-07 06:35:23.356http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacionalopen.accesshttps://repositorio.unbosque.edu.coRepositorio Institucional Universidad El Bosquebibliotecas@biteca.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