Implementación de un protocolo para la detección de virus dengue por RT-qPCR en muestras biológicas

El dengue es una enfermedad tropical causada por un virus perteneciente a la familia Flaviviridae, es transmitido principalmente por artrópodos hematófagos especialmente por la picadura de mosquitos hembra de la especie Aedes aegypti; este virus presenta cuatro serotipos que causan desde una enferme...

Full description

Autores:
Vanegas Moncada, Oscar Leonardo
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2022
Institución:
Universidad El Bosque
Repositorio:
Repositorio U. El Bosque
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/8273
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12495/8273
Palabra clave:
Dengue
Serotipo
RT-qPCR
Detección
570
Dengue
Serotype
RT-qPCR
Detection
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
Description
Summary:El dengue es una enfermedad tropical causada por un virus perteneciente a la familia Flaviviridae, es transmitido principalmente por artrópodos hematófagos especialmente por la picadura de mosquitos hembra de la especie Aedes aegypti; este virus presenta cuatro serotipos que causan desde una enfermedad asintomática, síntomas similares a una gripe, hasta hemorragias, falla sistémica y muerte. En Colombia, el principal método de detección molecular del virus en muestras biológicas es la PCR convencional o semianidada; dado que el país en la actualidad tiene una mayor capacidad en infraestructura y personal calificado para realizar pruebas de PCR cuantitativa o en tiempo real (qPCR) en este estudio se evaluó el desempeño de tres protocolos reportados de RT-qPCR en la literatura. Uno tiene como blanco de detección el gen de cápside, otro el extremo 3´no traducible y el tercero un fragmento específico de cada serotipo. Una vez estandarizadas las condiciones de amplificación para cada protocolo, se estableció la eficiencia de la reacción y la sensibilidad analítica de cada ensayo. Los resultados demostraron que el protocolo multiplex, que permite la serotipificación, es el que presenta mayor sensibilidad y por tanto fue utilizado para la detección del virus en muestras provenientes de donantes de sangre y mosquitos Ae. aegypti recolectados en campo. La comparación de los resultados obtenidos con RT-qPCR contra el método tradicional de RT-PCR anidada, nos permite sugerir que este último permite identificar muestras con cargas virales más bajas, por lo cual sería el indicado para definir infección infección por virus dengue.