Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación
La serotonina (5-HT) es un neurotransmisor de monoamina conservado filogenéticamente que ocupa una gran relevancia en su papel en los tejidos periféricos, incluido el sistema inmunológico. Las principales patologías relacionadas con la variación de los niveles de serotonina son la depresión, los tum...
- Autores:
-
Holguín Hurtado, Karen Tatiana
Méndez Bohórquez, Mayra Julieth
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2022
- Institución:
- Universidad El Bosque
- Repositorio:
- Repositorio U. El Bosque
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/7926
- Palabra clave:
- Biorreceptor
Docking molecular
Depresión clínica
Serotonina
Afinidad química
610.28
Bioreceptor
Molecular docking
Clinical depression
Serotonin
Chemical affinity
- Rights
- closedAccess
- License
- Acceso cerrado
| id |
UNBOSQUE2_6ca49e401c6e30a641597a232f7bb5b3 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/7926 |
| network_acronym_str |
UNBOSQUE2 |
| network_name_str |
Repositorio U. El Bosque |
| repository_id_str |
|
| dc.title.spa.fl_str_mv |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación |
| dc.title.translated.spa.fl_str_mv |
In silico design of a peptide bioreceptor for serotonin recognition as a biomarker and determination of transduction conditions for its quantification |
| title |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación |
| spellingShingle |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación Biorreceptor Docking molecular Depresión clínica Serotonina Afinidad química 610.28 Bioreceptor Molecular docking Clinical depression Serotonin Chemical affinity |
| title_short |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación |
| title_full |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación |
| title_fullStr |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación |
| title_full_unstemmed |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación |
| title_sort |
Diseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación |
| dc.creator.fl_str_mv |
Holguín Hurtado, Karen Tatiana Méndez Bohórquez, Mayra Julieth |
| dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Guevara Pulido, James Oswaldo Rodriguez Salazar, Luna |
| dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Holguín Hurtado, Karen Tatiana Méndez Bohórquez, Mayra Julieth |
| dc.contributor.orcid.none.fl_str_mv |
Holguín Hurtado, Karen Tatiana [0000-0003-4121-9044] Méndez Bohórquez, Mayra Julieth [0000-0002-2394-7315] |
| dc.subject.spa.fl_str_mv |
Biorreceptor Docking molecular Depresión clínica Serotonina Afinidad química |
| topic |
Biorreceptor Docking molecular Depresión clínica Serotonina Afinidad química 610.28 Bioreceptor Molecular docking Clinical depression Serotonin Chemical affinity |
| dc.subject.ddc.none.fl_str_mv |
610.28 |
| dc.subject.keywords.spa.fl_str_mv |
Bioreceptor Molecular docking Clinical depression Serotonin Chemical affinity |
| description |
La serotonina (5-HT) es un neurotransmisor de monoamina conservado filogenéticamente que ocupa una gran relevancia en su papel en los tejidos periféricos, incluido el sistema inmunológico. Las principales patologías relacionadas con la variación de los niveles de serotonina son la depresión, los tumores carcinoides del intestino delgado y el trastorno del espectro autista, por ello es de gran importancia y un desafío realizar una cuantificación in situ de la 5-HT. No obstante, ya se han desarrollado biosensores para el reconocimiento y cuantificación de serotonina que hacen uso de biorreceptores enzimáticos, sin embargo, presentan limitantes como la inestabilidad de las enzimas cuando se someten a altas temperaturas y cambios de pH. Por esta razón, en este estudio, se diseñaron veintitres biorreceptores peptídicos in silico con el fin de lograr superar la afinidad por la serotonina de las proteínas involucradas en los procesos serotoninérgicos, este diseño se fundamentó en los sitios activos de las estructuras cristalizadas de las proteínas mencionadas. Las afinidades entre los biorreceptores y la serotonina fueron calculadas mediante AutoDock Vina y ayudaron a determinar tres posibles candidatos de los cuales uno de ellos obtuvo una energía de interacción por la serotonina de -6.5 kcal/mol, una alta selectividad por cada uno de los sustratos evaluados y distancias de interacción de los puentes de hidrógeno de 2.20 Å en promedio. |
| publishDate |
2022 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2022-06-15T17:21:15Z |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2022-06-15T17:21:15Z |
| dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2022 |
| dc.type.local.spa.fl_str_mv |
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado |
| dc.type.coar.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| dc.type.driver.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| dc.type.coarversion.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
| format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/20.500.12495/7926 |
| dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv |
instname:Universidad El Bosque |
| dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque |
| dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unbosque.edu.co |
| url |
http://hdl.handle.net/20.500.12495/7926 https://repositorio.unbosque.edu.co |
| identifier_str_mv |
instname:Universidad El Bosque reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque |
| dc.language.iso.none.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.rights.local.spa.fl_str_mv |
Acceso cerrado |
| dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/closedAccess http://purl.org/coar/access_right/c_14cb |
| rights_invalid_str_mv |
Acceso cerrado http://purl.org/coar/access_right/c_14cb |
| eu_rights_str_mv |
closedAccess |
| dc.format.mimetype.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.program.spa.fl_str_mv |
Bioingeniería |
| dc.publisher.grantor.spa.fl_str_mv |
Universidad El Bosque |
| dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv |
Facultad de Ingeniería Facultad de Ingeniería |
| institution |
Universidad El Bosque |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/16c31c5d-c5c9-4aa0-ba0e-25a4cc288c9e/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b45982f8-bc3b-407d-9a15-085f257190b6/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/1e90e4c3-95d6-49cb-b398-8a53a3bdd858/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/5ada24ef-8c14-446e-9c7e-60b0f198a994/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/1dbb6f1e-4ab5-4ddf-9278-73201191153c/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/15dcb85d-6f57-4529-822e-068e4dd69c3d/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/8d2cc967-bbb1-4b45-bcac-5befed6af373/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/652a3511-35b6-4761-9ed7-7866f6dbe5fa/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/af6ce1f9-fe78-440f-b467-e2cb370243a2/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b27eb8d1-2f46-4fd6-8262-746c3e75c19c/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/d67c720e-6059-4f55-a1a2-2220a31a8e0e/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/793de3ef-2f32-42d2-9b44-ad2dd9abfa58/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/883ea365-19d7-47d7-853b-75ba4e4487dc/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
f385fc8ed1a22b5a4485554f120b8ad6 c24613817511bcbcd65385d0dd0e4186 40aebfff7d18b984899979fe9f15d338 16a97d1cc45133e0aa04bc0b8e3d4e48 7210a811635d1799e7c05fee5d259be7 6c55f8e9624c5f71b6f64bd4d5b48b22 70d1be8bced56790838f6a281aaa5514 db09ef6480c56e48e630b382cd101e90 484071a872c52f44be2ad32a6b6e1bd4 e07172b53b25fef03b572bfbad5b9a35 52b03f9abf70ff3273a422557470f182 a8eca1b3b7ee2d28b8b22e2b236b8239 b9d7b5c04802e0fbd7390053b07947ca |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad El Bosque |
| repository.mail.fl_str_mv |
bibliotecas@biteca.com |
| _version_ |
1814100814591950848 |
| spelling |
Guevara Pulido, James OswaldoRodriguez Salazar, LunaHolguín Hurtado, Karen TatianaMéndez Bohórquez, Mayra JuliethHolguín Hurtado, Karen Tatiana [0000-0003-4121-9044]Méndez Bohórquez, Mayra Julieth [0000-0002-2394-7315]2022-06-15T17:21:15Z2022-06-15T17:21:15Z2022http://hdl.handle.net/20.500.12495/7926instname:Universidad El Bosquereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquehttps://repositorio.unbosque.edu.coLa serotonina (5-HT) es un neurotransmisor de monoamina conservado filogenéticamente que ocupa una gran relevancia en su papel en los tejidos periféricos, incluido el sistema inmunológico. Las principales patologías relacionadas con la variación de los niveles de serotonina son la depresión, los tumores carcinoides del intestino delgado y el trastorno del espectro autista, por ello es de gran importancia y un desafío realizar una cuantificación in situ de la 5-HT. No obstante, ya se han desarrollado biosensores para el reconocimiento y cuantificación de serotonina que hacen uso de biorreceptores enzimáticos, sin embargo, presentan limitantes como la inestabilidad de las enzimas cuando se someten a altas temperaturas y cambios de pH. Por esta razón, en este estudio, se diseñaron veintitres biorreceptores peptídicos in silico con el fin de lograr superar la afinidad por la serotonina de las proteínas involucradas en los procesos serotoninérgicos, este diseño se fundamentó en los sitios activos de las estructuras cristalizadas de las proteínas mencionadas. Las afinidades entre los biorreceptores y la serotonina fueron calculadas mediante AutoDock Vina y ayudaron a determinar tres posibles candidatos de los cuales uno de ellos obtuvo una energía de interacción por la serotonina de -6.5 kcal/mol, una alta selectividad por cada uno de los sustratos evaluados y distancias de interacción de los puentes de hidrógeno de 2.20 Å en promedio.BioingenieroPregradoSerotonin (5-HT) is a phylogenetically conserved monoamine neurotransmitter that is highly relevant to its role in peripheral tissues, including the immune system. The main pathologies related to the variation in serotonin levels are depression, carcinoid tumors of the small intestine and autism spectrum disorder, therefore it is of great importance and a challenge to perform an in situ quantification of 5-HT. However, biosensors have already been developed for the recognition and quantification of serotonin that make use of enzymatic bioreceptors, nevertheless, they have limitations such as the instability of the enzymes when subjected to high temperatures and changes in pH. For this reason, in this study, twenty-three peptide bioreceptors were designed in silico in order to overcome the affinity for serotonin of the proteins involved in serotonergic processes, this design was based on the active sites of the crystallized structures of the mentioned proteins. The affinities between the bioreceptors and serotonin were calculated using AutoDock Vina and helped to determine three possible candidates, one of which obtained an interaction energy for serotonin of -6.5 kcal/mol, a high selectivity for each of the substrates evaluated and interaction distances of hydrogen bridges of 2.20 Å on average.application/pdfspaBiorreceptorDocking molecularDepresión clínicaSerotoninaAfinidad química610.28BioreceptorMolecular dockingClinical depressionSerotoninChemical affinityDiseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificaciónIn silico design of a peptide bioreceptor for serotonin recognition as a biomarker and determination of transduction conditions for its quantificationBioingenieríaUniversidad El BosqueFacultad de IngenieríaFacultad de IngenieríaTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Acceso cerradoinfo:eu-repo/semantics/closedAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_14cbORIGINAL2021-1_I_Holguín-Méndez.pdf2021-1_I_Holguín-Méndez.pdfDiseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificaciónapplication/pdf3543110https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/16c31c5d-c5c9-4aa0-ba0e-25a4cc288c9e/downloadf385fc8ed1a22b5a4485554f120b8ad6MD51Anexo 2 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB.pdfAnexo 2 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB.pdfCarta de autorizaciónapplication/pdf1123829https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b45982f8-bc3b-407d-9a15-085f257190b6/downloadc24613817511bcbcd65385d0dd0e4186MD53Anexo 3. Justificación Publicación Cerrada.pdfAnexo 3. Justificación Publicación Cerrada.pdfCarta de restricciónapplication/pdf544963https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/1e90e4c3-95d6-49cb-b398-8a53a3bdd858/download40aebfff7d18b984899979fe9f15d338MD542021-1_I_Holguín-Méndez_Anexo1.pdf2021-1_I_Holguín-Méndez_Anexo1.pdfAnexosapplication/pdf130078https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/5ada24ef-8c14-446e-9c7e-60b0f198a994/download16a97d1cc45133e0aa04bc0b8e3d4e48MD52THUMBNAILDiseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación.jpgDiseño in silico de un biorreceptor péptido para el reconocimiento de serotonina como biomarcador y determinación de las condiciones de transducción para su cuantificación.jpgimage/jpeg5775https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/1dbb6f1e-4ab5-4ddf-9278-73201191153c/download7210a811635d1799e7c05fee5d259be7MD562021-1_I_Holguín-Méndez.pdf.jpg2021-1_I_Holguín-Méndez.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4224https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/15dcb85d-6f57-4529-822e-068e4dd69c3d/download6c55f8e9624c5f71b6f64bd4d5b48b22MD57Anexo 2 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB.pdf.jpgAnexo 2 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg8795https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/8d2cc967-bbb1-4b45-bcac-5befed6af373/download70d1be8bced56790838f6a281aaa5514MD58Anexo 3. Justificación Publicación Cerrada.pdf.jpgAnexo 3. Justificación Publicación Cerrada.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6220https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/652a3511-35b6-4761-9ed7-7866f6dbe5fa/downloaddb09ef6480c56e48e630b382cd101e90MD592021-1_I_Holguín-Méndez_Anexo1.pdf.jpg2021-1_I_Holguín-Méndez_Anexo1.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg6322https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/af6ce1f9-fe78-440f-b467-e2cb370243a2/download484071a872c52f44be2ad32a6b6e1bd4MD510TEXT2021-1_I_Holguín-Méndez.pdf.txt2021-1_I_Holguín-Méndez.pdf.txtExtracted texttext/plain101743https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b27eb8d1-2f46-4fd6-8262-746c3e75c19c/downloade07172b53b25fef03b572bfbad5b9a35MD511Anexo 2 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB.pdf.txtAnexo 2 - Carta de Autorizacion de uso de tesis y trabajos de grado a favor de la UEB.pdf.txtExtracted texttext/plain7679https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/d67c720e-6059-4f55-a1a2-2220a31a8e0e/download52b03f9abf70ff3273a422557470f182MD512Anexo 3. Justificación Publicación Cerrada.pdf.txtAnexo 3. Justificación Publicación Cerrada.pdf.txtExtracted texttext/plain1300https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/793de3ef-2f32-42d2-9b44-ad2dd9abfa58/downloada8eca1b3b7ee2d28b8b22e2b236b8239MD5132021-1_I_Holguín-Méndez_Anexo1.pdf.txt2021-1_I_Holguín-Méndez_Anexo1.pdf.txtExtracted texttext/plain1015https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/883ea365-19d7-47d7-853b-75ba4e4487dc/downloadb9d7b5c04802e0fbd7390053b07947caMD51420.500.12495/7926oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/79262024-02-07 08:49:52.18restrictedhttps://repositorio.unbosque.edu.coRepositorio Institucional Universidad El Bosquebibliotecas@biteca.com |