Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia
La filosfera es un ecosistema capaz de albergar un microbioma compuesto de comunidades microbianas grandes y diversas, que ha despertado un gran interés debido a que este puede tener efectos profundos en el estado fitosanitario y rendimiento de las plantas; gracias al potencial que presentan princip...
- Autores:
-
Díaz Beltrán, Hernán Camilo
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2021
- Institución:
- Universidad El Bosque
- Repositorio:
- Repositorio U. El Bosque
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/7528
- Acceso en línea:
- http://hdl.handle.net/20.500.12495/7528
- Palabra clave:
- Microbioma
Filosfera
B. gasipaes
Hongos endófitos
570
Microbiome
Phyllosphere
B. gasipaes
Fungal endophytes
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
| id |
UNBOSQUE2_20e5d1a65903cb3bea75834bda36172f |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/7528 |
| network_acronym_str |
UNBOSQUE2 |
| network_name_str |
Repositorio U. El Bosque |
| repository_id_str |
|
| dc.title.spa.fl_str_mv |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia |
| dc.title.translated.spa.fl_str_mv |
First approach to foliar microbiome structure of a comercial variety of Bactris gasipaes (peach palm) from Bahia Malaga, Valle del Cauca, Colombia |
| title |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia |
| spellingShingle |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia Microbioma Filosfera B. gasipaes Hongos endófitos 570 Microbiome Phyllosphere B. gasipaes Fungal endophytes |
| title_short |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia |
| title_full |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia |
| title_fullStr |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia |
| title_full_unstemmed |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia |
| title_sort |
Acercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombia |
| dc.creator.fl_str_mv |
Díaz Beltrán, Hernán Camilo |
| dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv |
Restrepo Restrepo, Silvia Cárdenas Toquica, Martha Emiliana |
| dc.contributor.author.none.fl_str_mv |
Díaz Beltrán, Hernán Camilo |
| dc.subject.spa.fl_str_mv |
Microbioma Filosfera B. gasipaes Hongos endófitos |
| topic |
Microbioma Filosfera B. gasipaes Hongos endófitos 570 Microbiome Phyllosphere B. gasipaes Fungal endophytes |
| dc.subject.ddc.none.fl_str_mv |
570 |
| dc.subject.keywords.spa.fl_str_mv |
Microbiome Phyllosphere B. gasipaes Fungal endophytes |
| description |
La filosfera es un ecosistema capaz de albergar un microbioma compuesto de comunidades microbianas grandes y diversas, que ha despertado un gran interés debido a que este puede tener efectos profundos en el estado fitosanitario y rendimiento de las plantas; gracias al potencial que presentan principalmente las bacterias y hongos que allí se encuentran. Sin embargo, producto de diversos factores, el conocimiento que se tiene a la fecha sobre el microbioma de la filosfera de palmas amazónicas es limitado. Este es el caso de Bactris gasipaes (la palma del chontaduro), una palma de suma relevancia cultural, social y económica en Colombia, que ha experimentado una caída en su productividad derivada de aspectos fitosanitarios. El presente estudio proporciona la primera caracterización de las comunidades bacterianas del microbioma foliar de Bactris gasipaes y el aislamiento de hongos endófitos provenientes de hojas asintomáticas y sintomáticas (presencia de manchas foliares cloróticas). Por medio de la secuenciación del ARNr 16S con Nanopore, empleando el flujo de trabajo sugerido por ONT que utiliza EPI2ME, se determinó una baja diversidad bacteriana representada en un total de 28 filos bacterianos. El filo más abundante fue Cyanobacteria seguido por los filos Firmicutes y Proteobacteria, independientemente del sitio de muestreo y de la posición en la hoja. Se aislaron 48 morfotipos de hongos endófitos cultivables, de los cuales 5 fueron determinados hasta el nivel de género. |
| publishDate |
2021 |
| dc.date.issued.none.fl_str_mv |
2021 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2022-04-25T21:43:05Z |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2022-04-25T21:43:05Z |
| dc.type.local.spa.fl_str_mv |
Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado |
| dc.type.hasversion.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion |
| dc.type.coar.none.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| dc.type.driver.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f |
| status_str |
acceptedVersion |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/20.500.12495/7528 |
| dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv |
instname:Universidad El Bosque |
| dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv |
reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque |
| dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv |
repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co |
| url |
http://hdl.handle.net/20.500.12495/7528 |
| identifier_str_mv |
instname:Universidad El Bosque reponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosque repourl:https://repositorio.unbosque.edu.co |
| dc.language.iso.none.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.rights.*.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
| dc.rights.uri.*.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
| dc.rights.local.spa.fl_str_mv |
Acceso abierto |
| dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ Acceso abierto http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.mimetype.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.coverage.spatial.spa.fl_str_mv |
Bahía Malaga, Valle del Cauca, Colombia |
| dc.coverage.temporal.spa.fl_str_mv |
2020-2021 |
| dc.publisher.program.spa.fl_str_mv |
Biología |
| dc.publisher.grantor.spa.fl_str_mv |
Universidad El Bosque |
| dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv |
Facultad de Ciencias |
| institution |
Universidad El Bosque |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/941c9d9b-99f1-47cf-a2e3-e08d1d0ae8c9/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b7167354-c186-487f-861e-03241ce1f332/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/d917e941-2e44-4022-890b-6a0c093fb798/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/fc5fd31b-da54-454c-b2a6-43b87cfa12f6/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/bc9a5e5a-43d8-4329-9b51-07ea203fa2f1/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/1360dbbc-71ea-42f3-8ff9-2ec4f03952bf/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/c98004f1-06ae-40cc-a8bf-c6beb23974af/download https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/3dd7750d-dbd0-4ce0-b4fd-9cefb00b3c27/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
7f10ab9e8363530291efd49f810a0556 2bd6f5931e386e47ff1347457dbee570 24013099e9e6abb1575dc6ce0855efd5 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 051cefa94d31418660dbdd1171aedb40 b5a9a8cb19f6f33db44c1e74cdc62181 96085c1e66726f0008a3c715c890af6d b532aad8099d8eca73e86ec5fc115377 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad El Bosque |
| repository.mail.fl_str_mv |
bibliotecas@biteca.com |
| _version_ |
1808397423577399296 |
| spelling |
Restrepo Restrepo, SilviaCárdenas Toquica, Martha EmilianaDíaz Beltrán, Hernán CamiloBahía Malaga, Valle del Cauca, Colombia2020-20212022-04-25T21:43:05Z2022-04-25T21:43:05Z2021http://hdl.handle.net/20.500.12495/7528instname:Universidad El Bosquereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquerepourl:https://repositorio.unbosque.edu.coLa filosfera es un ecosistema capaz de albergar un microbioma compuesto de comunidades microbianas grandes y diversas, que ha despertado un gran interés debido a que este puede tener efectos profundos en el estado fitosanitario y rendimiento de las plantas; gracias al potencial que presentan principalmente las bacterias y hongos que allí se encuentran. Sin embargo, producto de diversos factores, el conocimiento que se tiene a la fecha sobre el microbioma de la filosfera de palmas amazónicas es limitado. Este es el caso de Bactris gasipaes (la palma del chontaduro), una palma de suma relevancia cultural, social y económica en Colombia, que ha experimentado una caída en su productividad derivada de aspectos fitosanitarios. El presente estudio proporciona la primera caracterización de las comunidades bacterianas del microbioma foliar de Bactris gasipaes y el aislamiento de hongos endófitos provenientes de hojas asintomáticas y sintomáticas (presencia de manchas foliares cloróticas). Por medio de la secuenciación del ARNr 16S con Nanopore, empleando el flujo de trabajo sugerido por ONT que utiliza EPI2ME, se determinó una baja diversidad bacteriana representada en un total de 28 filos bacterianos. El filo más abundante fue Cyanobacteria seguido por los filos Firmicutes y Proteobacteria, independientemente del sitio de muestreo y de la posición en la hoja. Se aislaron 48 morfotipos de hongos endófitos cultivables, de los cuales 5 fueron determinados hasta el nivel de género.Laboratorio de Micología y Fitopatología de la Universidad de los AndesBiólogoPregradoThe phyllosphere is an ecosystem capable of harboring a microbiome made up of large and diverse microbial communities. The phyllosphere has recently been of great interest because it can have a profound effect on the phytosanitary status and performance of plants because of the potential presented mainly by the bacteria and fungi that can be found there. However, the present knowledge of the microbiome of the phyllosphere of Amazonian palms is limited. This is the case for Bactris gasipaes (peach palm), a palm of great cultural, social and economic relevance in Colombia, which has experienced a drop in its productivity due to phytosanitary reasons. The present study provides the first characterization of the bacterial communities of the Bactris gasipaes leaf microbiome and the isolation of endophytic fungi from asymptomatic and symptomatic leaves (presence of chlorotic leaf spots). By sequencing the 16S rRNA with Nanopore and using the workflow suggested by ONT using EPI2ME, a low bacterial diversity represented in a total of 28 bacterial phyla was determined. The most abundant phylum was Cyanobacteria followed by the phyla Firmicutes and Proteobacteria, regardless of the sampling site and the position on the leaf. 48 morphotypes of cultivable endophytic fungi were obtained, of which five were identified to the genus level.application/pdfspaAtribución-NoComercial 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Acceso abiertoinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2MicrobiomaFilosferaB. gasipaesHongos endófitos570MicrobiomePhyllosphereB. gasipaesFungal endophytesAcercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, ColombiaFirst approach to foliar microbiome structure of a comercial variety of Bactris gasipaes (peach palm) from Bahia Malaga, Valle del Cauca, ColombiaBiologíaUniversidad El BosqueFacultad de CienciasTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1finfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisORIGINALACERCAMIENTO A LA ESTRUCTURA DEL MICROBIOMA FOLIAR DE.pdfACERCAMIENTO A LA ESTRUCTURA DEL MICROBIOMA FOLIAR DE.pdfAcercamiento a la estructura del microbioma foliar de una variedad comercial de Bactris gasipaes (chontaduro) de Bahía Málaga, Valle del Cauca, Colombiaapplication/pdf954295https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/941c9d9b-99f1-47cf-a2e3-e08d1d0ae8c9/download7f10ab9e8363530291efd49f810a0556MD56Anexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de contenidos a favor de la UEB (1).pdfAnexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de contenidos a favor de la UEB (1).pdfCarta de autorizaciónapplication/pdf362809https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/b7167354-c186-487f-861e-03241ce1f332/download2bd6f5931e386e47ff1347457dbee570MD55CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8914https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/d917e941-2e44-4022-890b-6a0c093fb798/download24013099e9e6abb1575dc6ce0855efd5MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/fc5fd31b-da54-454c-b2a6-43b87cfa12f6/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD54THUMBNAILACERCAMIENTO A LA ESTRUCTURA DEL MICROBIOMA FOLIAR DE.pdf.jpgACERCAMIENTO A LA ESTRUCTURA DEL MICROBIOMA FOLIAR DE.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4942https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/bc9a5e5a-43d8-4329-9b51-07ea203fa2f1/download051cefa94d31418660dbdd1171aedb40MD57Anexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de contenidos a favor de la UEB (1).pdf.jpgAnexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de contenidos a favor de la UEB (1).pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7777https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/1360dbbc-71ea-42f3-8ff9-2ec4f03952bf/downloadb5a9a8cb19f6f33db44c1e74cdc62181MD58TEXTACERCAMIENTO A LA ESTRUCTURA DEL MICROBIOMA FOLIAR DE.pdf.txtACERCAMIENTO A LA ESTRUCTURA DEL MICROBIOMA FOLIAR DE.pdf.txtExtracted texttext/plain101444https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/c98004f1-06ae-40cc-a8bf-c6beb23974af/download96085c1e66726f0008a3c715c890af6dMD59Anexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de contenidos a favor de la UEB (1).pdf.txtAnexo No_3 - Carta de Autorizacion de uso de contenidos a favor de la UEB (1).pdf.txtExtracted texttext/plain7699https://repositorio.unbosque.edu.co/bitstreams/3dd7750d-dbd0-4ce0-b4fd-9cefb00b3c27/downloadb532aad8099d8eca73e86ec5fc115377MD51020.500.12495/7528oai:repositorio.unbosque.edu.co:20.500.12495/75282024-02-07 01:35:44.217http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/Atribución-NoComercial 4.0 Internacionalopen.accesshttps://repositorio.unbosque.edu.coRepositorio Institucional Universidad El Bosquebibliotecas@biteca.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 |