Estudio molecular preliminar de accesiones de maíz (Zea mays L.) criollo e indígena colombiano utilizando una región de ADN cloroplástico
Se exploró se forma preliminar la diversidad genética existente en las 23 razas de maíz criollo e indígena descritas para Colombia por Roberts y colaboradores (1957), para el efecto se evaluaron 28 cebadores nucleares y cloroplásticos. Catorce de ellos amplificaron en la reacción en cadena de la pol...
- Autores:
-
Revelo Portilla, Ediel Armando
Cardozo Conde, Carlos Iván
Caetano, Creucí María
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2015
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/58389
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/58389
http://bdigital.unal.edu.co/55171/
- Palabra clave:
- 6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
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Se exploró se forma preliminar la diversidad genética existente en las 23 razas de maíz criollo e indígena descritas para Colombia por Roberts y colaboradores (1957), para el efecto se evaluaron 28 cebadores nucleares y cloroplásticos. Catorce de ellos amplificaron en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y fueron enviados para secuenciar a Macrogen Inc. (Corea). Mediante programas bioinformáticos (BioEdit 7.1.0, ClustalW versión 1.81, EditPlus Text Editor versión 3.20 y Gblock 0.91b 8) se encontró que ocho de estos cebadores presentaron un nivel alto de polimorfismo. La región genómica cloroplástica AtpB-1–RbcL-1 mostró el mayor polimorfismo y por tanto se utilizó para evaluar 23 materiales representativos de las 23 razas conservadas en el Banco de Germoplasma del CIMMYT (Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo) en México. Con el análisis de secuencias se revalidaron y confrontaron los grupos raciales obtenidos en el presente estudio ─tres razas primitivas, siete razas probablemente introducidas, y 13 razas híbridas colombianas─ con aquellos establecidos por Roberts y colaboradores, en los cuales se encontraron dos razas primitivas, nueve probablemente introducidas y 12 híbridas colombianas y con los grupos establecidos por Cardona (2010) utilizando la metodología Ward-MLM para los mismos caracteres descritos por Roberts et al. (1957), donde se encontraron cinco razas primitivas, siete probablemente introducidas y nueve híbridas colombianas. Con base en lo anterior, en el presente se hizo un aporte metodológico para revalidar datos históricos y redefinir grupos raciales. |
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Mediante programas bioinformáticos (BioEdit 7.1.0, ClustalW versión 1.81, EditPlus Text Editor versión 3.20 y Gblock 0.91b 8) se encontró que ocho de estos cebadores presentaron un nivel alto de polimorfismo. La región genómica cloroplástica AtpB-1–RbcL-1 mostró el mayor polimorfismo y por tanto se utilizó para evaluar 23 materiales representativos de las 23 razas conservadas en el Banco de Germoplasma del CIMMYT (Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo) en México. Con el análisis de secuencias se revalidaron y confrontaron los grupos raciales obtenidos en el presente estudio ─tres razas primitivas, siete razas probablemente introducidas, y 13 razas híbridas colombianas─ con aquellos establecidos por Roberts y colaboradores, en los cuales se encontraron dos razas primitivas, nueve probablemente introducidas y 12 híbridas colombianas y con los grupos establecidos por Cardona (2010) utilizando la metodología Ward-MLM para los mismos caracteres descritos por Roberts et al. (1957), donde se encontraron cinco razas primitivas, siete probablemente introducidas y nueve híbridas colombianas. Con base en lo anterior, en el presente se hizo un aporte metodológico para revalidar datos históricos y redefinir grupos raciales.In order to preliminarily explore the genetic diversity in the 23 Colombian races of maize described by Roberts and co-workers (1957), this study evaluate 28 nuclear and chloroplast primers. Of these, 14 amplified in the PCR, which were sent to sequencing to Macrogen Inc. (Korea). Bioinformatics programs revealed that six of these primers had a high level of polymorphism. It was considered that the genomic chloroplast region atpB-rbcL-1-1 showed the highest polymorphism, therefore was used to evaluate 23 materials, representative of the 23 races, stored in the CIMMYT germplasm bank, Mexico. By analyzing sequences we could defend and confront racial groups obtained in the present study (‘primitive races’ three, ‘probably introduced’ seven, ‘Colombian hybrid’, 13) with those established by Roberts and co-workers at 50, shown two ‘primitive’, nine ‘probably introduced’ and twelve ‘Colombian hybrid’ and the groups set by Cardona (2010), applying the strategy Ward-MLM for the same characters described by Roberts et al. (1957), which shows five ‘primitive’, seven ‘probably introduced’ and nine ‘Colombian hybrid’ races. Thus, it makes a methodological contribution to validate historical data and redefine racial groups.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Palmirahttp://www.revistas.unal.edu.co/index.php/acta_agronomica/article/view/40724Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta AgronómicaActa AgronómicaRevelo Portilla, Ediel Armando and Cardozo Conde, Carlos Iván and Caetano, Creucí María (2015) Estudio molecular preliminar de accesiones de maíz (Zea mays L.) criollo e indígena colombiano utilizando una región de ADN cloroplástico. Acta Agronómica, 64 (1). pp. 72-82. ISSN 2323-01186 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology63 Agricultura y tecnologías relacionadas / AgricultureADNcpdiversidad genéticaZea mayscpDNAgenetic diversityZea mays L maíz criollorazas criollasColombiaEstudio molecular preliminar de accesiones de maíz (Zea mays L.) criollo e indígena colombiano utilizando una región de ADN cloroplásticoArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTORIGINALacag.v64n1.40724_2.pdfapplication/pdf703913https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/58389/1/acag.v64n1.40724_2.pdf84ae420d756d21d77c748de3fd75cd27MD51acag.v64n1.40724.pdfapplication/pdf690601https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/58389/2/acag.v64n1.40724.pdfa49bb8fea80b7ca3c511e9cf61d1bb1fMD52THUMBNAILacag.v64n1.40724_2.pdf.jpgacag.v64n1.40724_2.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg8422https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/58389/3/acag.v64n1.40724_2.pdf.jpgbccb4407bbeaf8f179f5fb9ea552731cMD53acag.v64n1.40724.pdf.jpgacag.v64n1.40724.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9298https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/58389/4/acag.v64n1.40724.pdf.jpg970d1ca8d8dde9aa781d37101dc09a94MD54unal/58389oai:repositorio.unal.edu.co:unal/583892023-03-27 23:07:33.389Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |