Modelo de evaluación para resolver problemas de filogenia molecular en el género Fusarium, basado en los análisis de microsecuencias de ADN de multilocus conservados
La filogenia que se hace utilizando métodos moleculares dentro del género Fusarium es controversial, por las diferencias presentadas entre los resultados obtenidos al analizar diferentes genes útiles para hacer filogenia. Al analizar las secuencias de ADN obtenemos arboles con clados que muestran di...
- Autores:
-
Rincón Sandoval, Cindy Melissa
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/75190
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/75190
http://bdigital.unal.edu.co/39703/
- Palabra clave:
- 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Fusarium
Filogenómica
Microsecuencias de ADN
Concatenación
DNA micro-sequences
Phylogenomics
Concatenation
- Rights
- openAccess
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- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
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La filogenia que se hace utilizando métodos moleculares dentro del género Fusarium es controversial, por las diferencias presentadas entre los resultados obtenidos al analizar diferentes genes útiles para hacer filogenia. Al analizar las secuencias de ADN obtenemos arboles con clados que muestran diferentes distribuciones de las especies estudiadas. El presente trabajo explora la posibilidad de utilizar microsecuencias de genes conservados para resolver problemas de clasificación taxonómica y de filogenia de las especies pertenecientes al género Fusarium. Para esto, se evaluaron trece especies del géneroFusarium (F. anthophilum, F. avenaceum, F. culmorum F. equiseti, F. foetens, F. graminearum, F. oxysporum F. proliferatum, F. solani, F. sp., F. sporotrichioides,F. subglutinans, F. verticillioides), utilizando 15 parejas de iniciadores que codifican para las regionesgénicas de: cluster de rDNA, β-tubulina, calmodulina, citocromo oxidasa I, factor de elongación 1-α, histonas 3 y 4 y subunidad pequeña ribosomal de RNA. A partir de los resultados obtenidos podemos concluir que el uso de las microsecuencias altamente variables son la mejor opción para resolver los problemas de un gen una historia evolutiva, debido a que los arboles obtenidos mostraron un alto porcentaje de similaridad entre aquellos arboles producto de diferentes regiones génicas y el árbol de caracteres morfológicos. Además el uso de estas microsecuencias elimina homoplasias y reduce artefactos como saturación y atracción de ramas largas lo cual genera inferenciasfilogenéticas erróneas. |
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