Rice displays large scale transcriptional variation when inoculated with genetically different isolates of Glomus intraradices

ilustraciones, gráficas, tablas

Autores:: Marulanda Martínez, José Joaquín

Tipo de recurso:

Fecha de publicación:: 2010

Institución:: Universidad Nacional de Colombia

Repositorio:: Universidad Nacional de Colombia

Idioma:: eng

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In return, plants supply them with carbohydrates. The intimate relationship between both partners in the symbiosis process requires fine tuned molecular machinery. Such machinery is coded by plant and fungal genes transcribed at specific stages in the interaction. Pioneering studies have described plant gene transcription when rice roots were colonized by one specific isolate Glomus intraradices. However, this approach has overlooked the importance of fungal genetic diversity in the symbiosis. Using affymetrix microarray technology, we explored gene transcription differences in twelve weeks old rice plants inoculated with two genetically different G. intraradices isolates. Whereas defense response genes as peroxidases and chitinases were commonly downregulated by both isolates, starch biosynthesis genes were commonly induced by both isolates. Jasmonic acid and citokinines biosynthesis where differentially regulated between isolates. Here we report not only transcriptional variation in these categories, but also variation in gene transcription for sets of plant genes previously reported as mycorrhiza specific. Even if the most important pathways to maintain the symbiosis are strongly conserved, quantitative variation appears to be the rule more than the exception.Los hongos formadores de micorrizas arbusculares son organismos del suelo que proveen las raíces de las plantas con fosforo y a cambio, las plantas les brindan carbohidratos. Este fenómeno es actualmente reconocido como la simbiosis más antigua en la tierra. Una maquinaria molecular de alta precisión es requerida para garantizar la intima relación que se da entre las partes durante la simbiosis. Esta maquinaria, codificada en genes de la planta y del hongo, presenta diferentes patrones de transcripción a lo largo de la interacción. Varios estudios han mostrado variaciones en la transcripción génica de la planta durante la simbiosis. Sin embargo, esas aproximaciones no han tenido en cuenta la importancia de la variabilidad genética presente entre diferentes aislamientos del hongo. En este estudio se usaron microarreglos (affymetrix) para investigar las diferencias en transcripción génica de plantas de arroz al ser inoculadas con aislamientos genéticamente distintos de Glomus intraradices. Genes de resistencia, peroxidasas y quitinasas, hacen parte del grupo de genes con transcripción reprimida en plantas colonizadas por los dos aislamientos. Varios genes involucrados en la vía de síntesis de almidón fueron mayomente transcritos por los dos aislamientos. Sin embargo, categorías importantes como síntesis de acido jasmónico y producción de citoquininas fueron reguladas diferencialmente en las plantas colonizadas por cada uno de los aislamientos. En interacciones planta patógeno, la variación en la transcripción de tipo cuantitativa, más que cualitativa, es un patrón común cuando se comparan reacciones compatibles e incompatibles, este mismo comportamiento fue evidenciado en nuestros resultados. El arroz es parte de la dieta básica para más de la mitad de la población mundial, por lo tanto la variación cuantitativa en la transcripción y la sobreregulacion de genes relacionados con QTL de rendimiento tienen un gran impacto en ciencias biológicas y agronómicas. (Texto tomado de la fuente).MaestríaMagíster en Ciencias AgrariasGenética y fitomejoramientoCiencias Agronómicas82 páginasapplication/pdfengUniversidad Nacional de ColombiaBogotá - Ciencias Agrarias - Maestría en Ciencias AgrariasDepartamento de AgronomíaFacultad de Ciencias AgrariasBogotá, ColombiaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::631 - Técnicas específicas, aparatos, equipos, materialesSymbiosisRice - geneticsPlant-Fungus relationshipsSimbiosisArroz - GenéticaRelación planta-hongoMicorrizaArrozMicroarregloSimbiosisFósforoMycorrhizaRiceMicroarraySymbiosisPhosphorousRice displays large scale transcriptional variation when inoculated with genetically different isolates of Glomus intraradicesEl arroz muestra variación transcripcional en gran escala al ser inoculado con aislamientos genéticamente diferentes de Glomus intraradicesTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMEstudiantesInvestigadoresPúblico generalORIGINAL790692.2010.pdfTesis de Maestría en Ciencias Agrariasapplication/pdf2550737https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/6809/1/790692.2010.pdfc164889a5a9958ff1703f483aa6902ddMD51THUMBNAIL790692.2010.pdf.jpg790692.2010.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3645https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/6809/2/790692.2010.pdf.jpg56a65a9f1bad2952aed33bc63cf94340MD52unal/6809oai:repositorio.unal.edu.co:unal/68092022-09-08 15:33:38.426Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co

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