Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis

ilustraciones, gráficas, tablas

Autores:
Castiblanco Vargas, Eveline Valheria
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2011
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/9581
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/9581
http://bdigital.unal.edu.co/6489/
https://repositorio.unal.edu.co/
Palabra clave:
630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales
Rhynchosporium secalis
Evolución
Hongos patógenos
Rhynchosporium secalis
evolution
pathogenic fungi
Materials and methods
Microsatellite genotyping
Haplotypic diversity
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_e4c0a88d3cccda6f793a429d379e3312
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/9581
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
dc.title.eng.fl_str_mv Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
title Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
spellingShingle Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales
Rhynchosporium secalis
Evolución
Hongos patógenos
Rhynchosporium secalis
evolution
pathogenic fungi
Materials and methods
Microsatellite genotyping
Haplotypic diversity
title_short Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
title_full Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
title_fullStr Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
title_full_unstemmed Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
title_sort Digging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalis
dc.creator.fl_str_mv Castiblanco Vargas, Eveline Valheria
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv McDonald, Bruce
García Domínguez, Celsa
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Castiblanco Vargas, Eveline Valheria
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv 630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales
topic 630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetales
Rhynchosporium secalis
Evolución
Hongos patógenos
Rhynchosporium secalis
evolution
pathogenic fungi
Materials and methods
Microsatellite genotyping
Haplotypic diversity
dc.subject.agrovoc.spa.fl_str_mv Rhynchosporium secalis
Evolución
Hongos patógenos
dc.subject.agrovoc.eng.fl_str_mv Rhynchosporium secalis
evolution
pathogenic fungi
dc.subject.proposal.eng.fl_str_mv Materials and methods
Microsatellite genotyping
Haplotypic diversity
description ilustraciones, gráficas, tablas
publishDate 2011
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2011
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-06-24T21:01:46Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-06-24T21:01:46Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/9581
dc.identifier.eprints.none.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/6489/
dc.identifier.instname.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia
dc.identifier.reponame.spa.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/9581
http://bdigital.unal.edu.co/6489/
https://repositorio.unal.edu.co/
identifier_str_mv Universidad Nacional de Colombia
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
dc.language.iso.spa.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.spa.fl_str_mv xiii, 32 páginas
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia
dc.publisher.program.spa.fl_str_mv Bogotá - Ciencias Agrarias - Maestría en Ciencias Agrarias
dc.publisher.department.spa.fl_str_mv Departamento de Agronomía
dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv Facultad de Ciencias Agrarias
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Bogotá, Colombia
dc.publisher.branch.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/9581/1/790685.2011.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/9581/2/790685.2011.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 965438aba9f7a5f294648379a80e9064
e32539b62444b79adb4051c7c08e3929
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1806885934829928448
spelling Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2McDonald, Bruce4bc924ff8b9b53b0555e62fbbe93b188300García Domínguez, Celsaabd119d2c7c0a24d420c9ad4f063d222300Castiblanco Vargas, Eveline Valheria809c9afd-90da-4ad3-91d9-0c52b930b4ef3002019-06-24T21:01:46Z2019-06-24T21:01:46Z2011https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/9581http://bdigital.unal.edu.co/6489/Universidad Nacional de ColombiaRepositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiahttps://repositorio.unal.edu.co/ilustraciones, gráficas, tablas24 field populations sampled in Europe and Ethiopia were assayed with eight microsatellite loci. Model based methods were used to infer the population structure and recent migration patterns. Allelic richness obtained in our study is consistent with the hypothesis of Scandinavia as center of origin. A population structure consisting in two different levels, namely population and region, was proposed. The AMOVA analysis showed that 80% of the variation was explained by the population level and 6% by the regional level. Isolation by distance was confirmed by Mantel test analysis. However, Icelandic, Ethiopian and Swiss populations did not fit such a model. The dynamic of migration of the Icelandic populations was consistent with a continent island model closer to the coalescence point. According with the geographic characteristics of Iceland in relation with the proposed center of origin, an active movement of infected seed mediated by humans is proposed to explain our results. In contrast, Swiss populations located in the same continent with the proposed center of origin, showed the highest differentiation values. Based on a recent migration analysis, we proposed that R. secalis populations are being modeled by human mediated migration.24 poblaciones de R. secalis muestreadas en Europa y África fueron evaluadas para ocho loci microsatellites. Métodos basados en modelación fueron usados para inferir la estructura de la población y los patrones recientes de migración. Los índices de riqueza alélica obtenidos en nuestro estudio son consistentes con la hipótesis de Escandinavia como centro de origen. Una estructura poblacional de dos niveles, población y región, fue usada en nuestro estudio. El análisis de AMOVA mostro que el 80% de la varianza puede ser explicada por el nivel población y que un 6 % es explicado por el nivel región. El patrón de aislamiento por distancia fue confirmado mediante el test de mantel, a pesar de que las poblaciones de Etiopía, Islandia y Suiza no se ajustaron a dicho modelo. La dinámica de migración de las poblaciones de Islandia correspondió con un modelo isla continente cercano al punto de coalescencia. De acuerdo con la localización geográfica de Etiopía, en relación al centro de origen propuesto, un movimiento activo de semilla contaminada mediado por humanos es propuesto para explicar nuestros resultados. En contraste, los poblaciones Suizas, que se localizaron en la misma área continental que el propuesto centro de origen mostraron los valores más altos de diferenciación, De ésta forma se propone que las poblaciones de R. secalis están siendo modeladas por la migración mediada por humanos. (Texto tomado de la fuente).MaestríaMagíster en Ciencias AgrariasFitopatologíaCiencias Agronómicasxiii, 32 páginasapplication/pdfengUniversidad Nacional de ColombiaBogotá - Ciencias Agrarias - Maestría en Ciencias AgrariasDepartamento de AgronomíaFacultad de Ciencias AgrariasBogotá, ColombiaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::632 - Lesiones, enfermedades, plagas vegetalesRhynchosporium secalisEvoluciónHongos patógenosRhynchosporium secalisevolutionpathogenic fungiMaterials and methodsMicrosatellite genotypingHaplotypic diversityDigging deeper into the evolutionary history of Rhynchosporium secalisTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMEstudiantesInvestigadoresPúblico generalORIGINAL790685.2011.pdfTesis de Maestría en Ciencias Agrariasapplication/pdf328782https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/9581/1/790685.2011.pdf965438aba9f7a5f294648379a80e9064MD51THUMBNAIL790685.2011.pdf.jpg790685.2011.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4684https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/9581/2/790685.2011.pdf.jpge32539b62444b79adb4051c7c08e3929MD52unal/9581oai:repositorio.unal.edu.co:unal/95812022-09-17 23:01:46.261Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co