Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides

Título en ingles: Evaluation of molecular markers associated with resistance to late blight (Phytophthora infestans L.)  in diploid and tetraploid potatoes Resumen La papa, cultivo de importancia a nivel mundial es gravemente afectado por gota, enfermedad ocasionada por el oomycete Phytophthora infe...

Full description

Autores:
Juyó, D. K.
Gerena, H. N
Mosquera, Teresa
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2011
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/39371
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/39371
http://bdigital.unal.edu.co/29468/
http://bdigital.unal.edu.co/29468/3/38319
http://bdigital.unal.edu.co/29468/6/
Palabra clave:
Phytophthora infestans
resistencia a gota
marcadores diagnóstico
Solanum tuberosum subsp. Andigena
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_e4aad921982a02c963752d24a7b3ceef
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/39371
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
title Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
spellingShingle Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
Phytophthora infestans
resistencia a gota
marcadores diagnóstico
Solanum tuberosum subsp. Andigena
title_short Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
title_full Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
title_fullStr Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
title_full_unstemmed Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
title_sort Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides
dc.creator.fl_str_mv Juyó, D. K.
Gerena, H. N
Mosquera, Teresa
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Juyó, D. K.
Gerena, H. N
Mosquera, Teresa
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Phytophthora infestans
resistencia a gota
marcadores diagnóstico
Solanum tuberosum subsp. Andigena
topic Phytophthora infestans
resistencia a gota
marcadores diagnóstico
Solanum tuberosum subsp. Andigena
description Título en ingles: Evaluation of molecular markers associated with resistance to late blight (Phytophthora infestans L.)  in diploid and tetraploid potatoes Resumen La papa, cultivo de importancia a nivel mundial es gravemente afectado por gota, enfermedad ocasionada por el oomycete Phytophthora infestans. Actualmente la forma más efectiva para combatir la enfermedad es mediante el desarrollo de cultivares resistentes al patógeno. Para esto, una estrategia es identificar genes que confieran resistencia al patógeno, para lo cual se buscan marcadores asociados con el carácter de resistencia. En este estudio se evaluaron marcadores moleculares tipo SCAR (Sequence Characterized Amplified Region): CosA, GP179, BA47f2 y Prp1 asociados con resistencia a P. infestans y el gen de resistencia R1, en 22 cultivares tetraploides pertenecientes a la subespecie andigena y cinco especies silvestres. Se evaluó el polimorfismo y se determinó si los alelos polimórficos permitían diferenciar genotipos resistentes de susceptibles. Se comparó el  tamaño de los fragmentos obtenidos con los fragmentos esperados asociados con resistencia de acuerdo a reportes. El análisis se realizó considerando presencia/ausencia de los fragmentos: CosA210, CosA250, R11400, R11800, BA47f2500, GP179570, Prp1300, Prp1600, y Prp1900. Los resultados indicaron que en los cultivares tetraploides y silvestres, se presentaron polimorfismos en todos los marcadores evaluados, con excepción del marcador GP179. No se encontró correlación entre el rasgo de resistencia y los alelos. Los resultados de este estudio muestran que hay repuesta diferencial a los marcadores entre las subsp. tuberosum y subsp. Andigena.   Palabras clave: Phytophthora infestans, resistencia a gota, marcadores diagnóstico, Solanum tuberosum subsp. Andigena. Abstract Potato is an important worldwide crop seriously affected by late blight disease caused by the oomycete Phytophthora infestans. Currently, the most effective way to control the disease is developing resistant cultivars to the pathogen by identifying genes that confer resistance to the pathogen. For this purpose it is important to find molecular markers associated with the trait. In this study, the SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) markers: CosA, GP179, BA47f2 y Prp1, associated with late blight and the resistant gen R1 were evaluated in 22 tetraploid cultivars from subspecie andigena and five wild potato species. Polymorphism was evaluated and it was evaluated if polymorphic alleles allow differentiating resistant from susceptible genotypes. The fragment length for each marker was compared to the allele size reported associated to resistance. The analysis considered the presence/absence of the fragments: CosA210, CosA250, R11400, R11800, BA47f2500, GP179570, Prp1300, Prp1600 and Prp1900. The results indicated that both, tetraploid cultivars and wild potatoes, showed polymorphisms with all these markers, except with the GP179 marker. It was not found correlation between resistance and the presence of specific alleles. Evidence found in this study indicates that results obtained with molecular markers differed between subsp. tuberosum and subsp. andigena. Key words: Phytophthora infestans, late blight resistance, diagnostic markers, Solanum tuberosum subsp. andigena.
publishDate 2011
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2011
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-06-28T03:46:43Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-06-28T03:46:43Z
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de revista
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/ART
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/39371
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/29468/
http://bdigital.unal.edu.co/29468/3/38319
http://bdigital.unal.edu.co/29468/6/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/39371
http://bdigital.unal.edu.co/29468/
http://bdigital.unal.edu.co/29468/3/38319
http://bdigital.unal.edu.co/29468/6/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.spa.fl_str_mv http://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/27917
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de Biotecnología
Revista Colombiana de Biotecnología
dc.relation.ispartofseries.none.fl_str_mv Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 13, núm. 2 (2011); 51-62 1909-8758 0123-3475
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Juyó, D. K. and Gerena, H. N and Mosquera, Teresa (2011) Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 13, núm. 2 (2011); 51-62 1909-8758 0123-3475 .
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/msword
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/39371/1/27917-100980-1-PB.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/39371/2/27917-98900-1-PB.docx
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/39371/3/27917-100980-1-PB.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 51f3806a6b04e345b42f945e03c83f3c
ec261bbcb8f869b0969007c9b347c7a4
a7264ce9573cfd0df118630256276f0c
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1814089419378917376
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Juyó, D. K.2e96216c-80d1-4749-9be3-ec76e87a8ea8300Gerena, H. Ne8cc33b9-b38d-4205-b398-c43ef8b4491a300Mosquera, Teresa2656d1b0-0e22-48d7-b5b4-74185c2d2fa83002019-06-28T03:46:43Z2019-06-28T03:46:43Z2011https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/39371http://bdigital.unal.edu.co/29468/http://bdigital.unal.edu.co/29468/3/38319http://bdigital.unal.edu.co/29468/6/Título en ingles: Evaluation of molecular markers associated with resistance to late blight (Phytophthora infestans L.)  in diploid and tetraploid potatoes Resumen La papa, cultivo de importancia a nivel mundial es gravemente afectado por gota, enfermedad ocasionada por el oomycete Phytophthora infestans. Actualmente la forma más efectiva para combatir la enfermedad es mediante el desarrollo de cultivares resistentes al patógeno. Para esto, una estrategia es identificar genes que confieran resistencia al patógeno, para lo cual se buscan marcadores asociados con el carácter de resistencia. En este estudio se evaluaron marcadores moleculares tipo SCAR (Sequence Characterized Amplified Region): CosA, GP179, BA47f2 y Prp1 asociados con resistencia a P. infestans y el gen de resistencia R1, en 22 cultivares tetraploides pertenecientes a la subespecie andigena y cinco especies silvestres. Se evaluó el polimorfismo y se determinó si los alelos polimórficos permitían diferenciar genotipos resistentes de susceptibles. Se comparó el  tamaño de los fragmentos obtenidos con los fragmentos esperados asociados con resistencia de acuerdo a reportes. El análisis se realizó considerando presencia/ausencia de los fragmentos: CosA210, CosA250, R11400, R11800, BA47f2500, GP179570, Prp1300, Prp1600, y Prp1900. Los resultados indicaron que en los cultivares tetraploides y silvestres, se presentaron polimorfismos en todos los marcadores evaluados, con excepción del marcador GP179. No se encontró correlación entre el rasgo de resistencia y los alelos. Los resultados de este estudio muestran que hay repuesta diferencial a los marcadores entre las subsp. tuberosum y subsp. Andigena.   Palabras clave: Phytophthora infestans, resistencia a gota, marcadores diagnóstico, Solanum tuberosum subsp. Andigena. Abstract Potato is an important worldwide crop seriously affected by late blight disease caused by the oomycete Phytophthora infestans. Currently, the most effective way to control the disease is developing resistant cultivars to the pathogen by identifying genes that confer resistance to the pathogen. For this purpose it is important to find molecular markers associated with the trait. In this study, the SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) markers: CosA, GP179, BA47f2 y Prp1, associated with late blight and the resistant gen R1 were evaluated in 22 tetraploid cultivars from subspecie andigena and five wild potato species. Polymorphism was evaluated and it was evaluated if polymorphic alleles allow differentiating resistant from susceptible genotypes. The fragment length for each marker was compared to the allele size reported associated to resistance. The analysis considered the presence/absence of the fragments: CosA210, CosA250, R11400, R11800, BA47f2500, GP179570, Prp1300, Prp1600 and Prp1900. The results indicated that both, tetraploid cultivars and wild potatoes, showed polymorphisms with all these markers, except with the GP179 marker. It was not found correlation between resistance and the presence of specific alleles. Evidence found in this study indicates that results obtained with molecular markers differed between subsp. tuberosum and subsp. andigena. Key words: Phytophthora infestans, late blight resistance, diagnostic markers, Solanum tuberosum subsp. andigena.application/mswordspaUniversidad Nacional de Colombiahttp://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/27917Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de Biotecnología; Vol. 13, núm. 2 (2011); 51-62 1909-8758 0123-3475Juyó, D. K. and Gerena, H. N and Mosquera, Teresa (2011) Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploides. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 13, núm. 2 (2011); 51-62 1909-8758 0123-3475 .Evaluación de marcadores moleculares asociados con resistencia a gota (phytophthora infestans l.) en papas diploides y tetraploidesArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTPhytophthora infestansresistencia a gotamarcadores diagnósticoSolanum tuberosum subsp. AndigenaORIGINAL27917-100980-1-PB.pdfapplication/pdf1887990https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/39371/1/27917-100980-1-PB.pdf51f3806a6b04e345b42f945e03c83f3cMD5127917-98900-1-PB.docxapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document347230https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/39371/2/27917-98900-1-PB.docxec261bbcb8f869b0969007c9b347c7a4MD52THUMBNAIL27917-100980-1-PB.pdf.jpg27917-100980-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7726https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/39371/3/27917-100980-1-PB.pdf.jpga7264ce9573cfd0df118630256276f0cMD53unal/39371oai:repositorio.unal.edu.co:unal/393712024-01-19 23:08:25.632Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co