Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de b-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos

El seguimiento epidemiológico y farmacológico de la resistencia a antibióticos b-lactámicos mediada por la presencia de b-lactamasas requiere identificación precisa, lo cual es posible mediante la secuencia del gen, que es identificado con herramientas bioinformáticas que se incorporan a sistemas de información. Para implementar un prototipo de sistema de información que permite clasificar secuencias de genes de b-lactamasas producidas por microorganismos resistentes aislados en hospitales y realizar su cruce con los datos clínicos, se obtuvieron las secuencias de b-lactamasas reportadas a escala mundial en la base de datos Uniprot utilizando el sistema de recuperación de secuencias (SRS) del Instituto Europeo de Bioinformática (EBI), se diseñó un sistema de datos moleculares y clínicos usando “Unified Modeling Languageâ€� (UML), y se generó un modelo implementado en un servidor con sistema operativo UNIX, gestor de bases de datos MySQL para realizar la creación de la base de datos y lenguajes de programación Perl y PHP para implementar programas y cruzar datos. El sistema de información BLA_ID_CLINIC permite hacer el cruce de datos moleculares y clínicos, de tal forma que se puedan identificar las b-lactamasas de microorganismos resistentes en hospitales y hacer un seguimiento del manejo de los antibióticos y el comportamiento epidemiológico, modelo bioinformático permanentemente actualizado, disponible a través de Internet en http://bioinf.ibun.unal.edu.oc/BLA_ID_CLINIC.

• Autores: Barreto Hernandez, Emiliano; Reguero Reza, María Teresa
• Tipo de recurso: Article of journal
• Fecha de publicación: 2007
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/22852
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/22852; http://bdigital.unal.edu.co/13887/
• Palabra clave: Bioinformatics; beta-lactamases; classification; information system; Bioinformática; beta-lactamasas; identificación; sistema de información.
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional