Asociación de los alelos de HLA con la persistencia, depuración y reinfección de tipos de Virus del Papiloma Humano de alto riesgo
Este trabajo tuvo como objetivo identificar los alelos y haplotipos HLA-DRB1 y DQB1 relacionados con la persistencia, depuración y redetección de 6 tipos de VPH de alto riesgo (VPH-AR) (-16, -18, -31, -33, -45 y -58) en una cohorte de mujeres colombianas. A partir de muestras de cérvix de 276 mujere...
- Autores:
-
Del Río Ospina, Luisa Fernanda
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/76313
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76313
http://bdigital.unal.edu.co/72568/
- Palabra clave:
- Virus del Papiloma Humano
Depuración
Redetección
DRB1
DQB1
Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento
Human Papilomavirus
Clearance
Redetection
Next Generation Sequencing
- Rights
- openAccess
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Virus del Papiloma Humano Depuración Redetección DRB1 DQB1 Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Human Papilomavirus Clearance Redetection Next Generation Sequencing |
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Este trabajo tuvo como objetivo identificar los alelos y haplotipos HLA-DRB1 y DQB1 relacionados con la persistencia, depuración y redetección de 6 tipos de VPH de alto riesgo (VPH-AR) (-16, -18, -31, -33, -45 y -58) en una cohorte de mujeres colombianas. A partir de muestras de cérvix de 276 mujeres, se realizó la tipificación de los loci DRB1 y DQB1 mediante el sistema MiSeq-Illumina. Se estimó la probabilidad de depuración y redetección en función del tiempo para cada uno de los 6 tipos de VPH-AR, con el método de Kaplan Meier. Se ajustaron modelos de supervivencia para identificar los alelos y haplotipos relacionados con la depuración y redetección teniendo en cuenta otras covariables. Se encontraron, para DRB1, 47 asociaciones (20 alelos), para DQB1, 6 asociaciones (3 alelos) y para los haplotipos, 87 asociaciones (34 haplotipos) con la depuración/persistencia de VPH. Con respecto a la redetección, 45 asociaciones de alelos DRB1 (23 alelos), 6 asociaciones para DQB1 (3 alelos) y 64 asociaciones, de 36 haplotipos, fueron identificadas. Se encontraron asociaciones tanto a favor como en contra de los eventos analizados, siendo algunas consistentes entre los tipos de VPH infectantes y otras diferentes. El efecto de los alelos y haplotipos de HLA sobre el curso clínico de las infecciones de VPH (depuración, persistencia y redetección viral) es dependiente del tipo de VPH responsable de la infección. El efecto independiente de algunos alelos fue consistente al configurar los haplotipos, mientras que para otros se observó una modificación del efecto. |
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